More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0252 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0252  prephenate dehydratase  100 
 
 		 293 aa  595  1e-169  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2629  prephenate dehydratase  67.15 
 
 		 286 aa  388  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.216997 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3356  prephenate dehydratase  64.71 
 
 		 288 aa  367  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.539085  normal  0.173573 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7058  prephenate dehydratase  62.68 
 
 		 286 aa  363  1e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1620  prephenate dehydratase  61.45 
 
 		 284 aa  363  2e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159121  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1767  prephenate dehydratase  62.32 
 
 		 284 aa  362  4e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0567003 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3538  prephenate dehydratase  62.32 
 
 		 284 aa  360  1e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0418  Prephenate dehydratase  63.27 
 
 		 287 aa  360  2e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0339  prephenate dehydratase  62.91 
 
 		 285 aa  358  5e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0384  Prephenate dehydratase  62.91 
 
 		 285 aa  358  7e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.020412  normal  0.492047 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3732  prephenate dehydratase  61.23 
 
 		 286 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.755175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4217  prephenate dehydratase  61.59 
 
 		 280 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.239434  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0511  prephenate dehydratase  62.91 
 
 		 284 aa  353  2e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0365  prephenate dehydratase  61.23 
 
 		 286 aa  353  2e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3650  prephenate dehydratase  62.09 
 
 		 285 aa  351  7e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.243627  normal  0.169343 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0285  prephenate dehydratase  60 
 
 		 286 aa  347  1e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.224737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3912  Prephenate dehydratase  61.79 
 
 		 288 aa  345  6e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0642  prephenate dehydratase  60.93 
 
 		 287 aa  345  6e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0930161  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0037  prephenate dehydratase  60.14 
 
 		 287 aa  330  2e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.51728  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0037  prephenate dehydratase  60.14 
 
 		 287 aa  330  2e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.771092  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3162  prephenate dehydratase  61.87 
 
 		 288 aa  328  6e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.309807  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3606  Prephenate dehydratase  60.07 
 
 		 285 aa  327  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4087  prephenate dehydratase  58.01 
 
 		 290 aa  326  3e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3428  prephenate dehydratase  57.35 
 
 		 284 aa  325  5e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0018  prephenate dehydratase  58.33 
 
 		 287 aa  324  8.000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4083  prephenate dehydratase  56.89 
 
 		 284 aa  324  9e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0689378  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4403  prephenate dehydratase  56.89 
 
 		 284 aa  323  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2951  prephenate dehydratase  57.09 
 
 		 286 aa  320  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.217306 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3518  prephenate dehydratase  57.24 
 
 		 310 aa  319  3e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1988  prephenate dehydratase  57.45 
 
 		 287 aa  317  1e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.630591  normal  0.549246 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0653  prephenate dehydratase  56.99 
 
 		 280 aa  315  5e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0170  prephenate dehydratase  57.09 
 
 		 287 aa  315  5e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1809  prephenate dehydratase  57.49 
 
 		 295 aa  313  1.9999999999999998e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.115737 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0706  prephenate dehydratase  59.56 
 
 		 300 aa  310  2e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.146743  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0524  prephenate dehydratase  60.07 
 
 		 277 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0734392  normal  0.460167 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2361  prephenate dehydratase  59.7 
 
 		 277 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.814265  normal  0.327119 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0105  prephenate dehydratase  57.25 
 
 		 265 aa  306  2.0000000000000002e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3865  prephenate dehydratase  54.74 
 
 		 276 aa  305  4.0000000000000004e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0369345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4580  prephenate dehydratase  57.61 
 
 		 282 aa  299  5e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2554  prephenate dehydratase  53.68 
 
 		 276 aa  298  7e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183494 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0467  prephenate dehydratase  55.15 
 
 		 296 aa  291  6e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4688  prephenate dehydratase  57.58 
 
 		 299 aa  286  4e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0153843  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0102  prephenate dehydratase  50.55 
 
 		 287 aa  278  1e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.29138  normal  0.214423 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3003  prephenate dehydratase  47.12 
 
 		 288 aa  272  6e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0555723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0622  prephenate dehydratase  54.31 
 
 		 297 aa  266  2e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.284363  normal  0.610727 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1881  prephenate dehydratase  43.88 
 
 		 298 aa  214  1.9999999999999998e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.858484 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0877  Prephenate dehydratase  37.23 
 
 		 288 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  36.19 
 
 		 358 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0495  Prephenate dehydratase  39.35 
 
 		 279 aa  170  2e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1567  prephenate dehydratase  35.58 
 
 		 271 aa  168  9e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  36.19 
 
 		 358 aa  167  1e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  35.82 
 
 		 358 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2091  Chorismate mutase  38.1 
 
 		 280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.746584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0474  Prephenate dehydratase  37.18 
 
 		 279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0537  prephenate dehydratase  36.46 
 
 		 279 aa  162  9e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0633  Prephenate dehydratase  41.24 
 
 		 285 aa  160  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004398  chorismate mutase I/prephenate dehydratase  35.06 
 
 		 392 aa  160  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0656  Prephenate dehydratase  36.63 
 
 		 276 aa  159  6e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.416459  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2043  prephenate dehydratase  37.17 
 
 		 283 aa  159  6e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.64689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1293  Prephenate dehydratase  39.42 
 
 		 293 aa  159  7e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.821795  normal  0.378721 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01001  chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  33.95 
 
 		 392 aa  158  9e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0180  prephenate dehydratase  37.5 
 
 		 283 aa  158  1e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0235  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.94 
 
 		 391 aa  157  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1644  prephenate dehydratase  37.18 
 
 		 280 aa  156  3e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_3267  predicted protein  35.67 
 
 		 304 aa  154  2e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1334  prephenate dehydratase  40 
 
 		 303 aa  152  8.999999999999999e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0661  P-protein (includes: chorismate mutase and prephenate dehydratase)  32.47 
 
 		 391 aa  149  4e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.026643  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0541  Prephenate dehydratase  36.1 
 
 		 279 aa  149  4e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1590  chorismate mutase  32.6 
 
 		 399 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2853  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.95 
 
 		 393 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1133  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.84 
 
 		 386 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.898271  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1341  prephenate dehydratase  34.31 
 
 		 384 aa  145  5e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.409344  normal  0.126516 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3724  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  34.19 
 
 		 632 aa  146  5e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0898  prephenate dehydratase / chorismate mutase / phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  33.82 
 
 		 659 aa  146  5e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.983271 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01713  chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.6 
 
 		 393 aa  144  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.342812  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0881  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.1 
 
 		 385 aa  143  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.304992  normal  0.0807055 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0999  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.47 
 
 		 393 aa  143  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2828  prephenate dehydratase / chorismate mutase  32.27 
 
 		 667 aa  143  4e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3146  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.47 
 
 		 386 aa  142  5e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.831222  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2910  prephenate dehydratase / chorismate mutase  32.27 
 
 		 667 aa  142  5e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3007  chorismate mutase / prephenate dehydratase  32.27 
 
 		 667 aa  142  5e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1264  chorismate mutase  32.27 
 
 		 664 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.728983  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1220  chorismate mutase  32.27 
 
 		 664 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.950276  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  34.89 
 
 		 359 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1263  chorismate mutase  32.36 
 
 		 662 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0015659 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  35.56 
 
 		 359 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1367  chorismate mutase/prephenate dehydratase  32 
 
 		 671 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0365  chorismate mutase / prephenate dehydratase  30.38 
 
 		 385 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0036667  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1297  chorismate mutase  32.27 
 
 		 664 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13638  predicted protein  36.82 
 
 		 348 aa  140  3e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3355  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.93 
 
 		 385 aa  140  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2913  chorismate mutase  30.74 
 
 		 648 aa  140  3e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1072  chorismate mutase  31.52 
 
 		 654 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2061  Prephenate dehydratase  37.13 
 
 		 277 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2153  Prephenate dehydratase  37.13 
 
 		 277 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3218  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.93 
 
 		 385 aa  139  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.631051  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3077  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.41 
 
 		 396 aa  139  3.9999999999999997e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0866115  normal  0.0319555 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3482  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.93 
 
 		 385 aa  139  3.9999999999999997e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.335091 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1168  chorismate mutase  31.05 
 
 		 662 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  36.06 
 
 		 358 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>