More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3039 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3039  chorismate mutase  100 
 
 
355 aa  722    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2192  chorismate mutase  60.67 
 
 
355 aa  432  1e-120  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1232  prephenate dehydratase  62.88 
 
 
363 aa  430  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.964016 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0951  chorismate mutase / prephenate dehydratase  57.06 
 
 
365 aa  414  1e-114  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.356586  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1686  chorismate mutase / prephenate dehydratase  58.87 
 
 
355 aa  402  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  54.29 
 
 
382 aa  395  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  53.31 
 
 
373 aa  397  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3645  chorismate mutasea  52.59 
 
 
364 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734175  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0174  chorismate mutase  53.07 
 
 
361 aa  390  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0716  prephenate dehydratase / chorismate mutase  53.54 
 
 
387 aa  389  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0845  chorismate mutase  53.03 
 
 
371 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0602148 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  51.92 
 
 
365 aa  387  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1747  chorismate mutase/prephenate dehydratase  52.2 
 
 
364 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0966339  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0774  chorismate mutase  52.45 
 
 
371 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.561025  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  50.27 
 
 
367 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  50.41 
 
 
364 aa  378  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  50.56 
 
 
364 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  50.55 
 
 
364 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0302882 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  50.27 
 
 
364 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1207  chorismate mutase  51.12 
 
 
371 aa  381  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0297935 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0904  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  52.17 
 
 
371 aa  377  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2858  chorismate mutase  54.67 
 
 
373 aa  376  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.42066  hitchhiker  0.0000000270068 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  50.83 
 
 
364 aa  377  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23280  chorismate mutase  49.45 
 
 
365 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1963  chorismate mutase  49.18 
 
 
365 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1538  chorismate mutase  53.61 
 
 
362 aa  373  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1418  chorismate mutase/prephenate dehydratase  53.39 
 
 
362 aa  368  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0977  prephenate dehydratase / chorismate mutase  54.6 
 
 
360 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.23904  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0897  chorismate mutase/prephenate dehydratase  50.7 
 
 
358 aa  365  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.255743  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1019  chorismate mutase  50.7 
 
 
358 aa  365  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.789998  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3006  chorismate mutase  54.6 
 
 
360 aa  367  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224868  normal  0.0525817 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0961  chorismate mutase  51.69 
 
 
374 aa  363  2e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1635  chorismate mutase/prephenate dehydratase  54.04 
 
 
360 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0198  chorismate mutase/prephenate dehydratase  54.04 
 
 
360 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0432  chorismate mutase/prephenate dehydratase  54.04 
 
 
360 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2997  chorismate mutase/prephenate dehydratase  54.04 
 
 
360 aa  360  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.379619  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2948  chorismate mutase/prephenate dehydratase  54.04 
 
 
360 aa  360  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2885  chorismate mutase/prephenate dehydratase  54.04 
 
 
360 aa  360  2e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.629426  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0950  chorismate mutase/prephenate dehydratase  54.04 
 
 
360 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2575  chorismate mutase/prephenate dehydratase  54.04 
 
 
360 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23140  chorismate mutase, clade 2  53.39 
 
 
706 aa  360  2e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.839893  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1023  chorismate mutase  51.23 
 
 
365 aa  359  4e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2793  chorismate mutase  49.16 
 
 
360 aa  356  3.9999999999999996e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163655 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0741  chorismate mutase  51.55 
 
 
360 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3121  chorismate mutase  50.56 
 
 
365 aa  354  1e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0293375 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1792  chorismate mutase / prephenate dehydratase  49.03 
 
 
360 aa  353  2e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00027177 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00716  P-protein  50 
 
 
402 aa  354  2e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00262272  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1442  chorismate mutase  49.44 
 
 
374 aa  352  5e-96  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.105369  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0926  chorismate mutase / prephenate dehydratase  52.19 
 
 
367 aa  352  5.9999999999999994e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1336  chorismate mutase  48.66 
 
 
413 aa  350  2e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1497  P-protein (prephenate dehydratase / chorismate mutase)  49.16 
 
 
374 aa  350  2e-95  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554673  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1250  chorismate mutase  47.54 
 
 
382 aa  350  2e-95  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149804  normal  0.0219371 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1394  chorismate mutase  49.03 
 
 
371 aa  350  2e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0138573  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2466  chorismate mutase / prephenate dehydratase  49.03 
 
 
371 aa  350  2e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.148339 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0495  chorismate mutase  51.25 
 
 
359 aa  350  3e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0778684  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2147  prephenate dehydratase  51.13 
 
 
373 aa  350  3e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.707843  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2241  prephenate dehydratase / chorismate mutase  52.11 
 
 
370 aa  348  1e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1313  chorismate mutase  51.42 
 
 
359 aa  347  2e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  2.21838e-16 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4721  chorismate mutase  48.6 
 
 
366 aa  346  4e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.997566 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3282  chorismate mutase  49.44 
 
 
366 aa  345  1e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0668525  normal  0.62913 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2539  chorismate mutase  49.44 
 
 
399 aa  343  2e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.409768  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0568  chorismate mutase  53.5 
 
 
362 aa  340  2.9999999999999998e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1617  chorismate mutase  49.03 
 
 
373 aa  337  9.999999999999999e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  47.01 
 
 
359 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2261  chorismate mutase  53.48 
 
 
360 aa  335  1e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.561054  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1193  chorismate mutase  44.66 
 
 
366 aa  333  3e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1186  prephenate dehydratase  47.8 
 
 
393 aa  332  4e-90  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.343107 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1569  chorismate mutase  49.16 
 
 
360 aa  332  4e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203479  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  46.72 
 
 
359 aa  332  8e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4156  prephenate dehydratase / chorismate mutase  53.2 
 
 
360 aa  332  9e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1204  chorismate mutase  47.53 
 
 
393 aa  331  1e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.973222  normal  0.768195 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  46.72 
 
 
358 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1002  chorismate mutase  52.92 
 
 
360 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1043  chorismate mutase  52.92 
 
 
360 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0801  chorismate mutase  45.07 
 
 
359 aa  318  6e-86  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1345  chorismate mutase  44.96 
 
 
359 aa  318  1e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1887  chorismate mutase-P and prephenate dehydratase  44.99 
 
 
360 aa  314  9.999999999999999e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000192693  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2608  chorismate mutase/prephenate dehydratase  47.13 
 
 
358 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0923  chorismate mutase  52.92 
 
 
360 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.432858 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0919  chorismate mutase  52.92 
 
 
360 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0585516  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0862  prephenate dehydratase / chorismate mutase  45.01 
 
 
368 aa  309  5e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1462  prephenate dehydratase  44.83 
 
 
358 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2723  chorismate mutase  44.19 
 
 
381 aa  304  2.0000000000000002e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  42.33 
 
 
356 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0564  chorismate mutase  52.63 
 
 
362 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0121  prephenate dehydratase  40.28 
 
 
356 aa  299  5e-80  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3022  chorismate mutase  43.98 
 
 
360 aa  299  6e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.123559  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  44.7 
 
 
371 aa  298  1e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0176  chorismate mutase / prephenate dehydratase  44.94 
 
 
368 aa  289  6e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000165847  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1950  prephenate dehydratase  43.06 
 
 
366 aa  278  1e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6846  chorismate mutase  40.67 
 
 
397 aa  265  7e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.235672 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0116  chorismate mutase  42.45 
 
 
377 aa  260  2e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0361  chorismate mutase/prephenate dehydratase  38.86 
 
 
357 aa  259  3e-68  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1647  chorismate mutase/prephenate dehydratase  38.57 
 
 
357 aa  259  6e-68  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000136907  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0338  chorismate mutase/prephenate dehydratase  38.86 
 
 
357 aa  259  6e-68  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2583  prephenate dehydratase  39.94 
 
 
372 aa  258  8e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0336  chorismate mutase  40.22 
 
 
419 aa  258  1e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0009  chorismate mutase  38.35 
 
 
385 aa  258  1e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2566  chorismate mutase  39.27 
 
 
357 aa  257  2e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0269  chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.64 
 
 
358 aa  256  5e-67  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>