More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2153 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2153  Prephenate dehydratase  100 
 
 
277 aa  543  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2061  Prephenate dehydratase  100 
 
 
277 aa  543  1e-154  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1779  prephenate dehydratase  97.83 
 
 
277 aa  535  1e-151  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.490374  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2039  prephenate dehydratase  76.81 
 
 
275 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402041 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1153  Prephenate dehydratase  49.45 
 
 
276 aa  253  3e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2260  prephenate dehydratase  40.81 
 
 
278 aa  238  5.999999999999999e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1244  Prephenate dehydratase  45.39 
 
 
283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1964  prephenate dehydratase  43.64 
 
 
279 aa  229  3e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.221167 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1424  prephenate dehydratase  39.78 
 
 
274 aa  226  3e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000368391  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1904  prephenate dehydratase  45.62 
 
 
372 aa  224  9e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0916421  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1552  prephenate dehydratase  42.8 
 
 
279 aa  223  4e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0248162  normal  0.310445 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0937  prephenate dehydratase  42.75 
 
 
272 aa  218  7e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0097  Prephenate dehydratase  49.08 
 
 
306 aa  217  2e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0078  prephenate dehydratase  39.78 
 
 
280 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0545378  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0121  Prephenate dehydratase  47.08 
 
 
305 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0008  Prephenate dehydratase  47.65 
 
 
279 aa  210  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4445  prephenate dehydratase  44.12 
 
 
274 aa  208  9e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1930  prephenate dehydratase  41.16 
 
 
311 aa  207  2e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.898282 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01900  Prephenate dehydratase  38.87 
 
 
303 aa  206  3e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0806  prephenate dehydratase  37.72 
 
 
284 aa  205  7e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  44.2 
 
 
371 aa  204  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  44.32 
 
 
386 aa  204  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0282  Prephenate dehydratase  44.53 
 
 
326 aa  202  4e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.209842 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0071  prephenate dehydratase  45.26 
 
 
324 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  39.78 
 
 
373 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0138  prephenate dehydratase  41.67 
 
 
327 aa  199  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01130  prephenate dehydratase  43.75 
 
 
316 aa  199  5e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0141  Prephenate dehydratase  45.26 
 
 
306 aa  199  6e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341146  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1497  P-protein (prephenate dehydratase / chorismate mutase)  40.15 
 
 
374 aa  198  9e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554673  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2105  prephenate dehydratase  45.09 
 
 
318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.547731 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1594  prephenate dehydratase  34.06 
 
 
311 aa  196  3e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1442  chorismate mutase  39.78 
 
 
374 aa  196  3e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.105369  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00716  P-protein  38.97 
 
 
402 aa  194  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00262272  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1887  chorismate mutase-P and prephenate dehydratase  41.39 
 
 
360 aa  194  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000192693  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1293  Prephenate dehydratase  44.2 
 
 
293 aa  194  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.821795  normal  0.378721 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3051  Prephenate dehydratase  39.64 
 
 
286 aa  194  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0633  Prephenate dehydratase  45.82 
 
 
285 aa  193  3e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0268  Prephenate dehydratase  46.35 
 
 
311 aa  193  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  39.71 
 
 
359 aa  192  4e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1345  chorismate mutase  41.39 
 
 
359 aa  192  4e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3039  chorismate mutase  39.85 
 
 
355 aa  192  5e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1336  chorismate mutase  40.49 
 
 
413 aa  192  7e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6401  Prephenate dehydratase  44.49 
 
 
305 aa  191  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1334  prephenate dehydratase  41.39 
 
 
280 aa  190  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000128945  normal  0.202615 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2485  prephenate dehydratase  43.96 
 
 
349 aa  189  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5270  Prephenate dehydratase  41.88 
 
 
315 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271199  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08570  prephenate dehydratase  38.35 
 
 
286 aa  188  7e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0097  Prephenate dehydratase  44.53 
 
 
314 aa  188  8e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0315701 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  39.34 
 
 
359 aa  188  8e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0774  chorismate mutase  39.93 
 
 
371 aa  187  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.561025  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0904  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.93 
 
 
371 aa  186  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1207  chorismate mutase  40.44 
 
 
371 aa  187  2e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0297935 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  36.4 
 
 
365 aa  187  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4522  prephenate dehydratase  44.89 
 
 
318 aa  187  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0845  chorismate mutase  39.93 
 
 
371 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0602148 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3053  prephenate dehydratase  42.09 
 
 
315 aa  186  3e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  35.66 
 
 
364 aa  186  4e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1594  prephenate dehydratase  42.96 
 
 
317 aa  186  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0572712  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3645  chorismate mutasea  35.66 
 
 
364 aa  186  5e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734175  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  38.38 
 
 
356 aa  186  5e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  36.4 
 
 
364 aa  185  5e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0302882 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  36.03 
 
 
367 aa  185  6e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2091  Chorismate mutase  42.6 
 
 
280 aa  185  7e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.746584  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  36.03 
 
 
364 aa  185  7e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  38.97 
 
 
358 aa  185  8e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1747  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.29 
 
 
364 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0966339  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2535  prephenate dehydratase  35.21 
 
 
282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23140  chorismate mutase, clade 2  42.46 
 
 
706 aa  184  1.0000000000000001e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.839893  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  35.66 
 
 
364 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  38.1 
 
 
358 aa  183  3e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  35.66 
 
 
364 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.11 
 
 
358 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1418  chorismate mutase/prephenate dehydratase  38.97 
 
 
362 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1462  prephenate dehydratase  38.24 
 
 
358 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1284  prephenate dehydratase  37.68 
 
 
295 aa  181  9.000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000630901  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13872  prephenate dehydratase  41.64 
 
 
321 aa  181  1e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2608  chorismate mutase/prephenate dehydratase  40.07 
 
 
358 aa  181  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2192  chorismate mutase  40 
 
 
355 aa  181  1e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1067  Prephenate dehydratase  38.77 
 
 
288 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2723  chorismate mutase  37.13 
 
 
381 aa  179  2.9999999999999997e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5032  prephenate dehydratase  45.05 
 
 
318 aa  179  4e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0877  Prephenate dehydratase  38.57 
 
 
288 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1096  Prephenate dehydratase  38.41 
 
 
288 aa  179  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  37.32 
 
 
358 aa  178  7e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23280  chorismate mutase  33.82 
 
 
365 aa  178  8e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2147  prephenate dehydratase  35.29 
 
 
373 aa  178  9e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.707843  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0951  chorismate mutase / prephenate dehydratase  40.15 
 
 
365 aa  178  1e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.356586  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1567  prephenate dehydratase  34.93 
 
 
271 aa  177  1e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0862  prephenate dehydratase / chorismate mutase  38.6 
 
 
368 aa  177  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0474  Prephenate dehydratase  39.21 
 
 
279 aa  176  4e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0009  chorismate mutase  37.91 
 
 
385 aa  176  4e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5662  prephenate dehydratase  43.16 
 
 
312 aa  176  5e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.963646  normal  0.0943658 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1963  chorismate mutase  33.46 
 
 
365 aa  175  8e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1274  Prephenate dehydratase  39.78 
 
 
283 aa  175  9e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.143438  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0495  Prephenate dehydratase  39.21 
 
 
279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  36.36 
 
 
382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0121  prephenate dehydratase  34.93 
 
 
356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0665  prephenate dehydratase  36.96 
 
 
293 aa  172  3.9999999999999995e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.27815  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0541  Prephenate dehydratase  38.57 
 
 
279 aa  171  7.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0716  prephenate dehydratase / chorismate mutase  36 
 
 
387 aa  171  9e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>