More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0285 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0285  prephenate dehydratase  100 
 
 		 286 aa  588  1e-167  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.224737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0365  prephenate dehydratase  91.26 
 
 		 286 aa  546  1e-154  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1767  prephenate dehydratase  84.51 
 
 		 284 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0567003 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3732  prephenate dehydratase  83.04 
 
 		 286 aa  498  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.755175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3538  prephenate dehydratase  82.39 
 
 		 284 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7058  prephenate dehydratase  80.77 
 
 		 286 aa  492  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4217  prephenate dehydratase  81.43 
 
 		 280 aa  485  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.239434  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2629  prephenate dehydratase  67.39 
 
 		 286 aa  403  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.216997 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3356  prephenate dehydratase  68.84 
 
 		 288 aa  403  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.539085  normal  0.173573 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1620  prephenate dehydratase  66.78 
 
 		 284 aa  393  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159121  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0511  prephenate dehydratase  69.15 
 
 		 284 aa  384  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4087  prephenate dehydratase  64.31 
 
 		 290 aa  373  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3650  prephenate dehydratase  65.71 
 
 		 285 aa  369  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.243627  normal  0.169343 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4403  prephenate dehydratase  61.29 
 
 		 284 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4083  prephenate dehydratase  61.65 
 
 		 284 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0689378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3428  prephenate dehydratase  61.92 
 
 		 284 aa  367  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0418  Prephenate dehydratase  65 
 
 		 287 aa  365  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0384  Prephenate dehydratase  64.64 
 
 		 285 aa  363  2e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.020412  normal  0.492047 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0339  prephenate dehydratase  64.64 
 
 		 285 aa  363  2e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3912  Prephenate dehydratase  62.95 
 
 		 288 aa  361  8e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0037  prephenate dehydratase  61.07 
 
 		 287 aa  357  9.999999999999999e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.51728  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0037  prephenate dehydratase  61.07 
 
 		 287 aa  357  9.999999999999999e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.771092  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0018  prephenate dehydratase  60.71 
 
 		 287 aa  355  5e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0252  prephenate dehydratase  60 
 
 		 293 aa  347  1e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0653  prephenate dehydratase  60 
 
 		 280 aa  344  1e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0105  prephenate dehydratase  61.51 
 
 		 265 aa  338  4e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3606  Prephenate dehydratase  60.14 
 
 		 285 aa  335  5.999999999999999e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0170  prephenate dehydratase  61.27 
 
 		 287 aa  332  3e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0524  prephenate dehydratase  59.42 
 
 		 277 aa  328  8e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0734392  normal  0.460167 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3518  prephenate dehydratase  57.71 
 
 		 310 aa  327  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0706  prephenate dehydratase  58.7 
 
 		 300 aa  326  3e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.146743  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1988  prephenate dehydratase  56.94 
 
 		 287 aa  325  6e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.630591  normal  0.549246 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0642  prephenate dehydratase  58.55 
 
 		 287 aa  324  1e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0930161  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2361  prephenate dehydratase  58.33 
 
 		 277 aa  324  1e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.814265  normal  0.327119 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2951  prephenate dehydratase  56.83 
 
 		 286 aa  320  9.999999999999999e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.217306 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3162  prephenate dehydratase  59.21 
 
 		 288 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.309807  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2554  prephenate dehydratase  56.83 
 
 		 276 aa  311  1e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183494 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3865  prephenate dehydratase  56.36 
 
 		 276 aa  308  1.0000000000000001e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0369345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1809  prephenate dehydratase  56.88 
 
 		 295 aa  304  1.0000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.115737 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4580  prephenate dehydratase  58.87 
 
 		 282 aa  299  4e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0467  prephenate dehydratase  53.65 
 
 		 296 aa  281  7.000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0102  prephenate dehydratase  53.11 
 
 		 287 aa  278  7e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.29138  normal  0.214423 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4688  prephenate dehydratase  56.23 
 
 		 299 aa  270  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0153843  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0622  prephenate dehydratase  53.7 
 
 		 297 aa  267  1e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.284363  normal  0.610727 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3003  prephenate dehydratase  47.29 
 
 		 288 aa  256  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0555723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1881  prephenate dehydratase  44.19 
 
 		 298 aa  214  1.9999999999999998e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.858484 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1293  Prephenate dehydratase  41.88 
 
 		 293 aa  192  7e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.821795  normal  0.378721 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0877  Prephenate dehydratase  38.41 
 
 		 288 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2091  Chorismate mutase  38.46 
 
 		 280 aa  181  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.746584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1567  prephenate dehydratase  33.58 
 
 		 271 aa  171  1e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2153  Prephenate dehydratase  40.58 
 
 		 277 aa  162  7e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2061  Prephenate dehydratase  40.58 
 
 		 277 aa  162  7e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0495  Prephenate dehydratase  35.84 
 
 		 279 aa  161  1e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1779  prephenate dehydratase  39.86 
 
 		 277 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.490374  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0537  prephenate dehydratase  34.51 
 
 		 279 aa  161  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0474  Prephenate dehydratase  36.27 
 
 		 279 aa  160  2e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0633  Prephenate dehydratase  38.71 
 
 		 285 aa  159  6e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2043  prephenate dehydratase  36.06 
 
 		 283 aa  158  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.64689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  34.7 
 
 		 358 aa  157  3e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_3267  predicted protein  34.1 
 
 		 304 aa  154  2e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1644  prephenate dehydratase  34.77 
 
 		 280 aa  152  4e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0180  prephenate dehydratase  35.04 
 
 		 283 aa  149  4e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.7 
 
 		 358 aa  149  6e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0656  Prephenate dehydratase  34.91 
 
 		 276 aa  149  6e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.416459  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  33.58 
 
 		 358 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0845  chorismate mutase  35.61 
 
 		 371 aa  146  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0602148 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004398  chorismate mutase I/prephenate dehydratase  30.96 
 
 		 392 aa  147  3e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0774  chorismate mutase  35.61 
 
 		 371 aa  146  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.561025  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01001  chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.25 
 
 		 392 aa  145  7.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0937  prephenate dehydratase  33.58 
 
 		 272 aa  145  1e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0541  Prephenate dehydratase  33.81 
 
 		 279 aa  144  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0904  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  36.14 
 
 		 371 aa  142  6e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0235  chorismate mutase/prephenate dehydratase  30 
 
 		 391 aa  142  8e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0881  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.36 
 
 		 385 aa  141  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.304992  normal  0.0807055 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1133  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.54 
 
 		 386 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.898271  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13638  predicted protein  35 
 
 		 348 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1341  prephenate dehydratase  31.87 
 
 		 384 aa  140  3e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.409344  normal  0.126516 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3146  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.29 
 
 		 386 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.831222  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1590  chorismate mutase  29.79 
 
 		 399 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  31.16 
 
 		 356 aa  139  6e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2853  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.73 
 
 		 393 aa  138  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01713  chorismate mutase/prephenate dehydratase  29.18 
 
 		 393 aa  137  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.342812  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1424  prephenate dehydratase  30.66 
 
 		 274 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000368391  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1345  prephenate dehydratase  30.86 
 
 		 379 aa  136  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1059  chorismate mutase  29.64 
 
 		 657 aa  136  4e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.850871  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  32.85 
 
 		 359 aa  136  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  32.85 
 
 		 359 aa  136  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1345  chorismate mutase  34.19 
 
 		 359 aa  136  4e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  32.37 
 
 		 382 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1686  chorismate mutase / prephenate dehydratase  33.7 
 
 		 355 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0999  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.94 
 
 		 393 aa  135  7.000000000000001e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0121  prephenate dehydratase  33.72 
 
 		 356 aa  135  7.000000000000001e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2723  chorismate mutase  35.21 
 
 		 381 aa  135  8e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3355  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.27 
 
 		 385 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10160  monofunctional chorismate mutase, clade 2  31.27 
 
 		 403 aa  134  9.999999999999999e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000617885  hitchhiker  0.000000765088 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0661  P-protein (includes: chorismate mutase and prephenate dehydratase)  28.83 
 
 		 391 aa  135  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.026643  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1334  prephenate dehydratase  36.1 
 
 		 303 aa  134  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3482  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.27 
 
 		 385 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.335091 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3218  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.27 
 
 		 385 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.631051  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1594  prephenate dehydratase  30.32 
 
 		 311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>