More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4688 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4688  prephenate dehydratase  100 
 
 		 299 aa  611  9.999999999999999e-175  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0153843  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0467  prephenate dehydratase  67.68 
 
 		 296 aa  382  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0622  prephenate dehydratase  66.33 
 
 		 297 aa  364  1e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.284363  normal  0.610727 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1620  prephenate dehydratase  57.62 
 
 		 284 aa  310  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159121  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0252  prephenate dehydratase  56.88 
 
 		 293 aa  306  4.0000000000000004e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0511  prephenate dehydratase  57.99 
 
 		 284 aa  301  6.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4083  prephenate dehydratase  55.8 
 
 		 284 aa  297  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0689378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3428  prephenate dehydratase  55.27 
 
 		 284 aa  296  2e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4403  prephenate dehydratase  55.8 
 
 		 284 aa  296  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0365  prephenate dehydratase  56.55 
 
 		 286 aa  292  5e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7058  prephenate dehydratase  55.43 
 
 		 286 aa  290  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3732  prephenate dehydratase  54.68 
 
 		 286 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.755175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2629  prephenate dehydratase  54.28 
 
 		 286 aa  289  4e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.216997 
 
 
-
 
NC_004310  BR0037  prephenate dehydratase  54.55 
 
 		 287 aa  288  6e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.51728  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0037  prephenate dehydratase  54.55 
 
 		 287 aa  288  6e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.771092  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0285  prephenate dehydratase  55.81 
 
 		 286 aa  288  8e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.224737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1767  prephenate dehydratase  54.68 
 
 		 284 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0567003 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0018  prephenate dehydratase  55.22 
 
 		 287 aa  287  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4217  prephenate dehydratase  54.68 
 
 		 280 aa  286  4e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.239434  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3538  prephenate dehydratase  53.93 
 
 		 284 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3606  Prephenate dehydratase  54.12 
 
 		 285 aa  281  7.000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0418  Prephenate dehydratase  55.39 
 
 		 287 aa  281  7.000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0384  Prephenate dehydratase  55.02 
 
 		 285 aa  280  1e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.020412  normal  0.492047 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0339  prephenate dehydratase  55.02 
 
 		 285 aa  280  2e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0653  prephenate dehydratase  52.43 
 
 		 280 aa  279  4e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4087  prephenate dehydratase  54.18 
 
 		 290 aa  276  2e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0524  prephenate dehydratase  54.95 
 
 		 277 aa  277  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0734392  normal  0.460167 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3650  prephenate dehydratase  53.9 
 
 		 285 aa  276  4e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.243627  normal  0.169343 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0706  prephenate dehydratase  53.85 
 
 		 300 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.146743  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2361  prephenate dehydratase  53.48 
 
 		 277 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.814265  normal  0.327119 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0105  prephenate dehydratase  53.61 
 
 		 265 aa  270  1e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3518  prephenate dehydratase  51.97 
 
 		 310 aa  270  2e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1809  prephenate dehydratase  51.8 
 
 		 295 aa  270  2e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.115737 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3356  prephenate dehydratase  53.33 
 
 		 288 aa  268  1e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.539085  normal  0.173573 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0170  prephenate dehydratase  53.65 
 
 		 287 aa  268  1e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3912  Prephenate dehydratase  50.74 
 
 		 288 aa  267  1e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2951  prephenate dehydratase  51.46 
 
 		 286 aa  263  2e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.217306 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0642  prephenate dehydratase  50.18 
 
 		 287 aa  264  2e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0930161  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3162  prephenate dehydratase  51.82 
 
 		 288 aa  260  2e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.309807  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3865  prephenate dehydratase  51.31 
 
 		 276 aa  260  2e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0369345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2554  prephenate dehydratase  46.72 
 
 		 276 aa  249  3e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183494 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1988  prephenate dehydratase  48.01 
 
 		 287 aa  245  6e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.630591  normal  0.549246 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0102  prephenate dehydratase  45.69 
 
 		 287 aa  226  2e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.29138  normal  0.214423 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3003  prephenate dehydratase  43.12 
 
 		 288 aa  221  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0555723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4580  prephenate dehydratase  48.15 
 
 		 282 aa  219  3e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1881  prephenate dehydratase  43.17 
 
 		 298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.858484 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0877  Prephenate dehydratase  41.09 
 
 		 288 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  34.69 
 
 		 358 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1644  prephenate dehydratase  39.27 
 
 		 280 aa  165  9e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.92 
 
 		 358 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0633  Prephenate dehydratase  41.58 
 
 		 285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1293  Prephenate dehydratase  38.52 
 
 		 293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.821795  normal  0.378721 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0495  Prephenate dehydratase  39.35 
 
 		 279 aa  163  4.0000000000000004e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1567  prephenate dehydratase  31.97 
 
 		 271 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  34.35 
 
 		 358 aa  162  6e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2091  Chorismate mutase  37.55 
 
 		 280 aa  158  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.746584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0180  prephenate dehydratase  38.49 
 
 		 283 aa  158  1e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0541  Prephenate dehydratase  36.82 
 
 		 279 aa  155  6e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2153  Prephenate dehydratase  40.15 
 
 		 277 aa  155  6e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2061  Prephenate dehydratase  40.15 
 
 		 277 aa  155  6e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0537  prephenate dehydratase  37.45 
 
 		 279 aa  155  7e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0474  Prephenate dehydratase  37.45 
 
 		 279 aa  155  8e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1779  prephenate dehydratase  39.42 
 
 		 277 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.490374  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  33.8 
 
 		 359 aa  146  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0774  chorismate mutase  34.95 
 
 		 371 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.561025  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0937  prephenate dehydratase  33.58 
 
 		 272 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0845  chorismate mutase  34.95 
 
 		 371 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0602148 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2608  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.57 
 
 		 358 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_3267  predicted protein  33.88 
 
 		 304 aa  144  2e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13638  predicted protein  37.5 
 
 		 348 aa  144  2e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1153  Prephenate dehydratase  35.21 
 
 		 276 aa  143  3e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1345  chorismate mutase  33.57 
 
 		 359 aa  143  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0904  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.09 
 
 		 371 aa  143  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0862  prephenate dehydratase / chorismate mutase  34.51 
 
 		 368 aa  143  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2043  prephenate dehydratase  36.53 
 
 		 283 aa  142  5e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.64689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1341  prephenate dehydratase  31.85 
 
 		 384 aa  142  5e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.409344  normal  0.126516 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2723  chorismate mutase  35.42 
 
 		 381 aa  142  6e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  33.45 
 
 		 359 aa  142  8e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0999  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.79 
 
 		 393 aa  142  9e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  33.88 
 
 		 358 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0656  Prephenate dehydratase  35.27 
 
 		 276 aa  141  9.999999999999999e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.416459  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0801  chorismate mutase  33.22 
 
 		 359 aa  140  3e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1887  chorismate mutase-P and prephenate dehydratase  34.28 
 
 		 360 aa  140  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000192693  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0716  prephenate dehydratase / chorismate mutase  34.48 
 
 		 387 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  34.48 
 
 		 382 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2192  chorismate mutase  33.92 
 
 		 355 aa  139  7e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0071  prephenate dehydratase  34.78 
 
 		 324 aa  139  7e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1424  prephenate dehydratase  31.16 
 
 		 274 aa  138  8.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000368391  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  34.84 
 
 		 371 aa  137  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2853  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.06 
 
 		 393 aa  137  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1462  prephenate dehydratase  34.23 
 
 		 358 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3039  chorismate mutase  35.69 
 
 		 355 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1193  chorismate mutase  32.26 
 
 		 366 aa  136  4e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3077  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.07 
 
 		 396 aa  136  5e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0866115  normal  0.0319555 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01713  chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.38 
 
 		 393 aa  135  7.000000000000001e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.342812  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  32.97 
 
 		 356 aa  135  8e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1075  chorismate mutase  32.76 
 
 		 386 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0741  chorismate mutase  35.86 
 
 		 360 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2883  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.76 
 
 		 386 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0920297  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3724  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  33.7 
 
 		 632 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>