More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1644 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1644  prephenate dehydratase  100 
 
 		 280 aa  580  1e-164  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0474  Prephenate dehydratase  79.14 
 
 		 279 aa  454  1e-127  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0180  prephenate dehydratase  75.8 
 
 		 283 aa  441  1e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0537  prephenate dehydratase  75.71 
 
 		 279 aa  441  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0656  Prephenate dehydratase  75.55 
 
 		 276 aa  434  1e-121  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.416459  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0495  Prephenate dehydratase  72.76 
 
 		 279 aa  418  1e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0541  Prephenate dehydratase  71.22 
 
 		 279 aa  408  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2043  prephenate dehydratase  45.49 
 
 		 283 aa  220  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.64689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0877  Prephenate dehydratase  43.21 
 
 		 288 aa  218  6e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13638  predicted protein  45.49 
 
 		 348 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0633  Prephenate dehydratase  46.59 
 
 		 285 aa  212  7e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_3267  predicted protein  41.99 
 
 		 304 aa  209  5e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  39.86 
 
 		 358 aa  206  3e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  40.94 
 
 		 358 aa  206  4e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1293  Prephenate dehydratase  41.9 
 
 		 293 aa  205  8e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.821795  normal  0.378721 
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  40.58 
 
 		 358 aa  203  3e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2091  Chorismate mutase  41.52 
 
 		 280 aa  200  3e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.746584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1567  prephenate dehydratase  37.32 
 
 		 271 aa  181  1e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1341  prephenate dehydratase  36.92 
 
 		 384 aa  181  1e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.409344  normal  0.126516 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0937  prephenate dehydratase  38.21 
 
 		 272 aa  180  2e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0774  chorismate mutase  38.63 
 
 		 371 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.561025  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3518  prephenate dehydratase  38.27 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4403  prephenate dehydratase  37.09 
 
 		 284 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4087  prephenate dehydratase  37.32 
 
 		 290 aa  172  5e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0845  chorismate mutase  38.27 
 
 		 371 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0602148 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1334  prephenate dehydratase  41.67 
 
 		 303 aa  172  5.999999999999999e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0904  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.91 
 
 		 371 aa  171  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4083  prephenate dehydratase  36.73 
 
 		 284 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0689378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3039  chorismate mutase  36.88 
 
 		 355 aa  171  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2061  Prephenate dehydratase  37.86 
 
 		 277 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2153  Prephenate dehydratase  37.86 
 
 		 277 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1686  chorismate mutase / prephenate dehydratase  37.05 
 
 		 355 aa  170  3e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1779  prephenate dehydratase  37.5 
 
 		 277 aa  169  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.490374  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1207  chorismate mutase  37.91 
 
 		 371 aa  169  4e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0297935 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3724  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  36 
 
 		 632 aa  169  4e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0653  prephenate dehydratase  37.18 
 
 		 280 aa  169  4e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0018  prephenate dehydratase  37.23 
 
 		 287 aa  169  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3538  prephenate dehydratase  37.23 
 
 		 284 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1424  prephenate dehydratase  34.16 
 
 		 274 aa  169  5e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000368391  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4217  prephenate dehydratase  37.09 
 
 		 280 aa  169  6e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.239434  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3428  prephenate dehydratase  36.63 
 
 		 284 aa  168  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1988  prephenate dehydratase  39.93 
 
 		 287 aa  167  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.630591  normal  0.549246 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1767  prephenate dehydratase  36.56 
 
 		 284 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0567003 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0102  prephenate dehydratase  38.18 
 
 		 287 aa  167  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.29138  normal  0.214423 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1345  prephenate dehydratase  38.32 
 
 		 379 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3606  Prephenate dehydratase  36.46 
 
 		 285 aa  167  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7058  prephenate dehydratase  37.82 
 
 		 286 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2629  prephenate dehydratase  37.36 
 
 		 286 aa  166  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.216997 
 
 
-
 
NC_004310  BR0037  prephenate dehydratase  35.82 
 
 		 287 aa  166  5e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.51728  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0037  prephenate dehydratase  35.82 
 
 		 287 aa  166  5e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.771092  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3650  prephenate dehydratase  38.85 
 
 		 285 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.243627  normal  0.169343 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  35.48 
 
 		 364 aa  165  8e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  35.48 
 
 		 367 aa  165  8e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1620  prephenate dehydratase  36.26 
 
 		 284 aa  165  8e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159121  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1552  prephenate dehydratase  37.28 
 
 		 279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0248162  normal  0.310445 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0961  chorismate mutase  37.41 
 
 		 374 aa  164  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1964  prephenate dehydratase  36.92 
 
 		 279 aa  163  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221167 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  35.38 
 
 		 364 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302882 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  35.48 
 
 		 364 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  35.38 
 
 		 364 aa  163  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0174  chorismate mutase  37.05 
 
 		 361 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2192  chorismate mutase  38.57 
 
 		 355 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3645  chorismate mutasea  35.02 
 
 		 364 aa  162  6e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0105  prephenate dehydratase  38.4 
 
 		 265 aa  161  9e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0741  chorismate mutase  37.41 
 
 		 360 aa  161  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1747  chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.66 
 
 		 364 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0966339  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1244  Prephenate dehydratase  37.86 
 
 		 283 aa  161  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0418  Prephenate dehydratase  37.41 
 
 		 287 aa  161  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  35.74 
 
 		 364 aa  161  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2951  prephenate dehydratase  38.83 
 
 		 286 aa  160  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.217306 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3912  Prephenate dehydratase  36.33 
 
 		 288 aa  160  3e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2723  chorismate mutase  35.61 
 
 		 381 aa  159  3e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0716  prephenate dehydratase / chorismate mutase  35.61 
 
 		 387 aa  159  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0977  prephenate dehydratase / chorismate mutase  38.32 
 
 		 360 aa  158  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.23904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3732  prephenate dehydratase  36.2 
 
 		 286 aa  158  8e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.755175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1193  chorismate mutase  31.9 
 
 		 366 aa  157  1e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0642  prephenate dehydratase  37.59 
 
 		 287 aa  158  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0930161  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0384  Prephenate dehydratase  36.33 
 
 		 285 aa  157  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.020412  normal  0.492047 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3006  chorismate mutase  38.32 
 
 		 360 aa  157  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224868  normal  0.0525817 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0511  prephenate dehydratase  35.16 
 
 		 284 aa  157  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0339  prephenate dehydratase  36.33 
 
 		 285 aa  157  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1569  chorismate mutase  36.56 
 
 		 360 aa  157  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203479  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  34.3 
 
 		 365 aa  157  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01900  Prephenate dehydratase  35.94 
 
 		 303 aa  157  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1963  chorismate mutase  34.3 
 
 		 365 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  34.66 
 
 		 382 aa  156  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0252  prephenate dehydratase  37.18 
 
 		 293 aa  156  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23280  chorismate mutase  34.3 
 
 		 365 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1594  prephenate dehydratase  34.78 
 
 		 311 aa  156  3e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2828  prephenate dehydratase / chorismate mutase  31.41 
 
 		 667 aa  156  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2910  prephenate dehydratase / chorismate mutase  31.41 
 
 		 667 aa  156  4e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3007  chorismate mutase / prephenate dehydratase  31.41 
 
 		 667 aa  156  4e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3162  prephenate dehydratase  38.27 
 
 		 288 aa  155  6e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.309807  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  35.02 
 
 		 359 aa  155  7e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0365  chorismate mutase / prephenate dehydratase  29.64 
 
 		 385 aa  154  1e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0036667  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1881  prephenate dehydratase  36.33 
 
 		 298 aa  154  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.858484 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1367  chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.41 
 
 		 671 aa  154  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0897  chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.86 
 
 		 358 aa  154  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.255743  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1142  prephenate dehydratase  35.46 
 
 		 269 aa  153  2e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1019  chorismate mutase  37.86 
 
 		 358 aa  154  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.789998  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>