More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0633 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0633  Prephenate dehydratase  100 
 
 		 285 aa  569  1e-161  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0877  Prephenate dehydratase  46.1 
 
 		 288 aa  243  3e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0656  Prephenate dehydratase  48.74 
 
 		 276 aa  238  5.999999999999999e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.416459  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0537  prephenate dehydratase  46.57 
 
 		 279 aa  228  6e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0474  Prephenate dehydratase  46.07 
 
 		 279 aa  228  1e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  42.35 
 
 		 358 aa  224  1e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1644  prephenate dehydratase  46.59 
 
 		 280 aa  222  4.9999999999999996e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0495  Prephenate dehydratase  46.59 
 
 		 279 aa  222  6e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2043  prephenate dehydratase  47.27 
 
 		 283 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.64689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  42.35 
 
 		 358 aa  221  9.999999999999999e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0180  prephenate dehydratase  47.87 
 
 		 283 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  42.35 
 
 		 358 aa  218  7.999999999999999e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_3267  predicted protein  43.14 
 
 		 304 aa  215  5e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0541  Prephenate dehydratase  45.13 
 
 		 279 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3724  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  42.7 
 
 		 632 aa  213  3.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13638  predicted protein  47.37 
 
 		 348 aa  209  6e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1293  Prephenate dehydratase  45.82 
 
 		 293 aa  207  1e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.821795  normal  0.378721 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1567  prephenate dehydratase  38.63 
 
 		 271 aa  206  3e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2091  Chorismate mutase  44.73 
 
 		 280 aa  205  6e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.746584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2061  Prephenate dehydratase  45.82 
 
 		 277 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2153  Prephenate dehydratase  45.82 
 
 		 277 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1779  prephenate dehydratase  45.82 
 
 		 277 aa  202  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.490374  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1153  Prephenate dehydratase  41.45 
 
 		 276 aa  195  6e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0937  prephenate dehydratase  43.33 
 
 		 272 aa  189  4e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2723  chorismate mutase  41.61 
 
 		 381 aa  187  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1881  prephenate dehydratase  41.37 
 
 		 298 aa  187  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.858484 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1303  prephenate dehydratase  38.77 
 
 		 276 aa  186  5e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2828  prephenate dehydratase / chorismate mutase  36.3 
 
 		 667 aa  186  5e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2910  prephenate dehydratase / chorismate mutase  36.3 
 
 		 667 aa  185  6e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3007  chorismate mutase / prephenate dehydratase  36.3 
 
 		 667 aa  185  6e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2260  prephenate dehydratase  38.18 
 
 		 278 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2375  chorismate mutase  33.46 
 
 		 378 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1594  prephenate dehydratase  35.4 
 
 		 311 aa  183  2.0000000000000003e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1367  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.69 
 
 		 671 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3428  prephenate dehydratase  40.5 
 
 		 284 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1547  prephenate dehydratase  38.55 
 
 		 276 aa  182  6e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1437  prephenate dehydratase  38.04 
 
 		 276 aa  181  8.000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1988  prephenate dehydratase  42.55 
 
 		 287 aa  181  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.630591  normal  0.549246 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4087  prephenate dehydratase  42.49 
 
 		 290 aa  181  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0845  chorismate mutase  38.83 
 
 		 371 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0602148 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0653  prephenate dehydratase  39.78 
 
 		 280 aa  181  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7058  prephenate dehydratase  43.01 
 
 		 286 aa  181  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1620  prephenate dehydratase  41.45 
 
 		 284 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159121  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3039  chorismate mutase  40.66 
 
 		 355 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0105  prephenate dehydratase  42.97 
 
 		 265 aa  179  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3538  prephenate dehydratase  41.22 
 
 		 284 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0774  chorismate mutase  38.46 
 
 		 371 aa  179  7e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.561025  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3006  chorismate mutase  41.09 
 
 		 360 aa  178  8e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224868  normal  0.0525817 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2951  prephenate dehydratase  42.91 
 
 		 286 aa  178  9e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.217306 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4217  prephenate dehydratase  41.76 
 
 		 280 aa  178  9e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.239434  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0878  Prephenate dehydratase  38.46 
 
 		 277 aa  178  9e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.583651  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0716  prephenate dehydratase / chorismate mutase  38.77 
 
 		 387 aa  178  9e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4083  prephenate dehydratase  41.03 
 
 		 284 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0689378  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0037  prephenate dehydratase  41.97 
 
 		 287 aa  177  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.51728  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1264  chorismate mutase  35.23 
 
 		 664 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.728983  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1059  chorismate mutase  35.94 
 
 		 657 aa  177  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.850871  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1297  chorismate mutase  35.23 
 
 		 664 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0037  prephenate dehydratase  41.97 
 
 		 287 aa  177  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.771092  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  38.55 
 
 		 373 aa  177  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1220  chorismate mutase  35.23 
 
 		 664 aa  176  3e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.950276  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1072  chorismate mutase  34.16 
 
 		 654 aa  176  3e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2885  chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.49 
 
 		 360 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.629426  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0432  chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.49 
 
 		 360 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2997  chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.49 
 
 		 360 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.379619  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0198  chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.49 
 
 		 360 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1635  chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.13 
 
 		 360 aa  176  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1767  prephenate dehydratase  40.86 
 
 		 284 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0567003 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0977  prephenate dehydratase / chorismate mutase  40.73 
 
 		 360 aa  176  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.23904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2948  chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.49 
 
 		 360 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2575  chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.49 
 
 		 360 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0950  chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.49 
 
 		 360 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3093  chorismate mutase  35.23 
 
 		 664 aa  176  3e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0115511 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  38.41 
 
 		 382 aa  176  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  38.18 
 
 		 365 aa  176  4e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4403  prephenate dehydratase  40.66 
 
 		 284 aa  176  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1497  P-protein (prephenate dehydratase / chorismate mutase)  37.05 
 
 		 374 aa  176  4e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554673  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1177  chorismate mutase  35.23 
 
 		 659 aa  176  5e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  40.94 
 
 		 358 aa  176  5e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1442  chorismate mutase  37.05 
 
 		 374 aa  176  5e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.105369  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0097  Prephenate dehydratase  40.93 
 
 		 306 aa  176  5e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2192  chorismate mutase  42.2 
 
 		 355 aa  175  6e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0806  prephenate dehydratase  35.42 
 
 		 284 aa  175  6e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0018  prephenate dehydratase  41.39 
 
 		 287 aa  175  6e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  37.09 
 
 		 364 aa  175  6e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0904  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.36 
 
 		 371 aa  175  7e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1749  prephenate dehydratase  40.14 
 
 		 418 aa  175  8e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3518  prephenate dehydratase  42.86 
 
 		 310 aa  175  8e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1809  prephenate dehydratase  41.64 
 
 		 295 aa  175  8e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.115737 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1168  chorismate mutase  34.28 
 
 		 662 aa  175  9e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0741  chorismate mutase  39.36 
 
 		 360 aa  175  9e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2629  prephenate dehydratase  41.76 
 
 		 286 aa  174  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.216997 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1963  chorismate mutase  37.09 
 
 		 365 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3645  chorismate mutasea  37.82 
 
 		 364 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  38.99 
 
 		 359 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23140  chorismate mutase, clade 2  40.85 
 
 		 706 aa  174  1.9999999999999998e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.839893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1538  chorismate mutase  39.86 
 
 		 362 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3606  Prephenate dehydratase  41.58 
 
 		 285 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2858  chorismate mutase  38.55 
 
 		 373 aa  173  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.42066  hitchhiker  0.0000000270068 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0661  P-protein (includes: chorismate mutase and prephenate dehydratase)  34.91 
 
 		 391 aa  173  2.9999999999999996e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.026643  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  38.99 
 
 		 359 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>