More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0774 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0904  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  95.69 
 
 		 371 aa  715    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0774  chorismate mutase  100 
 
 		 371 aa  769    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.561025  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0845  chorismate mutase  99.46 
 
 		 371 aa  764    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0602148 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  74.25 
 
 		 382 aa  579  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0716  prephenate dehydratase / chorismate mutase  76.04 
 
 		 387 aa  580  1e-164  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0977  prephenate dehydratase / chorismate mutase  62.85 
 
 		 360 aa  441  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.23904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3006  chorismate mutase  63.13 
 
 		 360 aa  443  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224868  normal  0.0525817 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0950  chorismate mutase/prephenate dehydratase  61.17 
 
 		 360 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0432  chorismate mutase/prephenate dehydratase  61.17 
 
 		 360 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2997  chorismate mutase/prephenate dehydratase  61.17 
 
 		 360 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.379619  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2575  chorismate mutase/prephenate dehydratase  61.17 
 
 		 360 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1635  chorismate mutase/prephenate dehydratase  61.45 
 
 		 360 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2885  chorismate mutase/prephenate dehydratase  61.17 
 
 		 360 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.629426  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0198  chorismate mutase/prephenate dehydratase  61.17 
 
 		 360 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2948  chorismate mutase/prephenate dehydratase  61.17 
 
 		 360 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0495  chorismate mutase  61.03 
 
 		 359 aa  435  1e-121  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0778684  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0741  chorismate mutase  60.89 
 
 		 360 aa  431  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1313  chorismate mutase  60.17 
 
 		 359 aa  430  1e-119  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.21838e-16 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4156  prephenate dehydratase / chorismate mutase  61.17 
 
 		 360 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2261  chorismate mutase  61.17 
 
 		 360 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.561054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0961  chorismate mutase  57.66 
 
 		 374 aa  413  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1792  chorismate mutase / prephenate dehydratase  56.3 
 
 		 360 aa  409  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027177 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1002  chorismate mutase  61.45 
 
 		 360 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1043  chorismate mutase  61.45 
 
 		 360 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2793  chorismate mutase  55.46 
 
 		 360 aa  402  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163655 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0919  chorismate mutase  60.89 
 
 		 360 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0585516  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0923  chorismate mutase  60.89 
 
 		 360 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.432858 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1617  chorismate mutase  56.66 
 
 		 373 aa  395  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4721  chorismate mutase  56.21 
 
 		 366 aa  395  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997566 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3121  chorismate mutase  55.65 
 
 		 365 aa  390  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0293375 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1394  chorismate mutase  54.67 
 
 		 371 aa  389  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0138573  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2466  chorismate mutase / prephenate dehydratase  54.67 
 
 		 371 aa  389  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.148339 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3039  chorismate mutase  52.11 
 
 		 355 aa  386  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2192  chorismate mutase  52.79 
 
 		 355 aa  387  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0564  chorismate mutase  61.11 
 
 		 362 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3282  chorismate mutase  55.06 
 
 		 366 aa  388  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0668525  normal  0.62913 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2241  prephenate dehydratase / chorismate mutase  55.27 
 
 		 370 aa  384  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1569  chorismate mutase  54.9 
 
 		 360 aa  377  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203479  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0951  chorismate mutase / prephenate dehydratase  50.99 
 
 		 365 aa  374  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.356586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1207  chorismate mutase  50.56 
 
 		 371 aa  366  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0297935 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1232  prephenate dehydratase  53.5 
 
 		 363 aa  364  2e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.964016 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  48.32 
 
 		 364 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  48.6 
 
 		 364 aa  361  9e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  48.32 
 
 		 367 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  48.32 
 
 		 364 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0174  chorismate mutase  48.87 
 
 		 361 aa  359  5e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1747  chorismate mutase/prephenate dehydratase  48.32 
 
 		 364 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0966339  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  47.77 
 
 		 364 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302882 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  47.12 
 
 		 373 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3645  chorismate mutasea  47.77 
 
 		 364 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  48.2 
 
 		 364 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1686  chorismate mutase / prephenate dehydratase  51.28 
 
 		 355 aa  355  5e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  47.49 
 
 		 365 aa  350  2e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1538  chorismate mutase  51.98 
 
 		 362 aa  347  2e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23280  chorismate mutase  46.09 
 
 		 365 aa  347  2e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1418  chorismate mutase/prephenate dehydratase  48.31 
 
 		 362 aa  345  5e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1963  chorismate mutase  45.81 
 
 		 365 aa  345  6e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2147  prephenate dehydratase  47.43 
 
 		 373 aa  334  1e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.707843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1336  chorismate mutase  45.26 
 
 		 413 aa  332  5e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00716  P-protein  45.26 
 
 		 402 aa  328  7e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00262272  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1250  chorismate mutase  45.03 
 
 		 382 aa  326  5e-88  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149804  normal  0.0219371 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23140  chorismate mutase, clade 2  47.8 
 
 		 706 aa  325  6e-88  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.839893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0801  chorismate mutase  42.33 
 
 		 359 aa  322  8e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2858  chorismate mutase  46.34 
 
 		 373 aa  320  1.9999999999999998e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.42066  hitchhiker  0.0000000270068 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  44.44 
 
 		 359 aa  320  3e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1186  prephenate dehydratase  45.03 
 
 		 393 aa  318  6e-86  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.343107 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0568  chorismate mutase  47.61 
 
 		 362 aa  318  7.999999999999999e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0897  chorismate mutase/prephenate dehydratase  46.18 
 
 		 358 aa  318  9e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.255743  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1019  chorismate mutase  46.18 
 
 		 358 aa  318  9e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.789998  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0926  chorismate mutase / prephenate dehydratase  45.5 
 
 		 367 aa  317  1e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1023  chorismate mutase  46.37 
 
 		 365 aa  318  1e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1204  chorismate mutase  45.03 
 
 		 393 aa  317  2e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.973222  normal  0.768195 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1193  chorismate mutase  41.36 
 
 		 366 aa  316  5e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1442  chorismate mutase  43.87 
 
 		 374 aa  315  8e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.105369  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1887  chorismate mutase-P and prephenate dehydratase  44.7 
 
 		 360 aa  315  9.999999999999999e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000192693  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  44.16 
 
 		 359 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1497  P-protein (prephenate dehydratase / chorismate mutase)  43.6 
 
 		 374 aa  312  4.999999999999999e-84  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554673  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  45.01 
 
 		 358 aa  311  9e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1345  chorismate mutase  44.22 
 
 		 359 aa  309  5e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0862  prephenate dehydratase / chorismate mutase  44.44 
 
 		 368 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2608  chorismate mutase/prephenate dehydratase  45.01 
 
 		 358 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1462  prephenate dehydratase  43.02 
 
 		 358 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2539  chorismate mutase  43.5 
 
 		 399 aa  300  2e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.409768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  39.94 
 
 		 356 aa  299  5e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0121  prephenate dehydratase  38.59 
 
 		 356 aa  272  8.000000000000001e-72  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2723  chorismate mutase  37.14 
 
 		 381 aa  267  2e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0176  chorismate mutase / prephenate dehydratase  41.48 
 
 		 368 aa  266  2.9999999999999995e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000165847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3022  chorismate mutase  39.34 
 
 		 360 aa  265  8e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.123559  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  38.07 
 
 		 371 aa  263  4e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0336  chorismate mutase  38.52 
 
 		 419 aa  261  1e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3487  prephenate dehydratase  37.32 
 
 		 379 aa  260  3e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2475  chorismate mutase  40.23 
 
 		 391 aa  259  7e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0969  prephenate dehydratase  51.5 
 
 		 280 aa  257  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.507901  normal  0.0127974 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0009  chorismate mutase  36.93 
 
 		 385 aa  254  2.0000000000000002e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1950  prephenate dehydratase  38.35 
 
 		 366 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1749  prephenate dehydratase  38.89 
 
 		 418 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2809  prephenate dehydratase  38.42 
 
 		 372 aa  253  3e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.433236  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6846  chorismate mutase  36.68 
 
 		 397 aa  248  9e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235672 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2566  chorismate mutase  37.29 
 
 		 357 aa  247  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0116  chorismate mutase  37.75 
 
 		 377 aa  246  3e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>