More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01713 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01713  chorismate mutase/prephenate dehydratase  100 
 
 		 393 aa  809    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.342812  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1590  chorismate mutase  79.39 
 
 		 399 aa  658    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1221  chorismate mutase/prephenate dehydratase  58.49 
 
 		 391 aa  472  1e-132  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0235  chorismate mutase/prephenate dehydratase  58.51 
 
 		 391 aa  459  9.999999999999999e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0661  P-protein (includes: chorismate mutase and prephenate dehydratase)  58.12 
 
 		 391 aa  454  1.0000000000000001e-126  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.026643  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0999  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  57.03 
 
 		 393 aa  445  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004398  chorismate mutase I/prephenate dehydratase  58.35 
 
 		 392 aa  444  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2853  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  58.03 
 
 		 393 aa  443  1e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2747  chorismate mutase  56.17 
 
 		 662 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1059  chorismate mutase  56.17 
 
 		 657 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.850871  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01001  chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  58.35 
 
 		 392 aa  440  9.999999999999999e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1133  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  56.1 
 
 		 386 aa  441  9.999999999999999e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.898271  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3146  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  55.58 
 
 		 386 aa  436  1e-121  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.831222  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0898  prephenate dehydratase / chorismate mutase / phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  56.22 
 
 		 659 aa  437  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.983271 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1177  chorismate mutase  54.92 
 
 		 659 aa  432  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1297  chorismate mutase  55.18 
 
 		 664 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1264  chorismate mutase  55.18 
 
 		 664 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.728983  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1220  chorismate mutase  54.92 
 
 		 664 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.950276  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3093  chorismate mutase  55.18 
 
 		 664 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0115511 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2828  prephenate dehydratase / chorismate mutase  54.92 
 
 		 667 aa  431  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2910  prephenate dehydratase / chorismate mutase  54.92 
 
 		 667 aa  432  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2913  chorismate mutase  55.18 
 
 		 648 aa  434  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3007  chorismate mutase / prephenate dehydratase  54.92 
 
 		 667 aa  431  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1367  chorismate mutase/prephenate dehydratase  54.66 
 
 		 671 aa  429  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1072  chorismate mutase  55.12 
 
 		 654 aa  430  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3077  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  54.69 
 
 		 396 aa  419  1e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0866115  normal  0.0319555 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02488  fused chorismate mutase P/prephenate dehydratase  54.43 
 
 		 386 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.610433  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1075  chorismate mutase  54.43 
 
 		 386 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1084  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  54.43 
 
 		 386 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.165593  hitchhiker  0.00000412255 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2751  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  54.69 
 
 		 386 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000608431  normal  0.0711319 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2883  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  54.43 
 
 		 386 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0920297  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3355  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  55.47 
 
 		 385 aa  417  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02452  hypothetical protein  54.43 
 
 		 386 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.699641  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2756  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  54.43 
 
 		 386 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  8.8068e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2986  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  54.43 
 
 		 386 aa  415  9.999999999999999e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000154451  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3838  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  54.43 
 
 		 386 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000574807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3218  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  55.47 
 
 		 385 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.631051  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3482  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  55.47 
 
 		 385 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.335091 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0881  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  56.54 
 
 		 385 aa  416  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.304992  normal  0.0807055 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1168  chorismate mutase  55.64 
 
 		 662 aa  412  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1263  chorismate mutase  54.86 
 
 		 662 aa  410  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0015659 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0365  chorismate mutase / prephenate dehydratase  50 
 
 		 385 aa  399  9.999999999999999e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0036667  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2994  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  53.37 
 
 		 386 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2882  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  53.37 
 
 		 386 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.34961 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2880  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  53.37 
 
 		 386 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.151676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2861  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  53.37 
 
 		 386 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0154655 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2811  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  53.37 
 
 		 386 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1341  prephenate dehydratase  37.82 
 
 		 384 aa  273  3e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.409344  normal  0.126516 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0877  Prephenate dehydratase  38.65 
 
 		 288 aa  187  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0121  prephenate dehydratase  30.4 
 
 		 356 aa  187  3e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  32.71 
 
 		 356 aa  186  6e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  31.28 
 
 		 358 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0495  chorismate mutase  32 
 
 		 359 aa  182  9.000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0778684  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  32.45 
 
 		 382 aa  182  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2948  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.86 
 
 		 360 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1345  prephenate dehydratase  32.63 
 
 		 379 aa  181  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0950  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.86 
 
 		 360 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0432  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.86 
 
 		 360 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2997  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.86 
 
 		 360 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.379619  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  30.75 
 
 		 358 aa  181  2e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1635  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.6 
 
 		 360 aa  181  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2885  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.86 
 
 		 360 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.629426  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2575  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.86 
 
 		 360 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0198  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.86 
 
 		 360 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.75 
 
 		 358 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3006  chorismate mutase  33.86 
 
 		 360 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224868  normal  0.0525817 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  33.51 
 
 		 359 aa  180  4e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1313  chorismate mutase  31.9 
 
 		 359 aa  180  4e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.21838e-16 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2375  chorismate mutase  28 
 
 		 378 aa  179  9e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1250  chorismate mutase  30.91 
 
 		 382 aa  179  1e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149804  normal  0.0219371 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2858  chorismate mutase  30.53 
 
 		 373 aa  179  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.42066  hitchhiker  0.0000000270068 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1567  prephenate dehydratase  32.49 
 
 		 271 aa  178  1e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  33.24 
 
 		 359 aa  177  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0741  chorismate mutase  32.37 
 
 		 360 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0774  chorismate mutase  31.71 
 
 		 371 aa  178  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.561025  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0926  chorismate mutase / prephenate dehydratase  34.93 
 
 		 367 aa  176  5e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3724  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  34.68 
 
 		 632 aa  176  5e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0716  prephenate dehydratase / chorismate mutase  32.28 
 
 		 387 aa  176  6e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0845  chorismate mutase  31.44 
 
 		 371 aa  176  9e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0602148 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0977  prephenate dehydratase / chorismate mutase  33.33 
 
 		 360 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.23904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  30.65 
 
 		 364 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0961  chorismate mutase  32.9 
 
 		 374 aa  173  3.9999999999999995e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10160  monofunctional chorismate mutase, clade 2  31.56 
 
 		 403 aa  173  3.9999999999999995e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000617885  hitchhiker  0.000000765088 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2091  Chorismate mutase  36.43 
 
 		 280 aa  173  3.9999999999999995e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.746584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2261  chorismate mutase  34.31 
 
 		 360 aa  172  9e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.561054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3645  chorismate mutasea  29.4 
 
 		 364 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1887  chorismate mutase-P and prephenate dehydratase  32.18 
 
 		 360 aa  172  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000192693  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0951  chorismate mutase / prephenate dehydratase  31.82 
 
 		 365 aa  171  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.356586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1293  Prephenate dehydratase  36.96 
 
 		 293 aa  171  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.821795  normal  0.378721 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  30.1 
 
 		 365 aa  171  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0904  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.06 
 
 		 371 aa  171  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1747  chorismate mutase/prephenate dehydratase  29.13 
 
 		 364 aa  170  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0966339  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2192  chorismate mutase  31.43 
 
 		 355 aa  170  3e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1594  prephenate dehydratase  35 
 
 		 311 aa  169  8e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2793  chorismate mutase  31.4 
 
 		 360 aa  169  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163655 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4156  prephenate dehydratase / chorismate mutase  33.51 
 
 		 360 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0783  prephenate dehydratase  29.5 
 
 		 380 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1686  chorismate mutase / prephenate dehydratase  33.59 
 
 		 355 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2539  chorismate mutase  30.85 
 
 		 399 aa  167  4e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.409768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1881  prephenate dehydratase  34.39 
 
 		 298 aa  166  5.9999999999999996e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.858484 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>