More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0269 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0269  chorismate mutase/prephenate dehydratase  100 
 
 
358 aa  740    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1666  P-protein  71.63 
 
 
359 aa  545  1e-154  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1589  transcription termination factor NusA  70.51 
 
 
359 aa  540  9.999999999999999e-153  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1299  chorismate mutase/prephenate dehydratase  68.91 
 
 
359 aa  518  1e-146  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0361  chorismate mutase/prephenate dehydratase  68.35 
 
 
357 aa  506  9.999999999999999e-143  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1647  chorismate mutase/prephenate dehydratase  68.35 
 
 
357 aa  505  9.999999999999999e-143  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000136907  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0338  chorismate mutase/prephenate dehydratase  68.07 
 
 
357 aa  504  1e-141  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1360  chorismate mutase/prephenate dehydratase  67.79 
 
 
357 aa  500  1e-140  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0216  chorismate mutase  66.39 
 
 
355 aa  494  9.999999999999999e-139  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0470  chorismate mutase, gamma, beta and epsilon  56.2 
 
 
363 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2767  chorismate mutase  49.72 
 
 
357 aa  355  7.999999999999999e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.642402 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2566  chorismate mutase  46.37 
 
 
357 aa  333  2e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1887  chorismate mutase-P and prephenate dehydratase  43.06 
 
 
360 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000192693  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  39.49 
 
 
359 aa  259  3e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2723  chorismate mutase  37.92 
 
 
381 aa  259  5.0000000000000005e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  39.49 
 
 
359 aa  258  1e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1345  chorismate mutase  41.03 
 
 
359 aa  256  4e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3039  chorismate mutase  37.64 
 
 
355 aa  256  5e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2608  chorismate mutase/prephenate dehydratase  40.34 
 
 
358 aa  252  8.000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0121  prephenate dehydratase  40.11 
 
 
356 aa  249  8e-65  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  37.68 
 
 
356 aa  248  1e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  38.64 
 
 
358 aa  247  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1207  chorismate mutase  37.29 
 
 
371 aa  246  3e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0297935 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6846  chorismate mutase  35.93 
 
 
397 aa  246  4e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.235672 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0862  prephenate dehydratase / chorismate mutase  39.09 
 
 
368 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0926  chorismate mutase / prephenate dehydratase  38.59 
 
 
367 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1250  chorismate mutase  37.5 
 
 
382 aa  242  9e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149804  normal  0.0219371 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2192  chorismate mutase  36.36 
 
 
355 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  38.57 
 
 
373 aa  239  5.999999999999999e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  36.93 
 
 
371 aa  238  1e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  38.72 
 
 
364 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0302882 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0897  chorismate mutase/prephenate dehydratase  36.21 
 
 
358 aa  238  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.255743  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  38.44 
 
 
367 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1019  chorismate mutase  36.21 
 
 
358 aa  238  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.789998  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1747  chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.99 
 
 
364 aa  237  3e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0966339  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1462  prephenate dehydratase  38.92 
 
 
358 aa  237  3e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  38.44 
 
 
364 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3645  chorismate mutasea  37.99 
 
 
364 aa  236  4e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734175  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0174  chorismate mutase  37.5 
 
 
361 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  38.42 
 
 
364 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  37.88 
 
 
364 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2809  prephenate dehydratase  37.96 
 
 
372 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.433236  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1232  prephenate dehydratase  40.11 
 
 
363 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.964016 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0716  prephenate dehydratase / chorismate mutase  33.43 
 
 
387 aa  233  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1963  chorismate mutase  37.96 
 
 
365 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1418  chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.29 
 
 
362 aa  233  5e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0568  chorismate mutase  40.57 
 
 
362 aa  233  5e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  37.43 
 
 
364 aa  233  5e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1950  prephenate dehydratase  38.64 
 
 
366 aa  233  5e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2948  chorismate mutase/prephenate dehydratase  36.57 
 
 
360 aa  232  6e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2575  chorismate mutase/prephenate dehydratase  36.57 
 
 
360 aa  232  6e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0432  chorismate mutase/prephenate dehydratase  36.57 
 
 
360 aa  232  6e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2997  chorismate mutase/prephenate dehydratase  36.57 
 
 
360 aa  232  6e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.379619  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2885  chorismate mutase/prephenate dehydratase  36.57 
 
 
360 aa  232  6e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.629426  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0198  chorismate mutase/prephenate dehydratase  36.57 
 
 
360 aa  232  6e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0950  chorismate mutase/prephenate dehydratase  36.57 
 
 
360 aa  232  6e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1635  chorismate mutase/prephenate dehydratase  36.57 
 
 
360 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3022  chorismate mutase  36.97 
 
 
360 aa  231  1e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.123559  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  33.14 
 
 
382 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0116  chorismate mutase  35.77 
 
 
377 aa  230  2e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0741  chorismate mutase  35.43 
 
 
360 aa  230  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1686  chorismate mutase / prephenate dehydratase  38.44 
 
 
355 aa  230  3e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23280  chorismate mutase  37.39 
 
 
365 aa  230  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2147  prephenate dehydratase  40.28 
 
 
373 aa  229  5e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.707843  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3006  chorismate mutase  34.29 
 
 
360 aa  228  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224868  normal  0.0525817 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0977  prephenate dehydratase / chorismate mutase  34.29 
 
 
360 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.23904  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3487  prephenate dehydratase  34.94 
 
 
379 aa  223  3e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1442  chorismate mutase  36.44 
 
 
374 aa  223  4e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.105369  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1023  chorismate mutase  38.03 
 
 
365 aa  223  4e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0845  chorismate mutase  33.52 
 
 
371 aa  222  6e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0602148 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0774  chorismate mutase  33.52 
 
 
371 aa  222  7e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.561025  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0801  chorismate mutase  36.93 
 
 
359 aa  222  8e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0951  chorismate mutase / prephenate dehydratase  33.71 
 
 
365 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.356586  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1497  P-protein (prephenate dehydratase / chorismate mutase)  36.16 
 
 
374 aa  220  3e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554673  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0961  chorismate mutase  34.52 
 
 
374 aa  219  6e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  36.44 
 
 
365 aa  219  6e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00716  P-protein  34.28 
 
 
402 aa  219  7e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00262272  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0904  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.14 
 
 
371 aa  218  8.999999999999998e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2793  chorismate mutase  34.91 
 
 
360 aa  218  8.999999999999998e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163655 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0495  chorismate mutase  34.12 
 
 
359 aa  218  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0778684  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2858  chorismate mutase  37.36 
 
 
373 aa  217  2e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.42066  hitchhiker  0.0000000270068 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1792  chorismate mutase / prephenate dehydratase  34.9 
 
 
360 aa  216  4e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00027177 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1313  chorismate mutase  33.53 
 
 
359 aa  216  4e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  2.21838e-16 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2241  prephenate dehydratase / chorismate mutase  34.65 
 
 
370 aa  216  7e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4721  chorismate mutase  34.51 
 
 
366 aa  215  7e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.997566 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2475  chorismate mutase  35.23 
 
 
391 aa  215  8e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248764  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3121  chorismate mutase  33.92 
 
 
365 aa  214  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0293375 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1749  prephenate dehydratase  35.14 
 
 
418 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1538  chorismate mutase  37.18 
 
 
362 aa  214  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1204  chorismate mutase  34.9 
 
 
393 aa  214  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.973222  normal  0.768195 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1336  chorismate mutase  34.24 
 
 
413 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2583  prephenate dehydratase  33.33 
 
 
372 aa  212  9e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0009  chorismate mutase  33.99 
 
 
385 aa  211  1e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0176  chorismate mutase / prephenate dehydratase  37.57 
 
 
368 aa  211  1e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000165847  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1186  prephenate dehydratase  34.63 
 
 
393 aa  211  2e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.343107 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3282  chorismate mutase  33.33 
 
 
366 aa  209  4e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0668525  normal  0.62913 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4156  prephenate dehydratase / chorismate mutase  35.43 
 
 
360 aa  209  7e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2539  chorismate mutase  34.46 
 
 
399 aa  207  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.409768  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1569  chorismate mutase  34.31 
 
 
360 aa  207  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203479  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2466  chorismate mutase / prephenate dehydratase  33.04 
 
 
371 aa  207  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.148339 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>