More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3959 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3959  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 276 aa  558  1e-158  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05952  ABC amino acid transporter periplasmic ligand binding protein  50.18 
 
 		 272 aa  284  1.0000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000216  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  49.09 
 
 		 272 aa  279  4e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.909844  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0477  extracellular solute-binding protein family 3  48.55 
 
 		 278 aa  278  5e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.225572 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2685  extracellular solute-binding protein family 3  52.78 
 
 		 288 aa  273  3e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0288477 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0202  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  52.52 
 
 		 278 aa  270  2e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.55601  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0445  extracellular solute-binding protein  49.15 
 
 		 266 aa  261  1e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2597  extracellular solute-binding protein family 3  47.56 
 
 		 270 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00189611  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3070  extracellular solute-binding protein  47.15 
 
 		 273 aa  251  9.000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.966648  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2287  extracellular solute-binding protein  46.25 
 
 		 261 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.268829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0124  extracellular solute-binding protein family 3  35.42 
 
 		 266 aa  174  9.999999999999999e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3696  extracellular solute-binding protein  36.03 
 
 		 268 aa  172  3.9999999999999995e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589095  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1818  extracellular solute-binding protein family 3  35.83 
 
 		 273 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0079129  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2022  extracellular solute-binding protein  35.83 
 
 		 272 aa  155  6e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.167722  normal  0.899953 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2490  extracellular solute-binding protein family 3  33.45 
 
 		 273 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5815  putative ABC transporter binding protein subunit  31.64 
 
 		 266 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.387818  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1344  extracellular solute-binding protein family 3  33.2 
 
 		 272 aa  150  2e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.752805 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1385  extracellular solute-binding protein  34.09 
 
 		 271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00529871  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67050  putative binding protein component of ABC transporter  31.99 
 
 		 266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5024  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.41 
 
 		 266 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.258075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4898  extracellular solute-binding protein  32.02 
 
 		 266 aa  141  9e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.733781 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5074  extracellular solute-binding protein  32.02 
 
 		 266 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.599311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0441  extracellular solute-binding protein  32.71 
 
 		 266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0375  extracellular solute-binding protein  32.4 
 
 		 265 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0814  extracellular solute-binding protein  32.34 
 
 		 268 aa  122  7e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00687374  normal  0.141124 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2075  extracellular solute-binding protein  33.62 
 
 		 280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1295  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  40.29 
 
 		 267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.397869 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  28.41 
 
 		 266 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  28.41 
 
 		 285 aa  108  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0325  extracellular solute-binding protein  30.12 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0295  ABC basic amino acid transporter, periplasmic binding protein  29.84 
 
 		 266 aa  106  3e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.874401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  28.62 
 
 		 266 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  28.62 
 
 		 266 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  28.68 
 
 		 265 aa  106  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  27.51 
 
 		 266 aa  106  5e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  27.51 
 
 		 266 aa  106  5e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1562  extracellular solute-binding protein  33.05 
 
 		 261 aa  105  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.470134  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2588  extracellular solute-binding protein  43.94 
 
 		 270 aa  105  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  27.51 
 
 		 285 aa  105  7e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  27.51 
 
 		 266 aa  105  7e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  27.51 
 
 		 266 aa  105  9e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  27.88 
 
 		 266 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  27.88 
 
 		 266 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  27.88 
 
 		 266 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0251  cystine transporter subunit  27.38 
 
 		 264 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  27.14 
 
 		 264 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2649  extracellular solute-binding protein  26.97 
 
 		 266 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0458  extracellular solute-binding protein  26.97 
 
 		 266 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357598  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1651  cyclohexadienyl dehydratase precursor  27.59 
 
 		 268 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0227  cystine transporter subunit  26.98 
 
 		 264 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00670463 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  26.88 
 
 		 265 aa  103  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0433  extracellular solute-binding protein  26.97 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980273  hitchhiker  0.00000000179971 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0296  ABC basic amino acid transporter, periplasmic binding protein  27.93 
 
 		 309 aa  103  4e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.511931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3548  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  26.97 
 
 		 266 aa  103  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0242  cystine transporter subunit  28.57 
 
 		 264 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.310723 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1377  extracellular solute-binding protein  26.27 
 
 		 277 aa  102  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000115158  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0382  extracellular solute-binding protein  26.36 
 
 		 266 aa  102  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0366  extracellular solute-binding protein  26.36 
 
 		 266 aa  102  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0588118  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2763  extracellular solute-binding protein  31.88 
 
 		 248 aa  102  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.219891  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0351  extracellular solute-binding protein  26.97 
 
 		 266 aa  102  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00865  arginine transporter subunit  29.02 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2736  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  29.02 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0318086  normal  0.950747 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0932  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  29.02 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0888  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  29.02 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.214233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0964  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  29.02 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4985  cystine transporter subunit  27.49 
 
 		 264 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.916643 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00871  hypothetical protein  29.02 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2782  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  29.02 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0257892  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0904  glutamine-binding periplasmic protein  27.44 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.207514  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0326  extracellular solute-binding protein  26.15 
 
 		 310 aa  100  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2471  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  28.57 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.198291  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1835  extracellular solute-binding protein family 3  28.51 
 
 		 262 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0545252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1019  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  28.57 
 
 		 243 aa  100  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.211484 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0032  extracellular solute-binding protein  32.31 
 
 		 276 aa  100  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.427857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6380  extracellular solute-binding protein  27.13 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6211  extracellular solute-binding protein  27.13 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2214  extracellular solute-binding protein  29.26 
 
 		 268 aa  100  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6613  extracellular solute-binding protein  27.13 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0305717 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0282  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.6 
 
 		 250 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0338349  hitchhiker  0.000164452 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2066  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  27.34 
 
 		 258 aa  99.8  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5481  extracellular solute-binding protein  40.34 
 
 		 270 aa  100  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1196  amino acid-binding protein  28.88 
 
 		 256 aa  99.8  4e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.166337  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0244  cystine transporter subunit  27.34 
 
 		 266 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136857  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4248  extracellular solute-binding protein  28.14 
 
 		 266 aa  99.8  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0312845 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2056  extracellular solute-binding protein family 3  27.6 
 
 		 257 aa  99.8  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00137642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3585  extracellular solute-binding protein  39.64 
 
 		 266 aa  99.4  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0327  extracellular solute-binding protein  36.88 
 
 		 305 aa  99.4  6e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  26.46 
 
 		 265 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0836  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  41.13 
 
 		 266 aa  98.2  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0996489 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2074  extracellular solute-binding protein  32.69 
 
 		 277 aa  98.2  1e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  30.18 
 
 		 246 aa  97.4  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5180  cystine ABC transporter, periplasmic cystine binding protein  27.67 
 
 		 268 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1022  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtJ  27.68 
 
 		 243 aa  96.3  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.186752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0959  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtJ  27.68 
 
 		 243 aa  96.3  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  25.1 
 
 		 266 aa  96.3  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1041  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtJ  27.68 
 
 		 243 aa  96.3  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.385191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0991  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtJ  27.68 
 
 		 243 aa  96.3  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0924  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  27.68 
 
 		 243 aa  96.3  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0338236  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  25.1 
 
 		 266 aa  96.3  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  25.1 
 
 		 266 aa  96.3  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>