More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1779 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_1779  prephenate dehydratase  100 
 
 
277 aa  546  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.490374  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2153  Prephenate dehydratase  97.83 
 
 
277 aa  535  1e-151  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2061  Prephenate dehydratase  97.83 
 
 
277 aa  535  1e-151  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2039  prephenate dehydratase  76.81 
 
 
275 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402041 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1153  Prephenate dehydratase  49.82 
 
 
276 aa  255  7e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2260  prephenate dehydratase  40.44 
 
 
278 aa  235  6e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1964  prephenate dehydratase  44 
 
 
279 aa  230  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.221167 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1244  Prephenate dehydratase  45.02 
 
 
283 aa  230  2e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1424  prephenate dehydratase  40.15 
 
 
274 aa  227  1e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000368391  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1904  prephenate dehydratase  46.35 
 
 
372 aa  227  2e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0916421  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0937  prephenate dehydratase  43.84 
 
 
272 aa  223  2e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0097  Prephenate dehydratase  50.18 
 
 
306 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1552  prephenate dehydratase  42.44 
 
 
279 aa  221  9.999999999999999e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0248162  normal  0.310445 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0008  Prephenate dehydratase  48.01 
 
 
279 aa  212  3.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0078  prephenate dehydratase  40.15 
 
 
280 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0545378  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0121  Prephenate dehydratase  47.08 
 
 
305 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4445  prephenate dehydratase  44.12 
 
 
274 aa  207  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0806  prephenate dehydratase  38.08 
 
 
284 aa  207  2e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01900  Prephenate dehydratase  39.22 
 
 
303 aa  206  3e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1930  prephenate dehydratase  41.16 
 
 
311 aa  206  4e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.898282 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0071  prephenate dehydratase  45.99 
 
 
324 aa  204  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  44.32 
 
 
386 aa  203  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01130  prephenate dehydratase  44.49 
 
 
316 aa  203  3e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  44.2 
 
 
371 aa  202  4e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0282  Prephenate dehydratase  44.89 
 
 
326 aa  202  4e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.209842 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0141  Prephenate dehydratase  45.26 
 
 
306 aa  201  8e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341146  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2105  prephenate dehydratase  45.45 
 
 
318 aa  198  9e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.547731 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1887  chorismate mutase-P and prephenate dehydratase  41.76 
 
 
360 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000192693  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  39.05 
 
 
373 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0138  prephenate dehydratase  41.67 
 
 
327 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1594  prephenate dehydratase  34.06 
 
 
311 aa  195  7e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00716  P-protein  38.97 
 
 
402 aa  195  7e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00262272  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5270  Prephenate dehydratase  42.6 
 
 
315 aa  195  7e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271199  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1293  Prephenate dehydratase  44.2 
 
 
293 aa  194  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.821795  normal  0.378721 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1497  P-protein (prephenate dehydratase / chorismate mutase)  39.42 
 
 
374 aa  194  1e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554673  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3051  Prephenate dehydratase  40 
 
 
286 aa  194  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0268  Prephenate dehydratase  47.45 
 
 
311 aa  194  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1442  chorismate mutase  39.05 
 
 
374 aa  192  5e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.105369  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1334  prephenate dehydratase  41.76 
 
 
280 aa  192  6e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000128945  normal  0.202615 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0633  Prephenate dehydratase  45.82 
 
 
285 aa  191  9e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  39.34 
 
 
359 aa  191  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1345  chorismate mutase  41.03 
 
 
359 aa  191  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3053  prephenate dehydratase  42.45 
 
 
315 aa  190  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3039  chorismate mutase  39.48 
 
 
355 aa  190  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1336  chorismate mutase  40.14 
 
 
413 aa  190  2e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6401  Prephenate dehydratase  44.49 
 
 
305 aa  189  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2485  prephenate dehydratase  43.96 
 
 
349 aa  189  4e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08570  prephenate dehydratase  38.35 
 
 
286 aa  188  5.999999999999999e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0097  Prephenate dehydratase  44.89 
 
 
314 aa  188  8e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0315701 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2535  prephenate dehydratase  35.21 
 
 
282 aa  188  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  38.97 
 
 
359 aa  187  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2091  Chorismate mutase  42.81 
 
 
280 aa  187  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.746584  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0774  chorismate mutase  38.77 
 
 
371 aa  186  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.561025  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1594  prephenate dehydratase  42.96 
 
 
317 aa  186  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0572712  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0845  chorismate mutase  38.77 
 
 
371 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0602148 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3645  chorismate mutasea  35.66 
 
 
364 aa  185  6e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734175  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  39.34 
 
 
358 aa  185  6e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1207  chorismate mutase  40.07 
 
 
371 aa  185  7e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0297935 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0904  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  38.41 
 
 
371 aa  185  8e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  36 
 
 
367 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1747  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.29 
 
 
364 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0966339  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  36.03 
 
 
365 aa  184  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  36 
 
 
364 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  36.36 
 
 
364 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0302882 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23140  chorismate mutase, clade 2  42.11 
 
 
706 aa  184  2.0000000000000003e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.839893  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  35.66 
 
 
364 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  38.38 
 
 
356 aa  183  3e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  36 
 
 
364 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  38.46 
 
 
358 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4522  prephenate dehydratase  44.73 
 
 
318 aa  182  6e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1462  prephenate dehydratase  37.87 
 
 
358 aa  181  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1418  chorismate mutase/prephenate dehydratase  38.97 
 
 
362 aa  181  1e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  35.66 
 
 
364 aa  181  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.34 
 
 
358 aa  180  2e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1284  prephenate dehydratase  36.59 
 
 
295 aa  180  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000630901  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13872  prephenate dehydratase  41.64 
 
 
321 aa  180  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2723  chorismate mutase  37.5 
 
 
381 aa  180  2.9999999999999997e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2608  chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.71 
 
 
358 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0951  chorismate mutase / prephenate dehydratase  39.78 
 
 
365 aa  178  8e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.356586  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23280  chorismate mutase  34.19 
 
 
365 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1096  Prephenate dehydratase  37.68 
 
 
288 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5032  prephenate dehydratase  44.69 
 
 
318 aa  177  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1067  Prephenate dehydratase  37.68 
 
 
288 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2192  chorismate mutase  38.91 
 
 
355 aa  176  3e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  37.55 
 
 
358 aa  176  4e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0877  Prephenate dehydratase  37.86 
 
 
288 aa  176  5e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1567  prephenate dehydratase  34.93 
 
 
271 aa  175  6e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0862  prephenate dehydratase / chorismate mutase  38.97 
 
 
368 aa  175  8e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1274  Prephenate dehydratase  38.83 
 
 
283 aa  175  8e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.143438  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2147  prephenate dehydratase  34.56 
 
 
373 aa  174  9.999999999999999e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.707843  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1963  chorismate mutase  33.82 
 
 
365 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5662  prephenate dehydratase  43.16 
 
 
312 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.963646  normal  0.0943658 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0474  Prephenate dehydratase  38.49 
 
 
279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0665  prephenate dehydratase  37.28 
 
 
293 aa  174  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.27815  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0009  chorismate mutase  38.04 
 
 
385 aa  173  2.9999999999999996e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0121  prephenate dehydratase  34.93 
 
 
356 aa  173  2.9999999999999996e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0914  prephenate dehydratase  38.73 
 
 
282 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06790  prephenate dehydratase  41.18 
 
 
325 aa  171  1e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.299471  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1145  prephenate dehydratase  41.84 
 
 
309 aa  171  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0149983  normal  0.0340431 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  34.8 
 
 
382 aa  170  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>