More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0511 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0511  prephenate dehydratase  100 
 
 		 284 aa  579  1e-164  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1620  prephenate dehydratase  90.85 
 
 		 284 aa  533  1e-150  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159121  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0418  Prephenate dehydratase  77.3 
 
 		 287 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0384  Prephenate dehydratase  76.24 
 
 		 285 aa  443  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.020412  normal  0.492047 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3650  prephenate dehydratase  77.66 
 
 		 285 aa  441  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.243627  normal  0.169343 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0339  prephenate dehydratase  76.24 
 
 		 285 aa  443  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3356  prephenate dehydratase  72.46 
 
 		 288 aa  417  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.539085  normal  0.173573 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7058  prephenate dehydratase  72.79 
 
 		 286 aa  412  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3538  prephenate dehydratase  71.43 
 
 		 284 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4217  prephenate dehydratase  71.9 
 
 		 280 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.239434  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1767  prephenate dehydratase  70.71 
 
 		 284 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0567003 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3732  prephenate dehydratase  70 
 
 		 286 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.755175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0365  prephenate dehydratase  69.96 
 
 		 286 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2629  prephenate dehydratase  65.22 
 
 		 286 aa  392  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.216997 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0285  prephenate dehydratase  69.15 
 
 		 286 aa  393  1e-108  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.224737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3912  Prephenate dehydratase  65.36 
 
 		 288 aa  379  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0170  prephenate dehydratase  66.9 
 
 		 287 aa  371  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0018  prephenate dehydratase  63.16 
 
 		 287 aa  371  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0252  prephenate dehydratase  62.91 
 
 		 293 aa  369  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396443  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0037  prephenate dehydratase  62.11 
 
 		 287 aa  367  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.51728  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0037  prephenate dehydratase  62.11 
 
 		 287 aa  367  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.771092  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3428  prephenate dehydratase  62.82 
 
 		 284 aa  364  1e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4087  prephenate dehydratase  62.72 
 
 		 290 aa  361  9e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4403  prephenate dehydratase  61.37 
 
 		 284 aa  360  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4083  prephenate dehydratase  61.01 
 
 		 284 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0689378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3606  Prephenate dehydratase  63.31 
 
 		 285 aa  358  7e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3518  prephenate dehydratase  61.87 
 
 		 310 aa  349  3e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0105  prephenate dehydratase  63.08 
 
 		 265 aa  349  3e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0653  prephenate dehydratase  57.35 
 
 		 280 aa  336  1.9999999999999998e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1988  prephenate dehydratase  59.42 
 
 		 287 aa  335  5e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.630591  normal  0.549246 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0642  prephenate dehydratase  60 
 
 		 287 aa  335  7e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0930161  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2951  prephenate dehydratase  58.24 
 
 		 286 aa  330  2e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.217306 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4580  prephenate dehydratase  62.23 
 
 		 282 aa  323  3e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3162  prephenate dehydratase  58.06 
 
 		 288 aa  317  1e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.309807  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3865  prephenate dehydratase  53.43 
 
 		 276 aa  308  5.9999999999999995e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0369345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0706  prephenate dehydratase  55.8 
 
 		 300 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.146743  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2554  prephenate dehydratase  52.9 
 
 		 276 aa  305  4.0000000000000004e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183494 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2361  prephenate dehydratase  55.43 
 
 		 277 aa  305  6e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.814265  normal  0.327119 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1809  prephenate dehydratase  56.52 
 
 		 295 aa  305  8.000000000000001e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.115737 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0467  prephenate dehydratase  58.09 
 
 		 296 aa  304  1.0000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0524  prephenate dehydratase  56.16 
 
 		 277 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0734392  normal  0.460167 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0102  prephenate dehydratase  52.9 
 
 		 287 aa  295  8e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.29138  normal  0.214423 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4688  prephenate dehydratase  58.49 
 
 		 299 aa  295  8e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0153843  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3003  prephenate dehydratase  49.09 
 
 		 288 aa  278  7e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0555723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0622  prephenate dehydratase  53.7 
 
 		 297 aa  265  5e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.284363  normal  0.610727 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1881  prephenate dehydratase  44.07 
 
 		 298 aa  231  8.000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.858484 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0877  Prephenate dehydratase  37.87 
 
 		 288 aa  180  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0495  Prephenate dehydratase  37.68 
 
 		 279 aa  175  7e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1293  Prephenate dehydratase  40.59 
 
 		 293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.821795  normal  0.378721 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0633  Prephenate dehydratase  41.24 
 
 		 285 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2091  Chorismate mutase  37.27 
 
 		 280 aa  166  2.9999999999999998e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.746584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1644  prephenate dehydratase  35.53 
 
 		 280 aa  165  8e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0474  Prephenate dehydratase  35.9 
 
 		 279 aa  165  9e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  33.09 
 
 		 358 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0537  prephenate dehydratase  34.8 
 
 		 279 aa  160  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2061  Prephenate dehydratase  39.56 
 
 		 277 aa  159  6e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2153  Prephenate dehydratase  39.56 
 
 		 277 aa  159  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0180  prephenate dehydratase  36.65 
 
 		 283 aa  158  1e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0656  Prephenate dehydratase  35.29 
 
 		 276 aa  157  1e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.416459  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1779  prephenate dehydratase  38.46 
 
 		 277 aa  156  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.490374  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0541  Prephenate dehydratase  34.78 
 
 		 279 aa  155  6e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1567  prephenate dehydratase  30.37 
 
 		 271 aa  153  2e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.12 
 
 		 358 aa  151  1e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2043  prephenate dehydratase  35.06 
 
 		 283 aa  150  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.64689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0937  prephenate dehydratase  34.69 
 
 		 272 aa  150  2e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  31.97 
 
 		 358 aa  150  3e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1341  prephenate dehydratase  33.09 
 
 		 384 aa  148  9e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.409344  normal  0.126516 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  35.93 
 
 		 358 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2853  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.97 
 
 		 393 aa  146  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1133  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.23 
 
 		 386 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.898271  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0881  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.23 
 
 		 385 aa  146  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.304992  normal  0.0807055 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3218  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.13 
 
 		 385 aa  144  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.631051  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0121  prephenate dehydratase  35.34 
 
 		 356 aa  144  1e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0009  chorismate mutase  36.1 
 
 		 385 aa  144  1e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3077  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.88 
 
 		 396 aa  144  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0866115  normal  0.0319555 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3482  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.13 
 
 		 385 aa  144  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.335091 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3355  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.13 
 
 		 385 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3146  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.23 
 
 		 386 aa  144  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.831222  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0078  prephenate dehydratase  34.77 
 
 		 280 aa  144  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0545378  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1437  prephenate dehydratase  32.09 
 
 		 276 aa  143  3e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1547  prephenate dehydratase  32.09 
 
 		 276 aa  143  4e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01001  chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.6 
 
 		 392 aa  143  4e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3039  chorismate mutase  38.31 
 
 		 355 aa  142  5e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2192  chorismate mutase  34.91 
 
 		 355 aa  142  5e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004398  chorismate mutase I/prephenate dehydratase  29.6 
 
 		 392 aa  142  6e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1904  prephenate dehydratase  35.19 
 
 		 372 aa  142  6e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0916421  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0898  prephenate dehydratase / chorismate mutase / phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  30.29 
 
 		 659 aa  142  8e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.983271 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1303  prephenate dehydratase  31.34 
 
 		 276 aa  141  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0951  chorismate mutase / prephenate dehydratase  38.46 
 
 		 365 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.356586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1424  prephenate dehydratase  32.78 
 
 		 274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000368391  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0235  chorismate mutase/prephenate dehydratase  29.6 
 
 		 391 aa  141  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1345  prephenate dehydratase  32.09 
 
 		 379 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0774  chorismate mutase  34.27 
 
 		 371 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.561025  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1334  prephenate dehydratase  36 
 
 		 303 aa  139  4.999999999999999e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0999  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.87 
 
 		 393 aa  139  4.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1686  chorismate mutase / prephenate dehydratase  35.63 
 
 		 355 aa  138  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0845  chorismate mutase  34.27 
 
 		 371 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0602148 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0904  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.87 
 
 		 371 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1168  chorismate mutase  29.67 
 
 		 662 aa  137  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  36.14 
 
 		 386 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>