More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2566 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2566  chorismate mutase  100 
 
 		 357 aa  733    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2767  chorismate mutase  66.95 
 
 		 357 aa  514  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.642402 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0470  chorismate mutase, gamma, beta and epsilon  55.46 
 
 		 363 aa  409  1e-113  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0216  chorismate mutase  49.58 
 
 		 355 aa  358  9e-98  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1666  P-protein  49.3 
 
 		 359 aa  338  9e-92  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1589  transcription termination factor NusA  48.46 
 
 		 359 aa  335  7.999999999999999e-91  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0269  chorismate mutase/prephenate dehydratase  46.37 
 
 		 358 aa  333  2e-90  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0338  chorismate mutase/prephenate dehydratase  49.01 
 
 		 357 aa  328  1.0000000000000001e-88  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0361  chorismate mutase/prephenate dehydratase  48.73 
 
 		 357 aa  326  4.0000000000000003e-88  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1647  chorismate mutase/prephenate dehydratase  48.73 
 
 		 357 aa  325  5e-88  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000136907  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1360  chorismate mutase/prephenate dehydratase  47.31 
 
 		 357 aa  314  9.999999999999999e-85  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1299  chorismate mutase/prephenate dehydratase  44.26 
 
 		 359 aa  310  2.9999999999999997e-83  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3039  chorismate mutase  39.27 
 
 		 355 aa  257  2e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1207  chorismate mutase  42.7 
 
 		 371 aa  255  7e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0297935 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0121  prephenate dehydratase  38.16 
 
 		 356 aa  248  1e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0845  chorismate mutase  37.14 
 
 		 371 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0602148 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0774  chorismate mutase  37.14 
 
 		 371 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.561025  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3006  chorismate mutase  40.17 
 
 		 360 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224868  normal  0.0525817 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2192  chorismate mutase  38.59 
 
 		 355 aa  242  6e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0904  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.75 
 
 		 371 aa  241  1e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0951  chorismate mutase / prephenate dehydratase  40 
 
 		 365 aa  241  1e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.356586  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1418  chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.44 
 
 		 362 aa  241  2e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0716  prephenate dehydratase / chorismate mutase  35.03 
 
 		 387 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2723  chorismate mutase  38.87 
 
 		 381 aa  239  5.999999999999999e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0977  prephenate dehydratase / chorismate mutase  39.78 
 
 		 360 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.23904  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  38.1 
 
 		 359 aa  238  1e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3022  chorismate mutase  37.36 
 
 		 360 aa  235  9e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.123559  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2608  chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.61 
 
 		 358 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  34.18 
 
 		 382 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  37.82 
 
 		 359 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0862  prephenate dehydratase / chorismate mutase  39.5 
 
 		 368 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  37.99 
 
 		 373 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0741  chorismate mutase  39.22 
 
 		 360 aa  231  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1635  chorismate mutase/prephenate dehydratase  38.76 
 
 		 360 aa  230  3e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  38.61 
 
 		 364 aa  230  3e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1462  prephenate dehydratase  39.22 
 
 		 358 aa  229  5e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23280  chorismate mutase  38.84 
 
 		 365 aa  229  6e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2885  chorismate mutase/prephenate dehydratase  38.1 
 
 		 360 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.629426  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0198  chorismate mutase/prephenate dehydratase  38.1 
 
 		 360 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0432  chorismate mutase/prephenate dehydratase  38.1 
 
 		 360 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2997  chorismate mutase/prephenate dehydratase  38.1 
 
 		 360 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.379619  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0950  chorismate mutase/prephenate dehydratase  38.1 
 
 		 360 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2575  chorismate mutase/prephenate dehydratase  38.1 
 
 		 360 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0568  chorismate mutase  39.94 
 
 		 362 aa  228  1e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2948  chorismate mutase/prephenate dehydratase  38.1 
 
 		 360 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1963  chorismate mutase  38.57 
 
 		 365 aa  227  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1887  chorismate mutase-P and prephenate dehydratase  37.71 
 
 		 360 aa  227  2e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000192693  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  39.17 
 
 		 364 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302882 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1345  chorismate mutase  38.1 
 
 		 359 aa  228  2e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3645  chorismate mutasea  38.29 
 
 		 364 aa  226  3e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6846  chorismate mutase  38.8 
 
 		 397 aa  227  3e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235672 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  37.78 
 
 		 364 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0495  chorismate mutase  37.29 
 
 		 359 aa  226  4e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0778684  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0926  chorismate mutase / prephenate dehydratase  38.55 
 
 		 367 aa  226  4e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  38.89 
 
 		 367 aa  226  6e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  38.89 
 
 		 364 aa  226  7e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  38.06 
 
 		 364 aa  225  9e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0176  chorismate mutase / prephenate dehydratase  40.5 
 
 		 368 aa  224  1e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000165847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1232  prephenate dehydratase  40.17 
 
 		 363 aa  224  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.964016 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0961  chorismate mutase  36.13 
 
 		 374 aa  223  4e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1747  chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.22 
 
 		 364 aa  223  6e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0966339  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  37.29 
 
 		 356 aa  222  7e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  38.06 
 
 		 365 aa  220  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1792  chorismate mutase / prephenate dehydratase  35.01 
 
 		 360 aa  219  6e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027177 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1313  chorismate mutase  37.01 
 
 		 359 aa  219  6e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.21838e-16 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2241  prephenate dehydratase / chorismate mutase  36.13 
 
 		 370 aa  219  7e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0174  chorismate mutase  36.59 
 
 		 361 aa  219  7e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0116  chorismate mutase  36.97 
 
 		 377 aa  219  7e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  36.16 
 
 		 371 aa  218  1e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0801  chorismate mutase  37.85 
 
 		 359 aa  218  1e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1686  chorismate mutase / prephenate dehydratase  38.59 
 
 		 355 aa  218  2e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1394  chorismate mutase  34.64 
 
 		 371 aa  216  4e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0138573  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1186  prephenate dehydratase  35.69 
 
 		 393 aa  216  4e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.343107 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2466  chorismate mutase / prephenate dehydratase  34.64 
 
 		 371 aa  216  4e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.148339 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3282  chorismate mutase  35.57 
 
 		 366 aa  216  5.9999999999999996e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0668525  normal  0.62913 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1193  chorismate mutase  34.73 
 
 		 366 aa  215  8e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1950  prephenate dehydratase  37.01 
 
 		 366 aa  215  8e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  35.49 
 
 		 358 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3121  chorismate mutase  35.01 
 
 		 365 aa  213  4.9999999999999996e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0293375 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1569  chorismate mutase  37.71 
 
 		 360 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203479  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1204  chorismate mutase  35.15 
 
 		 393 aa  213  5.999999999999999e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.973222  normal  0.768195 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1250  chorismate mutase  34.89 
 
 		 382 aa  212  7e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149804  normal  0.0219371 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1023  chorismate mutase  37.33 
 
 		 365 aa  212  9e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1336  chorismate mutase  34.93 
 
 		 413 aa  211  1e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2793  chorismate mutase  34.73 
 
 		 360 aa  211  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163655 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4156  prephenate dehydratase / chorismate mutase  38.76 
 
 		 360 aa  210  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1019  chorismate mutase  36.13 
 
 		 358 aa  209  4e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.789998  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0897  chorismate mutase/prephenate dehydratase  36.13 
 
 		 358 aa  209  4e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.255743  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1617  chorismate mutase  34.08 
 
 		 373 aa  210  4e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2858  chorismate mutase  36.54 
 
 		 373 aa  210  4e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.42066  hitchhiker  0.0000000270068 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4721  chorismate mutase  33.61 
 
 		 366 aa  209  7e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997566 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2147  prephenate dehydratase  36.21 
 
 		 373 aa  209  8e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.707843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2261  chorismate mutase  38.48 
 
 		 360 aa  209  8e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.561054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0923  chorismate mutase  38.76 
 
 		 360 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.432858 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0919  chorismate mutase  38.76 
 
 		 360 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0585516  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1043  chorismate mutase  38.76 
 
 		 360 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0336  chorismate mutase  37.5 
 
 		 419 aa  207  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0009  chorismate mutase  34.16 
 
 		 385 aa  207  3e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1002  chorismate mutase  38.48 
 
 		 360 aa  206  7e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23140  chorismate mutase, clade 2  35.36 
 
 		 706 aa  205  1e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.839893  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>