More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1651 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1651  cyclohexadienyl dehydratase precursor  100 
 
 		 268 aa  556  1e-157  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19140  cyclohexadienyl dehydratase precursor  90.3 
 
 		 268 aa  479  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.288191  normal  0.371616 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2512  putative cyclohexadienyl dehydratase precursor signal peptide protein  64.82 
 
 		 267 aa  357  9.999999999999999e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.204589  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2375  Arogenate dehydratase  63.87 
 
 		 271 aa  344  1e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.380609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2779  Arogenate dehydratase  63.98 
 
 		 270 aa  342  2.9999999999999997e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4123  cyclohexadienyl dehydratase  56.52 
 
 		 263 aa  307  9e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0829887  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0286  prephenate dehydratase  60.87 
 
 		 256 aa  300  2e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.936099 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3964  cyclohexadienyl dehydratase  52.69 
 
 		 261 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3021  cyclohexadienyl dehydratase  52.69 
 
 		 261 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.329674  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4037  cyclohexadienyl dehydratase  52.69 
 
 		 261 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0172  cyclohexadienyl dehydratase  52.69 
 
 		 261 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3350  cyclohexadienyl dehydratase  52.69 
 
 		 261 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1581  cyclohexadienyl dehydratase  52.69 
 
 		 261 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2961  cyclohexadienyl dehydratase  52.69 
 
 		 261 aa  289  4e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3305  cyclohexadienyl dehydratase  52.53 
 
 		 264 aa  284  8e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3291  cyclohexadienyl dehydratase  54.51 
 
 		 266 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.87694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0111  prephenate dehydratase  53.65 
 
 		 258 aa  270  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.669855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0125  arogenate dehydratase  54.08 
 
 		 270 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0100  prephenate dehydratase  53.22 
 
 		 270 aa  268  5e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688966  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2945  prephenate dehydratase  53.65 
 
 		 270 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0273907  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0110  prephenate dehydratase  53.65 
 
 		 270 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.433262  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0109  arogenate dehydratase  53.22 
 
 		 270 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.224766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3024  arogenate dehydratase  47.89 
 
 		 260 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3891  Arogenate dehydratase  50.21 
 
 		 265 aa  264  8.999999999999999e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0043  cyclohexadienyl dehydratase  50.42 
 
 		 265 aa  262  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1151  prephenate dehydratase  51 
 
 		 263 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4214  cyclohexadienyl dehydratase  43.77 
 
 		 273 aa  248  6e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1335  cyclohexadienyl dehydratase, putative  49.2 
 
 		 263 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3814  cyclohexadienyl dehydratase  47.18 
 
 		 284 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.607683  normal  0.874975 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3744  chorismate mutase, putative  48.92 
 
 		 421 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117732  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4447  arogenate dehydratase  46.31 
 
 		 255 aa  242  6e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.393788 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4767  Prephenate dehydratase  44.64 
 
 		 266 aa  240  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.678819  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0706  Prephenate dehydratase  46.77 
 
 		 255 aa  239  2.9999999999999997e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0738  Prephenate dehydratase  45.71 
 
 		 255 aa  238  1e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4388  extracellular solute-binding protein family 3  48.05 
 
 		 246 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0614  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  43.6 
 
 		 256 aa  219  3e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2737  arogenate dehydratase  47.37 
 
 		 256 aa  204  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47143  normal  0.0178074 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2470  cyclohexadienyl dehydratase  39.91 
 
 		 260 aa  179  4e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00435864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1534  extracellular solute-binding protein  39.64 
 
 		 253 aa  167  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.195786  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3412  arogenate dehydratase  39.74 
 
 		 254 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.40472  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3279  polar amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  39.74 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0941  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  39.32 
 
 		 254 aa  166  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0934769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0714  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  35.5 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0236853 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00417  prephrenate dehydratase  28.98 
 
 		 258 aa  124  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002034  cyclohexadienyl dehydratase  29.02 
 
 		 258 aa  122  6e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1344  extracellular solute-binding protein family 3  27.54 
 
 		 272 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.752805 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2597  extracellular solute-binding protein family 3  26.36 
 
 		 270 aa  117  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00189611  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2685  extracellular solute-binding protein family 3  28.45 
 
 		 288 aa  115  6e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0288477 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3070  extracellular solute-binding protein  27 
 
 		 273 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.966648  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2287  extracellular solute-binding protein  26.89 
 
 		 261 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.268829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0445  extracellular solute-binding protein  27.73 
 
 		 266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0477  extracellular solute-binding protein family 3  26.14 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.225572 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000216  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  27.9 
 
 		 272 aa  109  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.909844  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0124  extracellular solute-binding protein family 3  27.52 
 
 		 266 aa  108  7.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1385  extracellular solute-binding protein  26.48 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00529871  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05952  ABC amino acid transporter periplasmic ligand binding protein  28.19 
 
 		 272 aa  107  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0202  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.63 
 
 		 278 aa  106  4e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.55601  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1818  extracellular solute-binding protein family 3  26.64 
 
 		 273 aa  106  4e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0079129  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2022  extracellular solute-binding protein  25.53 
 
 		 272 aa  105  9e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.167722  normal  0.899953 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  25.78 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3696  extracellular solute-binding protein  26.46 
 
 		 268 aa  103  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589095  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3959  extracellular solute-binding protein  27.09 
 
 		 276 aa  101  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  30.21 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  30.21 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67050  putative binding protein component of ABC transporter  25.77 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  30.21 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  25.78 
 
 		 266 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  27.84 
 
 		 266 aa  99.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  25.78 
 
 		 285 aa  99.4  6e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  26.56 
 
 		 266 aa  99  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  25.78 
 
 		 266 aa  98.6  9e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  25.78 
 
 		 266 aa  98.6  9e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5815  putative ABC transporter binding protein subunit  25.77 
 
 		 266 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.387818  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  25.78 
 
 		 285 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  25.78 
 
 		 266 aa  98.2  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0736  extracellular solute-binding protein  32.44 
 
 		 279 aa  98.2  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.580874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  26.17 
 
 		 266 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  26.17 
 
 		 266 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  26.17 
 
 		 266 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2490  extracellular solute-binding protein family 3  25.78 
 
 		 273 aa  97.4  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  25.78 
 
 		 266 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1872  extracellular solute-binding protein  32.76 
 
 		 306 aa  95.1  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0244  cystine transporter subunit  28.42 
 
 		 266 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136857  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  29.69 
 
 		 265 aa  94  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  28.19 
 
 		 265 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5180  cystine ABC transporter, periplasmic cystine binding protein  29.26 
 
 		 268 aa  92  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  29.32 
 
 		 265 aa  92  9e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1295  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.17 
 
 		 267 aa  91.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.397869 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0441  extracellular solute-binding protein  24.43 
 
 		 266 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0782  extracellular solute-binding protein  30.13 
 
 		 269 aa  91.3  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211491 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0227  cystine transporter subunit  28.14 
 
 		 264 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00670463 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0242  cystine transporter subunit  28.14 
 
 		 264 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.310723 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0251  cystine transporter subunit  27.54 
 
 		 264 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4985  cystine transporter subunit  27.27 
 
 		 264 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.916643 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1377  extracellular solute-binding protein  25.63 
 
 		 277 aa  89.4  6e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000115158  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0375  extracellular solute-binding protein  23.08 
 
 		 265 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5481  extracellular solute-binding protein  27.41 
 
 		 270 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  27.73 
 
 		 257 aa  87.4  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1294  extracellular solute-binding protein family 3  26.89 
 
 		 263 aa  87.8  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0278324  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2908  cystine transporter subunit  27.59 
 
 		 265 aa  86.7  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.647057  normal  0.0539473 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>