More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1988 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1988  prephenate dehydratase  100 
 
 		 287 aa  590  1e-168  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.630591  normal  0.549246 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2951  prephenate dehydratase  79.29 
 
 		 286 aa  462  1e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.217306 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2629  prephenate dehydratase  63.9 
 
 		 286 aa  360  2e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.216997 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3356  prephenate dehydratase  60.43 
 
 		 288 aa  345  4e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.539085  normal  0.173573 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1767  prephenate dehydratase  60.5 
 
 		 284 aa  344  1e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0567003 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4217  prephenate dehydratase  61.59 
 
 		 280 aa  343  2e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.239434  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3538  prephenate dehydratase  59.79 
 
 		 284 aa  341  9e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7058  prephenate dehydratase  59.79 
 
 		 286 aa  338  5e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1620  prephenate dehydratase  57.14 
 
 		 284 aa  333  3e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159121  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3912  Prephenate dehydratase  60.73 
 
 		 288 aa  332  5e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0511  prephenate dehydratase  59.42 
 
 		 284 aa  329  3e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3650  prephenate dehydratase  59.14 
 
 		 285 aa  326  3e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.243627  normal  0.169343 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0285  prephenate dehydratase  56.94 
 
 		 286 aa  325  6e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.224737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0418  Prephenate dehydratase  59.64 
 
 		 287 aa  324  1e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0365  prephenate dehydratase  57.3 
 
 		 286 aa  324  1e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3732  prephenate dehydratase  57.65 
 
 		 286 aa  323  3e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.755175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0170  prephenate dehydratase  60.36 
 
 		 287 aa  323  3e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4403  prephenate dehydratase  57.04 
 
 		 284 aa  318  5e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3606  Prephenate dehydratase  58.12 
 
 		 285 aa  318  9e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4083  prephenate dehydratase  56.68 
 
 		 284 aa  317  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0689378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0252  prephenate dehydratase  57.45 
 
 		 293 aa  317  1e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3428  prephenate dehydratase  57.04 
 
 		 284 aa  314  9.999999999999999e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0339  prephenate dehydratase  58.18 
 
 		 285 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0384  Prephenate dehydratase  58.18 
 
 		 285 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.020412  normal  0.492047 
 
 
-
 
NC_004310  BR0037  prephenate dehydratase  57.04 
 
 		 287 aa  313  1.9999999999999998e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.51728  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0037  prephenate dehydratase  57.04 
 
 		 287 aa  313  1.9999999999999998e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.771092  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3518  prephenate dehydratase  56.99 
 
 		 310 aa  313  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0018  prephenate dehydratase  57.19 
 
 		 287 aa  312  2.9999999999999996e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0105  prephenate dehydratase  58.49 
 
 		 265 aa  308  9e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0653  prephenate dehydratase  56.93 
 
 		 280 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4087  prephenate dehydratase  53.96 
 
 		 290 aa  298  6e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2554  prephenate dehydratase  53.82 
 
 		 276 aa  285  9e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183494 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4580  prephenate dehydratase  55.87 
 
 		 282 aa  280  2e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3162  prephenate dehydratase  53.09 
 
 		 288 aa  276  4e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.309807  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1809  prephenate dehydratase  54.06 
 
 		 295 aa  275  6e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.115737 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0642  prephenate dehydratase  52.36 
 
 		 287 aa  275  9e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0930161  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0102  prephenate dehydratase  52 
 
 		 287 aa  273  3e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.29138  normal  0.214423 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3865  prephenate dehydratase  50.36 
 
 		 276 aa  271  8.000000000000001e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0369345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0706  prephenate dehydratase  55.11 
 
 		 300 aa  265  8e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.146743  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2361  prephenate dehydratase  55.11 
 
 		 277 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.814265  normal  0.327119 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0524  prephenate dehydratase  55.11 
 
 		 277 aa  262  4e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0734392  normal  0.460167 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0467  prephenate dehydratase  52.21 
 
 		 296 aa  259  4e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3003  prephenate dehydratase  45.85 
 
 		 288 aa  251  8.000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0555723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0622  prephenate dehydratase  49.28 
 
 		 297 aa  240  2e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.284363  normal  0.610727 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4688  prephenate dehydratase  48.53 
 
 		 299 aa  227  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0153843  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1881  prephenate dehydratase  44.36 
 
 		 298 aa  211  1e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.858484 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1293  Prephenate dehydratase  41.33 
 
 		 293 aa  181  9.000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.821795  normal  0.378721 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0877  Prephenate dehydratase  40.07 
 
 		 288 aa  180  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0495  Prephenate dehydratase  40.43 
 
 		 279 aa  175  7e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2091  Chorismate mutase  39.71 
 
 		 280 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.746584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0633  Prephenate dehydratase  42.55 
 
 		 285 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1644  prephenate dehydratase  39.93 
 
 		 280 aa  167  1e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2043  prephenate dehydratase  39.48 
 
 		 283 aa  165  6.9999999999999995e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.64689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0541  Prephenate dehydratase  38.1 
 
 		 279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0656  Prephenate dehydratase  38.97 
 
 		 276 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.416459  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_3267  predicted protein  37.21 
 
 		 304 aa  162  6e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.43 
 
 		 358 aa  156  3e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0474  Prephenate dehydratase  38.1 
 
 		 279 aa  157  3e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  34.46 
 
 		 358 aa  156  3e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  34.46 
 
 		 358 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1567  prephenate dehydratase  32.1 
 
 		 271 aa  154  2e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0180  prephenate dehydratase  39.86 
 
 		 283 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0537  prephenate dehydratase  36.63 
 
 		 279 aa  152  5e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0937  prephenate dehydratase  37.17 
 
 		 272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1341  prephenate dehydratase  35.06 
 
 		 384 aa  146  4.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.409344  normal  0.126516 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0365  chorismate mutase / prephenate dehydratase  29.93 
 
 		 385 aa  141  9.999999999999999e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0036667  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13638  predicted protein  37.05 
 
 		 348 aa  139  7e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01713  chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.62 
 
 		 393 aa  139  7e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.342812  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1779  prephenate dehydratase  37.3 
 
 		 277 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.490374  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0097  Prephenate dehydratase  35.94 
 
 		 306 aa  136  4e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  32.22 
 
 		 356 aa  136  5e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2061  Prephenate dehydratase  37.94 
 
 		 277 aa  136  5e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2153  Prephenate dehydratase  37.94 
 
 		 277 aa  136  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0881  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.02 
 
 		 385 aa  135  9e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.304992  normal  0.0807055 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3482  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.29 
 
 		 385 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.335091 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0845  chorismate mutase  36.14 
 
 		 371 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0602148 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3355  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.29 
 
 		 385 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0774  chorismate mutase  36.29 
 
 		 371 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.561025  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3218  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.29 
 
 		 385 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.631051  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0495  chorismate mutase  33.33 
 
 		 359 aa  133  3e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0778684  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  35.27 
 
 		 358 aa  133  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0904  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  36.4 
 
 		 371 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1904  prephenate dehydratase  36.23 
 
 		 372 aa  132  3.9999999999999996e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0916421  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3146  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.43 
 
 		 386 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.831222  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1590  chorismate mutase  30.15 
 
 		 399 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1313  chorismate mutase  32.97 
 
 		 359 aa  132  9e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.21838e-16 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1792  chorismate mutase / prephenate dehydratase  34.42 
 
 		 360 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027177 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1133  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  29.71 
 
 		 386 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.898271  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0235  chorismate mutase/prephenate dehydratase  28.31 
 
 		 391 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3039  chorismate mutase  35.9 
 
 		 355 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1437  prephenate dehydratase  31.75 
 
 		 276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3077  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  29.93 
 
 		 396 aa  130  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0866115  normal  0.0319555 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  34.41 
 
 		 382 aa  130  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0432  chorismate mutase/prephenate dehydratase  36.26 
 
 		 360 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2997  chorismate mutase/prephenate dehydratase  36.26 
 
 		 360 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.379619  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2575  chorismate mutase/prephenate dehydratase  36.26 
 
 		 360 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0950  chorismate mutase/prephenate dehydratase  36.26 
 
 		 360 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2885  chorismate mutase/prephenate dehydratase  36.26 
 
 		 360 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.629426  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0198  chorismate mutase/prephenate dehydratase  36.26 
 
 		 360 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2948  chorismate mutase/prephenate dehydratase  36.26 
 
 		 360 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>