More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0467 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0467  prephenate dehydratase  100 
 
 		 296 aa  596  1e-169  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4688  prephenate dehydratase  67.68 
 
 		 299 aa  358  8e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0153843  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0622  prephenate dehydratase  63.85 
 
 		 297 aa  355  5.999999999999999e-97  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.284363  normal  0.610727 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1620  prephenate dehydratase  55.84 
 
 		 284 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159121  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0511  prephenate dehydratase  58.03 
 
 		 284 aa  298  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2629  prephenate dehydratase  56.51 
 
 		 286 aa  295  7e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.216997 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0252  prephenate dehydratase  54.61 
 
 		 293 aa  295  9e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396443  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0037  prephenate dehydratase  56 
 
 		 287 aa  290  1e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.51728  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0037  prephenate dehydratase  56 
 
 		 287 aa  290  1e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.771092  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3356  prephenate dehydratase  55.68 
 
 		 288 aa  289  4e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.539085  normal  0.173573 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7058  prephenate dehydratase  54.41 
 
 		 286 aa  286  4e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0018  prephenate dehydratase  55.27 
 
 		 287 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4087  prephenate dehydratase  57.09 
 
 		 290 aa  284  1.0000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3428  prephenate dehydratase  55.27 
 
 		 284 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3732  prephenate dehydratase  54.41 
 
 		 286 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.755175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0285  prephenate dehydratase  53.65 
 
 		 286 aa  282  5.000000000000001e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.224737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0365  prephenate dehydratase  55.06 
 
 		 286 aa  282  5.000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4403  prephenate dehydratase  54.18 
 
 		 284 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4083  prephenate dehydratase  54.18 
 
 		 284 aa  279  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0689378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1767  prephenate dehydratase  53.93 
 
 		 284 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0567003 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3606  Prephenate dehydratase  53.14 
 
 		 285 aa  276  4e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3650  prephenate dehydratase  54.38 
 
 		 285 aa  275  7e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.243627  normal  0.169343 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3538  prephenate dehydratase  53.18 
 
 		 284 aa  275  7e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4217  prephenate dehydratase  52.81 
 
 		 280 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.239434  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0524  prephenate dehydratase  53.11 
 
 		 277 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0734392  normal  0.460167 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0653  prephenate dehydratase  51.66 
 
 		 280 aa  271  7e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0706  prephenate dehydratase  52.38 
 
 		 300 aa  271  7e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.146743  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0105  prephenate dehydratase  55.34 
 
 		 265 aa  271  1e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2361  prephenate dehydratase  52.01 
 
 		 277 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.814265  normal  0.327119 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0418  Prephenate dehydratase  53.82 
 
 		 287 aa  268  8.999999999999999e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3912  Prephenate dehydratase  51.64 
 
 		 288 aa  267  2e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0642  prephenate dehydratase  53.56 
 
 		 287 aa  267  2e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0930161  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3518  prephenate dehydratase  51.66 
 
 		 310 aa  267  2e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3865  prephenate dehydratase  50.74 
 
 		 276 aa  264  1e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0369345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0339  prephenate dehydratase  52.92 
 
 		 285 aa  263  4e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0384  Prephenate dehydratase  52.92 
 
 		 285 aa  262  4e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.020412  normal  0.492047 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2951  prephenate dehydratase  52.94 
 
 		 286 aa  261  6.999999999999999e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.217306 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1988  prephenate dehydratase  51.64 
 
 		 287 aa  260  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.630591  normal  0.549246 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0170  prephenate dehydratase  51.97 
 
 		 287 aa  258  8e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1809  prephenate dehydratase  51.09 
 
 		 295 aa  249  4e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.115737 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3162  prephenate dehydratase  50.37 
 
 		 288 aa  246  2e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.309807  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2554  prephenate dehydratase  47.65 
 
 		 276 aa  246  3e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183494 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4580  prephenate dehydratase  50.55 
 
 		 282 aa  240  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0102  prephenate dehydratase  47.39 
 
 		 287 aa  231  1e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.29138  normal  0.214423 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3003  prephenate dehydratase  42.65 
 
 		 288 aa  219  6e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0555723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0877  Prephenate dehydratase  41.7 
 
 		 288 aa  201  9e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1881  prephenate dehydratase  42.56 
 
 		 298 aa  190  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.858484 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1567  prephenate dehydratase  32.59 
 
 		 271 aa  154  2e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  34.83 
 
 		 358 aa  151  1e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0633  Prephenate dehydratase  40 
 
 		 285 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0541  Prephenate dehydratase  36.82 
 
 		 279 aa  142  7e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01001  chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.39 
 
 		 392 aa  142  8e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2853  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.86 
 
 		 393 aa  141  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0537  prephenate dehydratase  35.4 
 
 		 279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0495  Prephenate dehydratase  37.32 
 
 		 279 aa  140  3e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.88 
 
 		 358 aa  139  4.999999999999999e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2091  Chorismate mutase  35.9 
 
 		 280 aa  139  7e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.746584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004398  chorismate mutase I/prephenate dehydratase  32.04 
 
 		 392 aa  139  7e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  34.97 
 
 		 358 aa  139  7e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  32.76 
 
 		 358 aa  138  8.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0474  Prephenate dehydratase  36.13 
 
 		 279 aa  136  4e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1293  Prephenate dehydratase  36.4 
 
 		 293 aa  135  9e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.821795  normal  0.378721 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1133  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.08 
 
 		 386 aa  134  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.898271  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01713  chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.74 
 
 		 393 aa  134  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.342812  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_3267  predicted protein  34.44 
 
 		 304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1644  prephenate dehydratase  35.27 
 
 		 280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1590  chorismate mutase  31.29 
 
 		 399 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0656  Prephenate dehydratase  35.77 
 
 		 276 aa  132  5e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.416459  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0121  prephenate dehydratase  31.42 
 
 		 356 aa  131  1.0000000000000001e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0180  prephenate dehydratase  35.48 
 
 		 283 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0999  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.08 
 
 		 393 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2192  chorismate mutase  34.49 
 
 		 355 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  32.71 
 
 		 356 aa  130  3e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0235  chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.48 
 
 		 391 aa  130  3e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0661  P-protein (includes: chorismate mutase and prephenate dehydratase)  28.62 
 
 		 391 aa  129  6e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.026643  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0881  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  29.39 
 
 		 385 aa  129  6e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.304992  normal  0.0807055 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1424  prephenate dehydratase  31.39 
 
 		 274 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000368391  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3146  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.74 
 
 		 386 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.831222  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0009  chorismate mutase  30.37 
 
 		 385 aa  128  1.0000000000000001e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3077  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.72 
 
 		 396 aa  128  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0866115  normal  0.0319555 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3218  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.74 
 
 		 385 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.631051  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3482  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.74 
 
 		 385 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.335091 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3355  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.74 
 
 		 385 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  34.43 
 
 		 371 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2723  chorismate mutase  35.31 
 
 		 381 aa  126  4.0000000000000003e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3039  chorismate mutase  36.1 
 
 		 355 aa  126  5e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0937  prephenate dehydratase  33.46 
 
 		 272 aa  125  7e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1686  chorismate mutase / prephenate dehydratase  33.69 
 
 		 355 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  32.4 
 
 		 359 aa  125  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  32.4 
 
 		 359 aa  124  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0078  prephenate dehydratase  34.41 
 
 		 280 aa  124  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0545378  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1341  prephenate dehydratase  29.82 
 
 		 384 aa  123  3e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.409344  normal  0.126516 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1207  chorismate mutase  31.69 
 
 		 371 aa  122  5e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0297935 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13638  predicted protein  34.16 
 
 		 348 aa  122  6e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2747  chorismate mutase  30.22 
 
 		 662 aa  122  7e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2858  chorismate mutase  31.71 
 
 		 373 aa  122  7e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.42066  hitchhiker  0.0000000270068 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1779  prephenate dehydratase  34.3 
 
 		 277 aa  122  8e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.490374  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3724  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  32.72 
 
 		 632 aa  122  9e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1442  chorismate mutase  30.31 
 
 		 374 aa  122  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.105369  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0365  chorismate mutase / prephenate dehydratase  30.22 
 
 		 385 aa  121  9.999999999999999e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0036667  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>