More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1881 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1881  prephenate dehydratase  100 
 
 		 298 aa  622  1e-177  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.858484 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0018  prephenate dehydratase  47.97 
 
 		 287 aa  258  8e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4083  prephenate dehydratase  46.27 
 
 		 284 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0689378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3428  prephenate dehydratase  43.46 
 
 		 284 aa  256  3e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4403  prephenate dehydratase  45.9 
 
 		 284 aa  255  7e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0037  prephenate dehydratase  46.49 
 
 		 287 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.51728  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0037  prephenate dehydratase  46.49 
 
 		 287 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.771092  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3162  prephenate dehydratase  48.61 
 
 		 288 aa  251  1e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.309807  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4087  prephenate dehydratase  45.15 
 
 		 290 aa  248  7e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2629  prephenate dehydratase  47.21 
 
 		 286 aa  246  4e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.216997 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0105  prephenate dehydratase  46.27 
 
 		 265 aa  243  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7058  prephenate dehydratase  46.82 
 
 		 286 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2951  prephenate dehydratase  47.25 
 
 		 286 aa  243  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.217306 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1620  prephenate dehydratase  42.05 
 
 		 284 aa  242  7e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159121  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0653  prephenate dehydratase  47.23 
 
 		 280 aa  241  1e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4217  prephenate dehydratase  45.32 
 
 		 280 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.239434  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3356  prephenate dehydratase  44.57 
 
 		 288 aa  238  1e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.539085  normal  0.173573 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3538  prephenate dehydratase  44.57 
 
 		 284 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0642  prephenate dehydratase  46.07 
 
 		 287 aa  235  6e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0930161  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3732  prephenate dehydratase  44.57 
 
 		 286 aa  235  8e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.755175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0511  prephenate dehydratase  44.07 
 
 		 284 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1767  prephenate dehydratase  44.57 
 
 		 284 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0567003 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0365  prephenate dehydratase  45.15 
 
 		 286 aa  232  5e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0252  prephenate dehydratase  43.88 
 
 		 293 aa  231  1e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3003  prephenate dehydratase  44.65 
 
 		 288 aa  230  2e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0555723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0339  prephenate dehydratase  44.44 
 
 		 285 aa  229  6e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3912  Prephenate dehydratase  43.66 
 
 		 288 aa  228  7e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0418  Prephenate dehydratase  43.43 
 
 		 287 aa  227  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0285  prephenate dehydratase  44.19 
 
 		 286 aa  227  2e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.224737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0524  prephenate dehydratase  46.44 
 
 		 277 aa  227  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0734392  normal  0.460167 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1988  prephenate dehydratase  44.36 
 
 		 287 aa  226  4e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.630591  normal  0.549246 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0384  Prephenate dehydratase  44.07 
 
 		 285 aa  226  4e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.020412  normal  0.492047 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  42.6 
 
 		 358 aa  225  9e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  42.6 
 
 		 358 aa  223  2e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2091  Chorismate mutase  45.76 
 
 		 280 aa  222  4.9999999999999996e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.746584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1293  Prephenate dehydratase  44.6 
 
 		 293 aa  222  6e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.821795  normal  0.378721 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  42.24 
 
 		 358 aa  222  7e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0877  Prephenate dehydratase  43.22 
 
 		 288 aa  221  8e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3606  Prephenate dehydratase  41.26 
 
 		 285 aa  221  9.999999999999999e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1809  prephenate dehydratase  45.49 
 
 		 295 aa  220  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.115737 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3865  prephenate dehydratase  43.61 
 
 		 276 aa  219  3.9999999999999997e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0369345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3650  prephenate dehydratase  42.31 
 
 		 285 aa  219  5e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.243627  normal  0.169343 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0170  prephenate dehydratase  44.36 
 
 		 287 aa  219  6e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2361  prephenate dehydratase  44.94 
 
 		 277 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.814265  normal  0.327119 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0706  prephenate dehydratase  44.94 
 
 		 300 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.146743  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3518  prephenate dehydratase  41.64 
 
 		 310 aa  216  4e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4580  prephenate dehydratase  45.56 
 
 		 282 aa  215  5.9999999999999996e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1567  prephenate dehydratase  40.45 
 
 		 271 aa  215  5.9999999999999996e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0102  prephenate dehydratase  41.85 
 
 		 287 aa  211  1e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.29138  normal  0.214423 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2554  prephenate dehydratase  42.7 
 
 		 276 aa  211  2e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183494 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  42.07 
 
 		 356 aa  209  5e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0467  prephenate dehydratase  43.82 
 
 		 296 aa  202  6e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1547  prephenate dehydratase  40.66 
 
 		 276 aa  199  6e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0495  Prephenate dehydratase  41.16 
 
 		 279 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0622  prephenate dehydratase  41.13 
 
 		 297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.284363  normal  0.610727 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1303  prephenate dehydratase  39.56 
 
 		 276 aa  196  3e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_3267  predicted protein  37.75 
 
 		 304 aa  196  4.0000000000000005e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0537  prephenate dehydratase  38.63 
 
 		 279 aa  194  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0656  Prephenate dehydratase  39.78 
 
 		 276 aa  194  2e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.416459  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0783  prephenate dehydratase  40.36 
 
 		 380 aa  193  3e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1437  prephenate dehydratase  39.19 
 
 		 276 aa  193  3e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004398  chorismate mutase I/prephenate dehydratase  37.37 
 
 		 392 aa  192  4e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01001  chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  36.65 
 
 		 392 aa  189  4e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0235  chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.01 
 
 		 391 aa  189  5e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1341  prephenate dehydratase  35.97 
 
 		 384 aa  189  5.999999999999999e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.409344  normal  0.126516 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2375  chorismate mutase  36.44 
 
 		 378 aa  187  2e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1950  prephenate dehydratase  37.72 
 
 		 366 aa  187  3e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4688  prephenate dehydratase  42.7 
 
 		 299 aa  186  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0153843  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0633  Prephenate dehydratase  41.37 
 
 		 285 aa  185  7e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3077  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.36 
 
 		 396 aa  184  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0866115  normal  0.0319555 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2043  prephenate dehydratase  38.35 
 
 		 283 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.64689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0881  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  36.07 
 
 		 385 aa  184  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.304992  normal  0.0807055 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0474  Prephenate dehydratase  39.35 
 
 		 279 aa  183  3e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0365  chorismate mutase / prephenate dehydratase  33.94 
 
 		 385 aa  183  3e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0036667  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1072  chorismate mutase  35.38 
 
 		 654 aa  183  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1334  prephenate dehydratase  42.96 
 
 		 303 aa  181  1e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  37.8 
 
 		 371 aa  181  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3724  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  35.56 
 
 		 632 aa  181  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0541  Prephenate dehydratase  37.05 
 
 		 279 aa  181  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1133  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.01 
 
 		 386 aa  181  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.898271  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13638  predicted protein  41.01 
 
 		 348 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  39.48 
 
 		 358 aa  178  9e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2751  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.31 
 
 		 386 aa  177  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000608431  normal  0.0711319 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2853  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  36.36 
 
 		 393 aa  177  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01713  chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.72 
 
 		 393 aa  177  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.342812  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2883  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.31 
 
 		 386 aa  177  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0920297  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2986  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.31 
 
 		 386 aa  177  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000154451  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02488  fused chorismate mutase P/prephenate dehydratase  35.31 
 
 		 386 aa  177  3e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.610433  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1075  chorismate mutase  35.31 
 
 		 386 aa  177  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1221  chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.86 
 
 		 391 aa  177  3e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02452  hypothetical protein  35.31 
 
 		 386 aa  177  3e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.699641  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3838  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.31 
 
 		 386 aa  177  3e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000574807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3146  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  36.3 
 
 		 386 aa  177  3e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.831222  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1084  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.31 
 
 		 386 aa  177  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.165593  hitchhiker  0.00000412255 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1168  chorismate mutase  35.97 
 
 		 662 aa  176  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2756  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.31 
 
 		 386 aa  177  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  8.8068e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0999  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.94 
 
 		 393 aa  176  3e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2192  chorismate mutase  39.19 
 
 		 355 aa  176  5e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  36.11 
 
 		 365 aa  174  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1263  chorismate mutase  35.38 
 
 		 662 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0015659 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>