More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2043 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2043  prephenate dehydratase  100 
 
 
283 aa  580  1.0000000000000001e-165  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.64689  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0537  prephenate dehydratase  44.96 
 
 
279 aa  224  1e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0474  Prephenate dehydratase  44.6 
 
 
279 aa  223  2e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0180  prephenate dehydratase  44.29 
 
 
283 aa  222  4e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1644  prephenate dehydratase  45.49 
 
 
280 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0495  Prephenate dehydratase  43.68 
 
 
279 aa  217  2e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0656  Prephenate dehydratase  44.53 
 
 
276 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.416459  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0633  Prephenate dehydratase  47.27 
 
 
285 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0541  Prephenate dehydratase  43.32 
 
 
279 aa  209  4e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1303  prephenate dehydratase  35.79 
 
 
276 aa  193  2e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1437  prephenate dehydratase  35.42 
 
 
276 aa  191  9e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_3267  predicted protein  39.14 
 
 
304 aa  190  2e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0877  Prephenate dehydratase  39.78 
 
 
288 aa  190  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1293  Prephenate dehydratase  42.75 
 
 
293 aa  190  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.821795  normal  0.378721 
 
 
-
 
NC_002936  DET1547  prephenate dehydratase  35.96 
 
 
276 aa  189  5e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2091  Chorismate mutase  41.54 
 
 
280 aa  186  3e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.746584  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  36.98 
 
 
358 aa  186  5e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1567  prephenate dehydratase  35.66 
 
 
271 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1345  prephenate dehydratase  38.15 
 
 
379 aa  178  7e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  36.98 
 
 
358 aa  177  2e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  36.6 
 
 
358 aa  175  6e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0783  prephenate dehydratase  34.31 
 
 
380 aa  175  6e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13638  predicted protein  39.58 
 
 
348 aa  174  9.999999999999999e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2951  prephenate dehydratase  39.05 
 
 
286 aa  174  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.217306 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0653  prephenate dehydratase  38.01 
 
 
280 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2629  prephenate dehydratase  37.69 
 
 
286 aa  172  5e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.216997 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7058  prephenate dehydratase  38.66 
 
 
286 aa  172  7.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3538  prephenate dehydratase  41.42 
 
 
284 aa  171  9e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683158  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3428  prephenate dehydratase  39.26 
 
 
284 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3724  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  35.79 
 
 
632 aa  171  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0037  prephenate dehydratase  38.55 
 
 
287 aa  169  4e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.51728  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0037  prephenate dehydratase  38.55 
 
 
287 aa  169  4e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.771092  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2375  chorismate mutase  32.1 
 
 
378 aa  168  8e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  37.87 
 
 
359 aa  168  8e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1881  prephenate dehydratase  38.35 
 
 
298 aa  168  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.858484 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1767  prephenate dehydratase  38.29 
 
 
284 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0567003 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  37.5 
 
 
359 aa  167  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4217  prephenate dehydratase  40.59 
 
 
280 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.239434  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1809  prephenate dehydratase  38.55 
 
 
295 aa  166  4e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.115737 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1988  prephenate dehydratase  39.48 
 
 
287 aa  165  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.630591  normal  0.549246 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4087  prephenate dehydratase  38.15 
 
 
290 aa  165  6.9999999999999995e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0517  prephenate dehydratase  33.82 
 
 
275 aa  165  8e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.72305  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0018  prephenate dehydratase  38.55 
 
 
287 aa  165  9e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4403  prephenate dehydratase  37.87 
 
 
284 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4083  prephenate dehydratase  37.87 
 
 
284 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0689378  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1513  Prephenate dehydratase  31.48 
 
 
277 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.807541 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3356  prephenate dehydratase  38.6 
 
 
288 aa  161  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.539085  normal  0.173573 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1887  chorismate mutase-P and prephenate dehydratase  36.57 
 
 
360 aa  160  3e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000192693  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0937  prephenate dehydratase  37.69 
 
 
272 aa  160  3e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0365  prephenate dehydratase  37.41 
 
 
286 aa  159  4e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2828  prephenate dehydratase / chorismate mutase  32.97 
 
 
667 aa  159  4e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2910  prephenate dehydratase / chorismate mutase  32.97 
 
 
667 aa  159  4e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3007  chorismate mutase / prephenate dehydratase  32.97 
 
 
667 aa  159  4e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1367  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.33 
 
 
671 aa  159  5e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2554  prephenate dehydratase  37.04 
 
 
276 aa  159  5e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00183494 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0252  prephenate dehydratase  37.17 
 
 
293 aa  159  6e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396443  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2608  chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.73 
 
 
358 aa  157  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  37 
 
 
367 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  37 
 
 
364 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0105  prephenate dehydratase  38.61 
 
 
265 aa  158  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  37 
 
 
364 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0302882 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0285  prephenate dehydratase  36.06 
 
 
286 aa  158  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.224737  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10160  monofunctional chorismate mutase, clade 2  35.34 
 
 
403 aa  158  1e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000617885  hitchhiker  0.000000765088 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  37 
 
 
364 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1779  prephenate dehydratase  38.38 
 
 
277 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.490374  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3732  prephenate dehydratase  37.04 
 
 
286 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.755175  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3039  chorismate mutase  34.94 
 
 
355 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  36.16 
 
 
364 aa  155  6e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01001  chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.6 
 
 
392 aa  155  6e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0862  prephenate dehydratase / chorismate mutase  36.13 
 
 
368 aa  155  8e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004398  chorismate mutase I/prephenate dehydratase  32.97 
 
 
392 aa  155  9e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  35.79 
 
 
364 aa  154  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3606  Prephenate dehydratase  37.91 
 
 
285 aa  155  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  35.79 
 
 
365 aa  154  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2153  Prephenate dehydratase  38.38 
 
 
277 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0878  Prephenate dehydratase  35.42 
 
 
277 aa  154  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.583651  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2061  Prephenate dehydratase  38.38 
 
 
277 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3645  chorismate mutasea  36.16 
 
 
364 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734175  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3162  prephenate dehydratase  37.97 
 
 
288 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.309807  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3865  prephenate dehydratase  35.96 
 
 
276 aa  153  2.9999999999999998e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0369345  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1072  chorismate mutase  32.36 
 
 
654 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0235  chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.6 
 
 
391 aa  153  4e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1177  chorismate mutase  32.6 
 
 
659 aa  153  4e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1747  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.79 
 
 
364 aa  152  5e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0966339  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2883  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.04 
 
 
386 aa  152  5e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0920297  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2986  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.04 
 
 
386 aa  152  5e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000154451  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3077  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.21 
 
 
396 aa  152  5e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0866115  normal  0.0319555 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23280  chorismate mutase  35.42 
 
 
365 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.110273 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02488  fused chorismate mutase P/prephenate dehydratase  35.04 
 
 
386 aa  152  7e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.610433  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1075  chorismate mutase  35.04 
 
 
386 aa  152  7e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3838  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.04 
 
 
386 aa  152  7e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000574807  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1084  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.04 
 
 
386 aa  152  7e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.165593  hitchhiker  0.00000412255 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1963  chorismate mutase  35.42 
 
 
365 aa  152  7e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2756  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.04 
 
 
386 aa  152  7e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  8.8068e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2751  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.04 
 
 
386 aa  152  7e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000608431  normal  0.0711319 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02452  hypothetical protein  35.04 
 
 
386 aa  152  7e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.699641  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1462  prephenate dehydratase  37.73 
 
 
358 aa  152  7e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1264  chorismate mutase  31.87 
 
 
664 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.728983  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3912  Prephenate dehydratase  37.45 
 
 
288 aa  150  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1297  chorismate mutase  31.87 
 
 
664 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>