More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1589 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1589  transcription termination factor NusA  100 
 
 		 359 aa  738    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1666  P-protein  84.96 
 
 		 359 aa  642    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0269  chorismate mutase/prephenate dehydratase  70.51 
 
 		 358 aa  540  9.999999999999999e-153  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0361  chorismate mutase/prephenate dehydratase  68.52 
 
 		 357 aa  503  1e-141  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1647  chorismate mutase/prephenate dehydratase  68.25 
 
 		 357 aa  503  1e-141  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000136907  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0338  chorismate mutase/prephenate dehydratase  68.25 
 
 		 357 aa  502  1e-141  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1360  chorismate mutase/prephenate dehydratase  68.72 
 
 		 357 aa  498  1e-140  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1299  chorismate mutase/prephenate dehydratase  64.35 
 
 		 359 aa  491  1e-137  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0216  chorismate mutase  64.25 
 
 		 355 aa  483  1e-135  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0470  chorismate mutase, gamma, beta and epsilon  53.57 
 
 		 363 aa  393  1e-108  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2767  chorismate mutase  47.77 
 
 		 357 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.642402 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2566  chorismate mutase  48.46 
 
 		 357 aa  335  7.999999999999999e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2723  chorismate mutase  39.5 
 
 		 381 aa  269  7e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  39.27 
 
 		 356 aa  260  3e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  39.66 
 
 		 359 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  39.66 
 
 		 359 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1887  chorismate mutase-P and prephenate dehydratase  40.96 
 
 		 360 aa  252  6e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000192693  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  39.83 
 
 		 373 aa  247  2e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3039  chorismate mutase  37.5 
 
 		 355 aa  246  6e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1345  chorismate mutase  39.32 
 
 		 359 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0801  chorismate mutase  40.51 
 
 		 359 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0862  prephenate dehydratase / chorismate mutase  38.42 
 
 		 368 aa  241  1e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1207  chorismate mutase  36.8 
 
 		 371 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0297935 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  37.96 
 
 		 358 aa  240  4e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2192  chorismate mutase  37.01 
 
 		 355 aa  238  1e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1462  prephenate dehydratase  39.32 
 
 		 358 aa  236  3e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0174  chorismate mutase  37.54 
 
 		 361 aa  235  7e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0926  chorismate mutase / prephenate dehydratase  37.75 
 
 		 367 aa  235  9e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2608  chorismate mutase/prephenate dehydratase  38.81 
 
 		 358 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0121  prephenate dehydratase  39.83 
 
 		 356 aa  234  1.0000000000000001e-60  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3022  chorismate mutase  38.44 
 
 		 360 aa  234  1.0000000000000001e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.123559  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  36.9 
 
 		 371 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1950  prephenate dehydratase  37.96 
 
 		 366 aa  233  3e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6846  chorismate mutase  35.56 
 
 		 397 aa  233  5e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235672 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  37.78 
 
 		 367 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  37.5 
 
 		 364 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302882 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  37.78 
 
 		 364 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  37.05 
 
 		 365 aa  230  3e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1747  chorismate mutase/prephenate dehydratase  36.94 
 
 		 364 aa  230  4e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0966339  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3645  chorismate mutasea  36.94 
 
 		 364 aa  229  4e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  37.5 
 
 		 364 aa  229  6e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1963  chorismate mutase  37.05 
 
 		 365 aa  228  9e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  36.94 
 
 		 364 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  36.67 
 
 		 364 aa  228  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23280  chorismate mutase  37.05 
 
 		 365 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0897  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.41 
 
 		 358 aa  227  3e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.255743  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1019  chorismate mutase  35.41 
 
 		 358 aa  227  3e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.789998  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0568  chorismate mutase  38.66 
 
 		 362 aa  226  3e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1250  chorismate mutase  36.67 
 
 		 382 aa  223  4e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149804  normal  0.0219371 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0495  chorismate mutase  35.13 
 
 		 359 aa  223  6e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0778684  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1418  chorismate mutase/prephenate dehydratase  36.44 
 
 		 362 aa  222  9e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1313  chorismate mutase  35.13 
 
 		 359 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.21838e-16 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2809  prephenate dehydratase  35.85 
 
 		 372 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.433236  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0116  chorismate mutase  36.16 
 
 		 377 aa  220  3e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  32.67 
 
 		 382 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0977  prephenate dehydratase / chorismate mutase  35.61 
 
 		 360 aa  218  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.23904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0741  chorismate mutase  35.51 
 
 		 360 aa  218  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3006  chorismate mutase  35.61 
 
 		 360 aa  217  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224868  normal  0.0525817 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0951  chorismate mutase / prephenate dehydratase  35.23 
 
 		 365 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.356586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1686  chorismate mutase / prephenate dehydratase  37.78 
 
 		 355 aa  216  4e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0009  chorismate mutase  33.33 
 
 		 385 aa  216  4e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0716  prephenate dehydratase / chorismate mutase  32.39 
 
 		 387 aa  216  5e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.21 
 
 		 358 aa  216  7e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  35.03 
 
 		 358 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0432  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.9 
 
 		 360 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2997  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.9 
 
 		 360 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.379619  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2948  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.9 
 
 		 360 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2885  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.9 
 
 		 360 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.629426  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0961  chorismate mutase  32.96 
 
 		 374 aa  214  2.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0198  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.9 
 
 		 360 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0950  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.9 
 
 		 360 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2575  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.9 
 
 		 360 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1792  chorismate mutase / prephenate dehydratase  33.15 
 
 		 360 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027177 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1635  chorismate mutase/prephenate dehydratase  36.36 
 
 		 360 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0176  chorismate mutase / prephenate dehydratase  37.85 
 
 		 368 aa  213  5.999999999999999e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000165847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2793  chorismate mutase  33.98 
 
 		 360 aa  213  5.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163655 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  34.75 
 
 		 358 aa  212  7.999999999999999e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00716  P-protein  35.03 
 
 		 402 aa  212  9e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00262272  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3487  prephenate dehydratase  32.87 
 
 		 379 aa  209  4e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3121  chorismate mutase  33.15 
 
 		 365 aa  208  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0293375 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0845  chorismate mutase  32.29 
 
 		 371 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0602148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1394  chorismate mutase  32.96 
 
 		 371 aa  207  3e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0138573  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0774  chorismate mutase  31.99 
 
 		 371 aa  207  3e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.561025  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2466  chorismate mutase / prephenate dehydratase  32.96 
 
 		 371 aa  207  3e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.148339 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2241  prephenate dehydratase / chorismate mutase  32.58 
 
 		 370 aa  206  7e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2858  chorismate mutase  35.57 
 
 		 373 aa  204  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.42066  hitchhiker  0.0000000270068 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1569  chorismate mutase  33.15 
 
 		 360 aa  203  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203479  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0904  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.17 
 
 		 371 aa  203  5e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3282  chorismate mutase  32.02 
 
 		 366 aa  202  5e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0668525  normal  0.62913 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1023  chorismate mutase  35.65 
 
 		 365 aa  202  6e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1617  chorismate mutase  33.05 
 
 		 373 aa  202  8e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2583  prephenate dehydratase  33.05 
 
 		 372 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1749  prephenate dehydratase  32.58 
 
 		 418 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1442  chorismate mutase  33.33 
 
 		 374 aa  200  3.9999999999999996e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.105369  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4721  chorismate mutase  31.74 
 
 		 366 aa  200  3.9999999999999996e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997566 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2147  prephenate dehydratase  35.83 
 
 		 373 aa  199  7e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.707843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1232  prephenate dehydratase  35.13 
 
 		 363 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.964016 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1497  P-protein (prephenate dehydratase / chorismate mutase)  33.05 
 
 		 374 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554673  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1204  chorismate mutase  35.79 
 
 		 393 aa  197  3e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.973222  normal  0.768195 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1538  chorismate mutase  35.11 
 
 		 362 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>