44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3009 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3009  chorismate mutase  100 
 
 		 185 aa  384  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1325  chorismate mutase  93.51 
 
 		 185 aa  363  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.17523  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2074  chorismate mutase  39.51 
 
 		 176 aa  134  9e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3495  chorismate mutase  40.76 
 
 		 176 aa  120  8e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3618  chorismate mutase  38.18 
 
 		 176 aa  117  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.549498  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3147  chorismate mutase  36.02 
 
 		 185 aa  108  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.973197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2624  chorismate mutase  34.83 
 
 		 186 aa  108  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1584  chorismate mutase  34.83 
 
 		 186 aa  108  5e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2709  chorismate mutase  34.83 
 
 		 186 aa  108  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.749579  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1896  chorismate mutase  38.12 
 
 		 180 aa  103  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1374  chorismate mutase  36.99 
 
 		 181 aa  100  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000188427  hitchhiker  0.000120257 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1358  chorismate mutase  36.99 
 
 		 181 aa  100  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000159467  normal  0.435171 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1912  chorismate mutase  36.99 
 
 		 181 aa  97.8  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125735  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2093  chorismate mutase  36.99 
 
 		 181 aa  97.8  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00333633  hitchhiker  0.000000577582 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1390  chorismate mutase  36.99 
 
 		 181 aa  97.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00284187  normal  0.322204 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0879  chorismate mutase  30.28 
 
 		 197 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.512068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0867  chorismate mutase  30.28 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00756442  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4115  chorismate mutase  30.84 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000003876  normal  0.458785 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3744  chorismate mutase, putative  27.96 
 
 		 421 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117732  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0678  chorismate mutase  27.05 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.826511 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2391  chorismate mutase  28.33 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0529  chorismate mutase  27.88 
 
 		 197 aa  52  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0728632  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1007  chorismate mutase  27.88 
 
 		 197 aa  52  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000012767  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0967  chorismate mutase  27.88 
 
 		 197 aa  51.2  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000119037  normal  0.243977 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0357  chorismate mutase  33.33 
 
 		 185 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4921  chorismate mutase, putative  29.91 
 
 		 180 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1596  chorismate mutase  26.09 
 
 		 202 aa  48.5  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000122178  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0141  chorismate mutase  26.09 
 
 		 189 aa  48.1  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.909183  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3005  chorismate mutase  26.09 
 
 		 189 aa  48.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.148314  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1006  chorismate mutase  26.09 
 
 		 189 aa  48.1  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2635  chorismate mutase  26.09 
 
 		 189 aa  48.1  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0480  chorismate mutase  26.09 
 
 		 197 aa  47.8  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.769814  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3039  chorismate mutase  26.09 
 
 		 205 aa  47.8  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000151521  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2939  chorismate mutase  26.09 
 
 		 189 aa  47.8  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000062955  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4818  chorismate mutase  33.33 
 
 		 185 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1570  chorismate mutase  31.07 
 
 		 234 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0840576  hitchhiker  0.0000751534 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0915  chorismate mutase  25.69 
 
 		 198 aa  45.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11913  chorismate mutase  30.67 
 
 		 199 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3783  chorismate mutase  26.72 
 
 		 199 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3076  chorismate mutase  24.77 
 
 		 198 aa  43.5  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.359714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4860  chorismate mutase  26.72 
 
 		 199 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.89966 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01713  chorismate mutase/prephenate dehydratase  40.74 
 
 		 393 aa  43.1  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.342812  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0026  chorismate mutase  29.58 
 
 		 96 aa  42  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.630084  normal  0.0206275 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3232  chorismate mutase  29.27 
 
 		 93 aa  41.6  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>