More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2767 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2767  chorismate mutase  100 
 
 		 357 aa  732    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.642402 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2566  chorismate mutase  66.95 
 
 		 357 aa  514  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0470  chorismate mutase, gamma, beta and epsilon  53.09 
 
 		 363 aa  396  1e-109  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0216  chorismate mutase  51.69 
 
 		 355 aa  372  1e-102  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1666  P-protein  51.12 
 
 		 359 aa  355  5e-97  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0269  chorismate mutase/prephenate dehydratase  49.72 
 
 		 358 aa  355  7.999999999999999e-97  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0338  chorismate mutase/prephenate dehydratase  50.71 
 
 		 357 aa  342  5.999999999999999e-93  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0361  chorismate mutase/prephenate dehydratase  50.42 
 
 		 357 aa  340  2.9999999999999998e-92  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1647  chorismate mutase/prephenate dehydratase  50.42 
 
 		 357 aa  339  4e-92  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000136907  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1589  transcription termination factor NusA  47.77 
 
 		 359 aa  337  2.9999999999999997e-91  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1299  chorismate mutase/prephenate dehydratase  48.18 
 
 		 359 aa  334  1e-90  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1360  chorismate mutase/prephenate dehydratase  48.31 
 
 		 357 aa  326  3e-88  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1207  chorismate mutase  40.17 
 
 		 371 aa  263  4e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0297935 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3039  chorismate mutase  38.03 
 
 		 355 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3022  chorismate mutase  38.84 
 
 		 360 aa  253  3e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.123559  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2723  chorismate mutase  38.87 
 
 		 381 aa  249  4e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0121  prephenate dehydratase  38.12 
 
 		 356 aa  244  1.9999999999999999e-63  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  39 
 
 		 373 aa  243  3e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1462  prephenate dehydratase  39.78 
 
 		 358 aa  243  3e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2608  chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.22 
 
 		 358 aa  243  5e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  38.38 
 
 		 359 aa  242  9e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0174  chorismate mutase  37.78 
 
 		 361 aa  239  4e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  39.44 
 
 		 356 aa  238  1e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1345  chorismate mutase  38.7 
 
 		 359 aa  238  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0568  chorismate mutase  39.44 
 
 		 362 aa  238  1e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0926  chorismate mutase / prephenate dehydratase  39.06 
 
 		 367 aa  237  2e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1747  chorismate mutase/prephenate dehydratase  38.02 
 
 		 364 aa  236  3e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0966339  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  37.82 
 
 		 359 aa  236  4e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3645  chorismate mutasea  37.74 
 
 		 364 aa  236  6e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6846  chorismate mutase  37.81 
 
 		 397 aa  236  6e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235672 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0862  prephenate dehydratase / chorismate mutase  38.14 
 
 		 368 aa  235  9e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  36.91 
 
 		 364 aa  235  9e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  37.47 
 
 		 364 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  37.47 
 
 		 364 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0951  chorismate mutase / prephenate dehydratase  36.62 
 
 		 365 aa  231  2e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.356586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2192  chorismate mutase  35.85 
 
 		 355 aa  230  2e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0801  chorismate mutase  39.11 
 
 		 359 aa  229  6e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  36.36 
 
 		 364 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302882 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  36.64 
 
 		 367 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  36.64 
 
 		 364 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  34.08 
 
 		 382 aa  226  7e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1887  chorismate mutase-P and prephenate dehydratase  37.22 
 
 		 360 aa  226  7e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000192693  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0716  prephenate dehydratase / chorismate mutase  33.8 
 
 		 387 aa  226  7e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  35.96 
 
 		 358 aa  225  1e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23280  chorismate mutase  36.09 
 
 		 365 aa  225  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0774  chorismate mutase  33.71 
 
 		 371 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.561025  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3006  chorismate mutase  36.13 
 
 		 360 aa  224  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224868  normal  0.0525817 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1418  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.56 
 
 		 362 aa  223  4e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0845  chorismate mutase  33.71 
 
 		 371 aa  223  4e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0602148 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0432  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.57 
 
 		 360 aa  223  4e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2997  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.57 
 
 		 360 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.379619  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2948  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.57 
 
 		 360 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0950  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.57 
 
 		 360 aa  223  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1635  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.85 
 
 		 360 aa  223  4e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2575  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.57 
 
 		 360 aa  223  4e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2885  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.57 
 
 		 360 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.629426  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0198  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.57 
 
 		 360 aa  223  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0741  chorismate mutase  36.03 
 
 		 360 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1963  chorismate mutase  35.81 
 
 		 365 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  36.09 
 
 		 365 aa  223  4.9999999999999996e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0977  prephenate dehydratase / chorismate mutase  35.85 
 
 		 360 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.23904  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0904  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.62 
 
 		 371 aa  220  3e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  35.01 
 
 		 371 aa  220  3e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0176  chorismate mutase / prephenate dehydratase  38.19 
 
 		 368 aa  219  6e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000165847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0961  chorismate mutase  34.17 
 
 		 374 aa  218  1e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2241  prephenate dehydratase / chorismate mutase  34.03 
 
 		 370 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1686  chorismate mutase / prephenate dehydratase  36.41 
 
 		 355 aa  216  4e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1232  prephenate dehydratase  37.64 
 
 		 363 aa  215  7e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.964016 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1336  chorismate mutase  35.01 
 
 		 413 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2147  prephenate dehydratase  35.44 
 
 		 373 aa  213  2.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.707843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0897  chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.64 
 
 		 358 aa  213  5.999999999999999e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.255743  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1019  chorismate mutase  34.64 
 
 		 358 aa  213  5.999999999999999e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.789998  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0116  chorismate mutase  34.53 
 
 		 377 aa  211  1e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1792  chorismate mutase / prephenate dehydratase  32.77 
 
 		 360 aa  210  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027177 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00716  P-protein  33.61 
 
 		 402 aa  210  3e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00262272  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1023  chorismate mutase  37.05 
 
 		 365 aa  210  3e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1950  prephenate dehydratase  36.9 
 
 		 366 aa  209  5e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1394  chorismate mutase  31.93 
 
 		 371 aa  208  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0138573  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2466  chorismate mutase / prephenate dehydratase  31.93 
 
 		 371 aa  208  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.148339 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4156  prephenate dehydratase / chorismate mutase  36.41 
 
 		 360 aa  206  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2793  chorismate mutase  32.77 
 
 		 360 aa  206  4e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163655 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1442  chorismate mutase  34.45 
 
 		 374 aa  204  1e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.105369  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0336  chorismate mutase  34.24 
 
 		 419 aa  205  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2261  chorismate mutase  36.13 
 
 		 360 aa  204  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.561054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0495  chorismate mutase  32.77 
 
 		 359 aa  204  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0778684  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2858  chorismate mutase  35.26 
 
 		 373 aa  204  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.42066  hitchhiker  0.0000000270068 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1250  chorismate mutase  34.62 
 
 		 382 aa  204  2e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149804  normal  0.0219371 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1193  chorismate mutase  32.87 
 
 		 366 aa  203  3e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1497  P-protein (prephenate dehydratase / chorismate mutase)  34.45 
 
 		 374 aa  203  4e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554673  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1043  chorismate mutase  36.41 
 
 		 360 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2809  prephenate dehydratase  34.93 
 
 		 372 aa  202  5e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.433236  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3121  chorismate mutase  31.84 
 
 		 365 aa  202  6e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0293375 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3282  chorismate mutase  31.28 
 
 		 366 aa  202  7e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0668525  normal  0.62913 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1002  chorismate mutase  36.41 
 
 		 360 aa  202  9e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1569  chorismate mutase  34.45 
 
 		 360 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203479  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1538  chorismate mutase  36.94 
 
 		 362 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4721  chorismate mutase  31.01 
 
 		 366 aa  201  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997566 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1617  chorismate mutase  32.21 
 
 		 373 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0923  chorismate mutase  36.13 
 
 		 360 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.432858 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0919  chorismate mutase  36.13 
 
 		 360 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0585516  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>