More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1747 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1963  chorismate mutase  86.85 
 
 
365 aa  664    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  92.03 
 
 
367 aa  704    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1747  chorismate mutase/prephenate dehydratase  100 
 
 
364 aa  749    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0966339  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3645  chorismate mutasea  98.63 
 
 
364 aa  741    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734175  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  93.13 
 
 
364 aa  710    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  92.03 
 
 
364 aa  703    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0302882 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  92.03 
 
 
364 aa  704    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  92.58 
 
 
364 aa  706    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  87.67 
 
 
365 aa  667    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23280  chorismate mutase  86.85 
 
 
365 aa  665    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  89.01 
 
 
364 aa  687    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  70.6 
 
 
373 aa  540  9.999999999999999e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2147  prephenate dehydratase  68.42 
 
 
373 aa  500  1e-140  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.707843  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2858  chorismate mutase  61.71 
 
 
373 aa  469  1.0000000000000001e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.42066  hitchhiker  0.0000000270068 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1023  chorismate mutase  65.74 
 
 
365 aa  459  9.999999999999999e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1250  chorismate mutase  59.23 
 
 
382 aa  437  1e-121  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149804  normal  0.0219371 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0174  chorismate mutase  57.78 
 
 
361 aa  420  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1204  chorismate mutase  59.34 
 
 
393 aa  418  1e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.973222  normal  0.768195 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1538  chorismate mutase  59.18 
 
 
362 aa  418  1e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1207  chorismate mutase  57.38 
 
 
371 aa  419  1e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0297935 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1418  chorismate mutase/prephenate dehydratase  55.52 
 
 
362 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1186  prephenate dehydratase  58.79 
 
 
393 aa  416  9.999999999999999e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.343107 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00716  P-protein  51.53 
 
 
402 aa  385  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00262272  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3039  chorismate mutase  52.2 
 
 
355 aa  387  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0926  chorismate mutase / prephenate dehydratase  56.15 
 
 
367 aa  385  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1019  chorismate mutase  52.2 
 
 
358 aa  377  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.789998  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0897  chorismate mutase/prephenate dehydratase  52.2 
 
 
358 aa  377  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.255743  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0568  chorismate mutase  53.89 
 
 
362 aa  369  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2192  chorismate mutase  52.63 
 
 
355 aa  371  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1442  chorismate mutase  49.59 
 
 
374 aa  368  1e-100  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.105369  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1336  chorismate mutase  50.81 
 
 
413 aa  367  1e-100  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1497  P-protein (prephenate dehydratase / chorismate mutase)  49.04 
 
 
374 aa  364  1e-99  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554673  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1232  prephenate dehydratase  51.52 
 
 
363 aa  359  5e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.964016 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2539  chorismate mutase  49.03 
 
 
399 aa  354  1e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.409768  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0716  prephenate dehydratase / chorismate mutase  48.32 
 
 
387 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0774  chorismate mutase  48.16 
 
 
371 aa  353  4e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.561025  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0845  chorismate mutase  47.88 
 
 
371 aa  349  5e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0602148 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  48.6 
 
 
382 aa  348  6e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0904  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  48.43 
 
 
371 aa  347  2e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0951  chorismate mutase / prephenate dehydratase  48.88 
 
 
365 aa  345  8e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.356586  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1686  chorismate mutase / prephenate dehydratase  50.14 
 
 
355 aa  342  5e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1313  chorismate mutase  47.21 
 
 
359 aa  333  2e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  2.21838e-16 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0495  chorismate mutase  48.06 
 
 
359 aa  332  7.000000000000001e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0778684  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0977  prephenate dehydratase / chorismate mutase  49.3 
 
 
360 aa  328  6e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.23904  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1193  chorismate mutase  45.4 
 
 
366 aa  328  7e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0801  chorismate mutase  46.54 
 
 
359 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3006  chorismate mutase  49.3 
 
 
360 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224868  normal  0.0525817 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2885  chorismate mutase/prephenate dehydratase  48.18 
 
 
360 aa  327  3e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.629426  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0950  chorismate mutase/prephenate dehydratase  48.18 
 
 
360 aa  327  3e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0432  chorismate mutase/prephenate dehydratase  48.18 
 
 
360 aa  327  3e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2997  chorismate mutase/prephenate dehydratase  48.18 
 
 
360 aa  327  3e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.379619  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0198  chorismate mutase/prephenate dehydratase  48.18 
 
 
360 aa  327  3e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2948  chorismate mutase/prephenate dehydratase  48.18 
 
 
360 aa  327  3e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2575  chorismate mutase/prephenate dehydratase  48.18 
 
 
360 aa  327  3e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1635  chorismate mutase/prephenate dehydratase  47.9 
 
 
360 aa  325  7e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0741  chorismate mutase  48.04 
 
 
360 aa  324  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1792  chorismate mutase / prephenate dehydratase  45.4 
 
 
360 aa  322  7e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00027177 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2793  chorismate mutase  44.85 
 
 
360 aa  315  6e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163655 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23140  chorismate mutase, clade 2  44.75 
 
 
706 aa  315  9e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.839893  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0961  chorismate mutase  45.4 
 
 
374 aa  314  1.9999999999999998e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  45.4 
 
 
358 aa  312  5.999999999999999e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1462  prephenate dehydratase  44.72 
 
 
358 aa  309  4e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  43.06 
 
 
359 aa  308  6.999999999999999e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1887  chorismate mutase-P and prephenate dehydratase  44.82 
 
 
360 aa  308  8e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000192693  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1617  chorismate mutase  45.18 
 
 
373 aa  307  2.0000000000000002e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  42.78 
 
 
359 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2261  chorismate mutase  49.58 
 
 
360 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.561054  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0862  prephenate dehydratase / chorismate mutase  43.73 
 
 
368 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2241  prephenate dehydratase / chorismate mutase  44.17 
 
 
370 aa  300  2e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4721  chorismate mutase  43.61 
 
 
366 aa  301  2e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.997566 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4156  prephenate dehydratase / chorismate mutase  48.74 
 
 
360 aa  300  3e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2608  chorismate mutase/prephenate dehydratase  43.73 
 
 
358 aa  296  4e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1002  chorismate mutase  49.3 
 
 
360 aa  296  5e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1394  chorismate mutase  42.9 
 
 
371 aa  295  6e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0138573  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2466  chorismate mutase / prephenate dehydratase  42.9 
 
 
371 aa  295  6e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.148339 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1043  chorismate mutase  49.02 
 
 
360 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3282  chorismate mutase  43.65 
 
 
366 aa  294  2e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0668525  normal  0.62913 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1345  chorismate mutase  40.78 
 
 
359 aa  293  3e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  42.06 
 
 
356 aa  291  9e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0176  chorismate mutase / prephenate dehydratase  45.92 
 
 
368 aa  291  1e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000165847  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3121  chorismate mutase  43.89 
 
 
365 aa  290  3e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0293375 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0923  chorismate mutase  48.18 
 
 
360 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.432858 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0919  chorismate mutase  48.18 
 
 
360 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0585516  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3022  chorismate mutase  41.87 
 
 
360 aa  287  2e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.123559  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1569  chorismate mutase  44.04 
 
 
360 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203479  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0564  chorismate mutase  48.75 
 
 
362 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6846  chorismate mutase  41.19 
 
 
397 aa  270  2.9999999999999997e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.235672 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0121  prephenate dehydratase  39.72 
 
 
356 aa  269  7e-71  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1950  prephenate dehydratase  40.44 
 
 
366 aa  265  1e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  40.83 
 
 
371 aa  265  1e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2723  chorismate mutase  38.16 
 
 
381 aa  264  2e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0009  chorismate mutase  37.92 
 
 
385 aa  258  1e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1749  prephenate dehydratase  41.41 
 
 
418 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3487  prephenate dehydratase  37.19 
 
 
379 aa  249  4e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0361  chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.33 
 
 
357 aa  246  6e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1360  chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.11 
 
 
357 aa  246  6e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1647  chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.04 
 
 
357 aa  244  9.999999999999999e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000136907  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0338  chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.04 
 
 
357 aa  244  1.9999999999999999e-63  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0336  chorismate mutase  38.03 
 
 
419 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2475  chorismate mutase  40.06 
 
 
391 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248764  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>