42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3618 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3618  chorismate mutase  100 
 
 
176 aa  362  2e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.549498  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3495  chorismate mutase  75.43 
 
 
176 aa  275  2e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2074  chorismate mutase  58.58 
 
 
176 aa  195  3e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2624  chorismate mutase  45.61 
 
 
186 aa  152  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1584  chorismate mutase  45.61 
 
 
186 aa  152  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2709  chorismate mutase  45.61 
 
 
186 aa  152  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.749579  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1325  chorismate mutase  39.13 
 
 
185 aa  117  7.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.17523  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3009  chorismate mutase  38.18 
 
 
185 aa  117  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3147  chorismate mutase  37.87 
 
 
185 aa  106  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.973197  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1896  chorismate mutase  36.47 
 
 
180 aa  106  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1358  chorismate mutase  33.89 
 
 
181 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000159467  normal  0.435171 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1374  chorismate mutase  33.89 
 
 
181 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000188427  hitchhiker  0.000120257 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2093  chorismate mutase  33.89 
 
 
181 aa  99.8  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00333633  hitchhiker  0.000000577582 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1390  chorismate mutase  33.89 
 
 
181 aa  98.6  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00284187  normal  0.322204 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1912  chorismate mutase  33.33 
 
 
181 aa  97.4  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125735  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3744  chorismate mutase, putative  33.71 
 
 
421 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117732  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0678  chorismate mutase  34.55 
 
 
207 aa  57  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.826511 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2391  chorismate mutase  32.8 
 
 
196 aa  53.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4115  chorismate mutase  31.82 
 
 
197 aa  51.6  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000003876  normal  0.458785 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1764  chorismate mutase  49.09 
 
 
163 aa  51.2  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0189067  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0879  chorismate mutase  31.82 
 
 
197 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.512068  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3544  chorismate mutase  34.55 
 
 
202 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0867  chorismate mutase  27.52 
 
 
197 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00756442  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0529  chorismate mutase  30.91 
 
 
197 aa  49.3  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0728632  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1007  chorismate mutase  30.91 
 
 
197 aa  49.3  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000012767  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0967  chorismate mutase  30.91 
 
 
197 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000119037  normal  0.243977 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4921  chorismate mutase, putative  29.01 
 
 
180 aa  47.8  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0357  chorismate mutase  28.12 
 
 
185 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3076  chorismate mutase  30.91 
 
 
198 aa  45.1  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.359714  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0915  chorismate mutase  32 
 
 
198 aa  43.9  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4818  chorismate mutase  29.1 
 
 
185 aa  43.9  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11913  chorismate mutase  31.54 
 
 
199 aa  43.5  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03115  chorismate mutase  36.36 
 
 
177 aa  42.4  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0483  chorismate mutase  30.97 
 
 
191 aa  42  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3039  chorismate mutase  30.57 
 
 
205 aa  41.6  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000151521  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1006  chorismate mutase  30.57 
 
 
189 aa  41.6  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2635  chorismate mutase  30.57 
 
 
189 aa  41.6  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3005  chorismate mutase  30.57 
 
 
189 aa  41.6  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.148314  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0141  chorismate mutase  30.57 
 
 
189 aa  41.6  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.909183  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0480  chorismate mutase  30.57 
 
 
197 aa  41.6  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.769814  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2939  chorismate mutase  30.57 
 
 
189 aa  40.8  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000062955  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0422  chorismate mutase  30.97 
 
 
191 aa  40.8  0.01  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>