More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0365 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0365  chorismate mutase / prephenate dehydratase  100 
 
 		 385 aa  789    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0036667  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3146  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  54.76 
 
 		 386 aa  424  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.831222  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3077  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  53.95 
 
 		 396 aa  424  1e-117  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0866115  normal  0.0319555 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0999  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  54.91 
 
 		 393 aa  424  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1133  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  53.7 
 
 		 386 aa  421  1e-117  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.898271  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0235  chorismate mutase/prephenate dehydratase  54.19 
 
 		 391 aa  422  1e-117  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3482  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  54.91 
 
 		 385 aa  418  1e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.335091 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3355  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  54.91 
 
 		 385 aa  418  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3218  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  54.91 
 
 		 385 aa  418  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.631051  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02488  fused chorismate mutase P/prephenate dehydratase  52.79 
 
 		 386 aa  414  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.610433  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1075  chorismate mutase  52.79 
 
 		 386 aa  414  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2986  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  52.79 
 
 		 386 aa  414  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000154451  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2883  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  52.79 
 
 		 386 aa  414  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0920297  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3838  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  52.79 
 
 		 386 aa  414  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000574807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2751  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  52.52 
 
 		 386 aa  412  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000608431  normal  0.0711319 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2853  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  55 
 
 		 393 aa  414  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2756  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  52.79 
 
 		 386 aa  414  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  8.8068e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1084  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  52.79 
 
 		 386 aa  414  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.165593  hitchhiker  0.00000412255 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02452  hypothetical protein  52.79 
 
 		 386 aa  414  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.699641  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0881  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  54.93 
 
 		 385 aa  405  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.304992  normal  0.0807055 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2861  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  52.89 
 
 		 386 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0154655 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2811  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  52.89 
 
 		 386 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2880  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  52.89 
 
 		 386 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.151676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2882  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  52.89 
 
 		 386 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.34961 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01713  chorismate mutase/prephenate dehydratase  50 
 
 		 393 aa  399  9.999999999999999e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.342812  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2994  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  52.63 
 
 		 386 aa  398  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004398  chorismate mutase I/prephenate dehydratase  51.95 
 
 		 392 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01001  chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  52.47 
 
 		 392 aa  395  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0661  P-protein (includes: chorismate mutase and prephenate dehydratase)  50.39 
 
 		 391 aa  394  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.026643  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2913  chorismate mutase  48.04 
 
 		 648 aa  391  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1367  chorismate mutase/prephenate dehydratase  48.69 
 
 		 671 aa  389  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2828  prephenate dehydratase / chorismate mutase  48.69 
 
 		 667 aa  389  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2910  prephenate dehydratase / chorismate mutase  48.69 
 
 		 667 aa  389  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3007  chorismate mutase / prephenate dehydratase  48.69 
 
 		 667 aa  389  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0898  prephenate dehydratase / chorismate mutase / phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  48.17 
 
 		 659 aa  390  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.983271 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1264  chorismate mutase  48.69 
 
 		 664 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.728983  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1177  chorismate mutase  48.17 
 
 		 659 aa  386  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3093  chorismate mutase  48.69 
 
 		 664 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0115511 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1297  chorismate mutase  48.69 
 
 		 664 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1220  chorismate mutase  48.69 
 
 		 664 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.950276  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1059  chorismate mutase  47.64 
 
 		 657 aa  385  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.850871  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2747  chorismate mutase  47.38 
 
 		 662 aa  384  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1590  chorismate mutase  48.7 
 
 		 399 aa  385  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1221  chorismate mutase/prephenate dehydratase  47.92 
 
 		 391 aa  380  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1072  chorismate mutase  47.38 
 
 		 654 aa  378  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1168  chorismate mutase  47.38 
 
 		 662 aa  371  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1263  chorismate mutase  47.12 
 
 		 662 aa  363  3e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0015659 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1341  prephenate dehydratase  31.01 
 
 		 384 aa  238  2e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.409344  normal  0.126516 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2375  chorismate mutase  29.69 
 
 		 378 aa  199  9e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  31.55 
 
 		 358 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  31.55 
 
 		 358 aa  196  7e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.75 
 
 		 358 aa  193  5e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0121  prephenate dehydratase  30.24 
 
 		 356 aa  193  5e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0741  chorismate mutase  33.6 
 
 		 360 aa  192  7e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2192  chorismate mutase  31.78 
 
 		 355 aa  189  5.999999999999999e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3006  chorismate mutase  32.53 
 
 		 360 aa  188  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224868  normal  0.0525817 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1635  chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.99 
 
 		 360 aa  186  6e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0716  prephenate dehydratase / chorismate mutase  31.3 
 
 		 387 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0198  chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.99 
 
 		 360 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0432  chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.99 
 
 		 360 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2997  chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.99 
 
 		 360 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.379619  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2948  chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.99 
 
 		 360 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0950  chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.99 
 
 		 360 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2885  chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.99 
 
 		 360 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.629426  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2575  chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.99 
 
 		 360 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0977  prephenate dehydratase / chorismate mutase  31.99 
 
 		 360 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.23904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  30.5 
 
 		 382 aa  182  6e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10160  monofunctional chorismate mutase, clade 2  28.31 
 
 		 403 aa  177  2e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000617885  hitchhiker  0.000000765088 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1567  prephenate dehydratase  33.21 
 
 		 271 aa  177  2e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  31.9 
 
 		 359 aa  176  9e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1881  prephenate dehydratase  33.94 
 
 		 298 aa  175  9.999999999999999e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.858484 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  29.97 
 
 		 356 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2475  chorismate mutase  33.24 
 
 		 391 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1686  chorismate mutase / prephenate dehydratase  32.02 
 
 		 355 aa  173  5e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3487  prephenate dehydratase  30.48 
 
 		 379 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2261  chorismate mutase  32.53 
 
 		 360 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.561054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0961  chorismate mutase  29.33 
 
 		 374 aa  172  6.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2539  chorismate mutase  31.48 
 
 		 399 aa  172  7.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.409768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1232  prephenate dehydratase  33.86 
 
 		 363 aa  172  9e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.964016 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0495  chorismate mutase  29.57 
 
 		 359 aa  172  9e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0778684  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0951  chorismate mutase / prephenate dehydratase  29.89 
 
 		 365 aa  171  1e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.356586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1887  chorismate mutase-P and prephenate dehydratase  30.83 
 
 		 360 aa  171  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000192693  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3724  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  33.7 
 
 		 632 aa  172  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1418  chorismate mutase/prephenate dehydratase  28.84 
 
 		 362 aa  171  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  29.52 
 
 		 358 aa  171  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1792  chorismate mutase / prephenate dehydratase  27.3 
 
 		 360 aa  170  5e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027177 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1950  prephenate dehydratase  30.83 
 
 		 366 aa  169  5e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2241  prephenate dehydratase / chorismate mutase  30.85 
 
 		 370 aa  169  6e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2583  prephenate dehydratase  30.55 
 
 		 372 aa  169  6e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2091  Chorismate mutase  34.64 
 
 		 280 aa  169  6e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.746584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  31.37 
 
 		 359 aa  169  7e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00716  P-protein  29.1 
 
 		 402 aa  168  1e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00262272  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  29.07 
 
 		 371 aa  169  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0877  Prephenate dehydratase  33.09 
 
 		 288 aa  169  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23140  chorismate mutase, clade 2  28.61 
 
 		 706 aa  167  2e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.839893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4156  prephenate dehydratase / chorismate mutase  31.99 
 
 		 360 aa  168  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0783  prephenate dehydratase  29.49 
 
 		 380 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1207  chorismate mutase  27.25 
 
 		 371 aa  167  4e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0297935 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0862  prephenate dehydratase / chorismate mutase  30.03 
 
 		 368 aa  166  5e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1023  chorismate mutase  29.18 
 
 		 365 aa  166  5.9999999999999996e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>