More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0474 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0474  Prephenate dehydratase  100 
 
 		 279 aa  580  1.0000000000000001e-165  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0537  prephenate dehydratase  83.87 
 
 		 279 aa  491  9.999999999999999e-139  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0656  Prephenate dehydratase  80.73 
 
 		 276 aa  463  1e-129  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.416459  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1644  prephenate dehydratase  79.14 
 
 		 280 aa  454  1e-127  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0495  Prephenate dehydratase  75.54 
 
 		 279 aa  433  1e-120  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0541  Prephenate dehydratase  72.76 
 
 		 279 aa  428  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0180  prephenate dehydratase  73.08 
 
 		 283 aa  429  1e-119  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13638  predicted protein  49.31 
 
 		 348 aa  233  3e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_3267  predicted protein  45.1 
 
 		 304 aa  226  4e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2043  prephenate dehydratase  44.6 
 
 		 283 aa  223  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.64689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0877  Prephenate dehydratase  42.91 
 
 		 288 aa  219  3e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0633  Prephenate dehydratase  46.07 
 
 		 285 aa  217  2e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  41.73 
 
 		 358 aa  214  9e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  41.37 
 
 		 358 aa  208  8e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  41.01 
 
 		 358 aa  205  5e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1293  Prephenate dehydratase  43.17 
 
 		 293 aa  202  3e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.821795  normal  0.378721 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2091  Chorismate mutase  41.45 
 
 		 280 aa  195  7e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.746584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1567  prephenate dehydratase  38.32 
 
 		 271 aa  191  1e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1341  prephenate dehydratase  36.3 
 
 		 384 aa  181  1e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.409344  normal  0.126516 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1424  prephenate dehydratase  37.05 
 
 		 274 aa  176  3e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000368391  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2153  Prephenate dehydratase  39.21 
 
 		 277 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2061  Prephenate dehydratase  39.21 
 
 		 277 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1779  prephenate dehydratase  38.49 
 
 		 277 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.490374  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4087  prephenate dehydratase  37.73 
 
 		 290 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1345  prephenate dehydratase  40.88 
 
 		 379 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2361  prephenate dehydratase  39.78 
 
 		 277 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.814265  normal  0.327119 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4403  prephenate dehydratase  37 
 
 		 284 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1767  prephenate dehydratase  38.38 
 
 		 284 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0567003 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3732  prephenate dehydratase  37.99 
 
 		 286 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.755175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4083  prephenate dehydratase  36.63 
 
 		 284 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0689378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0706  prephenate dehydratase  39.42 
 
 		 300 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.146743  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3538  prephenate dehydratase  38.03 
 
 		 284 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1881  prephenate dehydratase  39.49 
 
 		 298 aa  169  3e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.858484 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7058  prephenate dehydratase  37.41 
 
 		 286 aa  169  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3724  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  36.36 
 
 		 632 aa  169  4e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3518  prephenate dehydratase  38.46 
 
 		 310 aa  169  6e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3428  prephenate dehydratase  36.26 
 
 		 284 aa  168  7e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4217  prephenate dehydratase  37.77 
 
 		 280 aa  168  8e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.239434  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0037  prephenate dehydratase  37.41 
 
 		 287 aa  167  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.51728  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1059  chorismate mutase  32.97 
 
 		 657 aa  167  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.850871  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3039  chorismate mutase  36.56 
 
 		 355 aa  167  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2828  prephenate dehydratase / chorismate mutase  32.5 
 
 		 667 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2910  prephenate dehydratase / chorismate mutase  32.5 
 
 		 667 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3007  chorismate mutase / prephenate dehydratase  32.5 
 
 		 667 aa  167  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0037  prephenate dehydratase  37.41 
 
 		 287 aa  167  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.771092  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0018  prephenate dehydratase  37.41 
 
 		 287 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0881  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.93 
 
 		 385 aa  166  4e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.304992  normal  0.0807055 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0105  prephenate dehydratase  39.44 
 
 		 265 aa  166  4e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1297  chorismate mutase  32.62 
 
 		 664 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2629  prephenate dehydratase  37.36 
 
 		 286 aa  166  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.216997 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1367  chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.5 
 
 		 671 aa  166  5e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3093  chorismate mutase  32.62 
 
 		 664 aa  166  5e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0115511 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1220  chorismate mutase  32.62 
 
 		 664 aa  166  5e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.950276  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1264  chorismate mutase  32.62 
 
 		 664 aa  166  5e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.728983  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3606  Prephenate dehydratase  36.86 
 
 		 285 aa  165  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0845  chorismate mutase  37.32 
 
 		 371 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0602148 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1168  chorismate mutase  31.54 
 
 		 662 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1072  chorismate mutase  32.86 
 
 		 654 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0642  prephenate dehydratase  37.23 
 
 		 287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0930161  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0653  prephenate dehydratase  36.69 
 
 		 280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1207  chorismate mutase  36.46 
 
 		 371 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0297935 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1133  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.88 
 
 		 386 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.898271  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0252  prephenate dehydratase  37.18 
 
 		 293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0937  prephenate dehydratase  37.82 
 
 		 272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1177  chorismate mutase  32.26 
 
 		 659 aa  163  3e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0102  prephenate dehydratase  35.64 
 
 		 287 aa  163  4.0000000000000004e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.29138  normal  0.214423 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0774  chorismate mutase  36.96 
 
 		 371 aa  162  6e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.561025  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0524  prephenate dehydratase  37.82 
 
 		 277 aa  162  6e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0734392  normal  0.460167 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1263  chorismate mutase  32.26 
 
 		 662 aa  162  6e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0015659 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2723  chorismate mutase  36 
 
 		 381 aa  161  9e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0511  prephenate dehydratase  35.53 
 
 		 284 aa  161  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0365  prephenate dehydratase  36.62 
 
 		 286 aa  161  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1334  prephenate dehydratase  40.78 
 
 		 303 aa  161  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3077  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.13 
 
 		 396 aa  160  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0866115  normal  0.0319555 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0285  prephenate dehydratase  36.27 
 
 		 286 aa  160  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.224737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0174  chorismate mutase  36.33 
 
 		 361 aa  160  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2913  chorismate mutase  31.9 
 
 		 648 aa  160  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3355  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.52 
 
 		 385 aa  160  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2192  chorismate mutase  36.96 
 
 		 355 aa  160  3e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3482  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.52 
 
 		 385 aa  160  3e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.335091 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1620  prephenate dehydratase  35.61 
 
 		 284 aa  160  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159121  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3218  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.52 
 
 		 385 aa  160  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.631051  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1809  prephenate dehydratase  36.59 
 
 		 295 aa  160  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.115737 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2951  prephenate dehydratase  38.1 
 
 		 286 aa  159  4e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.217306 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1142  prephenate dehydratase  36.4 
 
 		 269 aa  159  6e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  34.91 
 
 		 365 aa  158  8e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3912  Prephenate dehydratase  36.33 
 
 		 288 aa  158  9e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0741  chorismate mutase  39.21 
 
 		 360 aa  158  9e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0904  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  36.23 
 
 		 371 aa  158  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2811  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.85 
 
 		 386 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2880  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.85 
 
 		 386 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.151676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2882  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.85 
 
 		 386 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.34961 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2861  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.85 
 
 		 386 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0154655 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2994  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.85 
 
 		 386 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3146  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.16 
 
 		 386 aa  157  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.831222  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1988  prephenate dehydratase  38.1 
 
 		 287 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.630591  normal  0.549246 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1686  chorismate mutase / prephenate dehydratase  35.14 
 
 		 355 aa  156  3e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0047  prephenate dehydratase  34.88 
 
 		 269 aa  156  3e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  34.55 
 
 		 364 aa  156  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0499  prephenate dehydratase  33.69 
 
 		 278 aa  156  4e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>