More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_3744 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_3744  chorismate mutase, putative  100 
 
 		 421 aa  872    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117732  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1651  cyclohexadienyl dehydratase precursor  48.92 
 
 		 268 aa  242  7e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19140  cyclohexadienyl dehydratase precursor  48.48 
 
 		 268 aa  240  4e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.288191  normal  0.371616 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2375  Arogenate dehydratase  45.22 
 
 		 271 aa  226  8e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.380609  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2512  putative cyclohexadienyl dehydratase precursor signal peptide protein  45.65 
 
 		 267 aa  225  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.204589  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2779  Arogenate dehydratase  45.22 
 
 		 270 aa  225  1e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4123  cyclohexadienyl dehydratase  44.54 
 
 		 263 aa  210  5e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0829887  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0286  prephenate dehydratase  44.59 
 
 		 256 aa  203  5e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.936099 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3021  cyclohexadienyl dehydratase  41.57 
 
 		 261 aa  200  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.329674  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0172  cyclohexadienyl dehydratase  41.57 
 
 		 261 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3964  cyclohexadienyl dehydratase  41.57 
 
 		 261 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4037  cyclohexadienyl dehydratase  41.57 
 
 		 261 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3350  cyclohexadienyl dehydratase  41.57 
 
 		 261 aa  200  3e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1581  cyclohexadienyl dehydratase  41.57 
 
 		 261 aa  200  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0100  prephenate dehydratase  43.53 
 
 		 270 aa  200  5e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688966  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2961  cyclohexadienyl dehydratase  41.18 
 
 		 261 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0111  prephenate dehydratase  42.67 
 
 		 258 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.669855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3291  cyclohexadienyl dehydratase  43.1 
 
 		 266 aa  197  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.87694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2945  prephenate dehydratase  43.53 
 
 		 270 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0273907  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0109  arogenate dehydratase  43.53 
 
 		 270 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.224766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0125  arogenate dehydratase  43.53 
 
 		 270 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0110  prephenate dehydratase  43.53 
 
 		 270 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.433262  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3305  cyclohexadienyl dehydratase  43.04 
 
 		 264 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0043  cyclohexadienyl dehydratase  43.1 
 
 		 265 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3024  arogenate dehydratase  43.53 
 
 		 260 aa  196  9e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4767  Prephenate dehydratase  42.24 
 
 		 266 aa  195  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.678819  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3891  Arogenate dehydratase  43.1 
 
 		 265 aa  195  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4447  arogenate dehydratase  42.24 
 
 		 255 aa  188  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.393788 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4214  cyclohexadienyl dehydratase  40.52 
 
 		 273 aa  186  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4388  extracellular solute-binding protein family 3  42.45 
 
 		 246 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0738  Prephenate dehydratase  42.24 
 
 		 255 aa  184  3e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1151  prephenate dehydratase  39.92 
 
 		 263 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0706  Prephenate dehydratase  40.95 
 
 		 255 aa  177  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1335  cyclohexadienyl dehydratase, putative  39.11 
 
 		 263 aa  177  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3814  cyclohexadienyl dehydratase  40.52 
 
 		 284 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.607683  normal  0.874975 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2737  arogenate dehydratase  41.78 
 
 		 256 aa  169  8e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47143  normal  0.0178074 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0614  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  39.19 
 
 		 256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3412  arogenate dehydratase  37.2 
 
 		 254 aa  134  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.40472  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0941  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  36.71 
 
 		 254 aa  134  3.9999999999999996e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0934769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3279  polar amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  36.71 
 
 		 256 aa  133  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2470  cyclohexadienyl dehydratase  38.1 
 
 		 260 aa  130  5.0000000000000004e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00435864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1534  extracellular solute-binding protein  36.69 
 
 		 253 aa  129  7.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.195786  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0714  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  33.33 
 
 		 256 aa  116  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0236853 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3147  chorismate mutase  38.15 
 
 		 185 aa  95.1  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.973197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00417  prephrenate dehydratase  27.8 
 
 		 258 aa  94.7  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002034  cyclohexadienyl dehydratase  28.12 
 
 		 258 aa  91.3  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0124  extracellular solute-binding protein family 3  25.43 
 
 		 266 aa  83.2  0.000000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  29.9 
 
 		 265 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000216  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  23.42 
 
 		 272 aa  77.4  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.909844  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2074  chorismate mutase  37.12 
 
 		 176 aa  76.3  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  25.33 
 
 		 266 aa  74.3  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  25.33 
 
 		 266 aa  74.3  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  25.33 
 
 		 266 aa  74.3  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0227  cystine transporter subunit  27.87 
 
 		 264 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00670463 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3618  chorismate mutase  33.71 
 
 		 176 aa  72.4  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.549498  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0244  cystine transporter subunit  26.79 
 
 		 266 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136857  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2649  extracellular solute-binding protein  24.27 
 
 		 266 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0458  extracellular solute-binding protein  24.27 
 
 		 266 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357598  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3495  chorismate mutase  36.42 
 
 		 176 aa  71.2  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0251  cystine transporter subunit  27.32 
 
 		 264 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0242  cystine transporter subunit  27.32 
 
 		 264 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.310723 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0351  extracellular solute-binding protein  24.69 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0678  chorismate mutase  33.33 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.826511 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1295  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.17 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.397869 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1385  extracellular solute-binding protein  26.07 
 
 		 271 aa  70.5  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00529871  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4985  cystine transporter subunit  25.33 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.916643 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2624  chorismate mutase  40 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2709  chorismate mutase  40 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.749579  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  27.22 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1584  chorismate mutase  40 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0202  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.36 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.55601  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0433  extracellular solute-binding protein  23.85 
 
 		 266 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980273  hitchhiker  0.00000000179971 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0477  extracellular solute-binding protein family 3  26.63 
 
 		 278 aa  69.7  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.225572 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3548  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  23.85 
 
 		 266 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.233102 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  25.11 
 
 		 285 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05952  ABC amino acid transporter periplasmic ligand binding protein  22.45 
 
 		 272 aa  68.6  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1872  extracellular solute-binding protein  31.21 
 
 		 306 aa  68.2  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  25.11 
 
 		 266 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2685  extracellular solute-binding protein family 3  22.13 
 
 		 288 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0288477 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4924  extracellular solute-binding protein  25.31 
 
 		 261 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00263703 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2649  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  25.42 
 
 		 269 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5481  extracellular solute-binding protein  28 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0814  extracellular solute-binding protein  23.42 
 
 		 268 aa  67.8  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00687374  normal  0.141124 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5180  cystine ABC transporter, periplasmic cystine binding protein  27.37 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  25.11 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0382  extracellular solute-binding protein  23.43 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0366  extracellular solute-binding protein  23.43 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0588118  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  25.11 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  25.11 
 
 		 266 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  25 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3585  extracellular solute-binding protein  24.31 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  24.66 
 
 		 266 aa  66.2  0.0000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1344  extracellular solute-binding protein family 3  24.89 
 
 		 272 aa  66.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.752805 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  24.66 
 
 		 285 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0736  extracellular solute-binding protein  29.48 
 
 		 279 aa  65.5  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.580874  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0529  hypothetical protein  25.12 
 
 		 244 aa  65.5  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2879  putative amino acid binding protein  28.57 
 
 		 263 aa  65.1  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.336803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0445  extracellular solute-binding protein  22.75 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0553  hypothetical protein  26.57 
 
 		 244 aa  65.1  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1377  extracellular solute-binding protein  26.16 
 
 		 277 aa  65.1  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000115158  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>