More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0541 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0541  Prephenate dehydratase  100 
 
 		 279 aa  577  1e-164  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0495  Prephenate dehydratase  74.46 
 
 		 279 aa  432  1e-120  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0474  Prephenate dehydratase  72.76 
 
 		 279 aa  428  1e-119  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0656  Prephenate dehydratase  73.82 
 
 		 276 aa  423  1e-117  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.416459  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0537  prephenate dehydratase  73.48 
 
 		 279 aa  423  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1644  prephenate dehydratase  71.22 
 
 		 280 aa  408  1e-113  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0180  prephenate dehydratase  70.92 
 
 		 283 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0877  Prephenate dehydratase  41.99 
 
 		 288 aa  216  5e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_3267  predicted protein  42.48 
 
 		 304 aa  214  9.999999999999999e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13638  predicted protein  44.98 
 
 		 348 aa  210  2e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2043  prephenate dehydratase  43.32 
 
 		 283 aa  209  4e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.64689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0633  Prephenate dehydratase  45.13 
 
 		 285 aa  201  9e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  42.03 
 
 		 358 aa  201  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  42.03 
 
 		 358 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1567  prephenate dehydratase  40.51 
 
 		 271 aa  199  5e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  40.94 
 
 		 358 aa  195  8.000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1293  Prephenate dehydratase  42.81 
 
 		 293 aa  193  3e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.821795  normal  0.378721 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2091  Chorismate mutase  41.82 
 
 		 280 aa  186  4e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.746584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4087  prephenate dehydratase  38.27 
 
 		 290 aa  176  3e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2061  Prephenate dehydratase  38.57 
 
 		 277 aa  171  9e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2153  Prephenate dehydratase  38.57 
 
 		 277 aa  171  9e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1341  prephenate dehydratase  36.04 
 
 		 384 aa  170  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.409344  normal  0.126516 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1779  prephenate dehydratase  38.21 
 
 		 277 aa  170  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.490374  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4403  prephenate dehydratase  35.48 
 
 		 284 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1881  prephenate dehydratase  37.18 
 
 		 298 aa  168  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.858484 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4083  prephenate dehydratase  35.74 
 
 		 284 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0689378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0774  chorismate mutase  37.09 
 
 		 371 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.561025  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0499  prephenate dehydratase  34.66 
 
 		 278 aa  167  2e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3428  prephenate dehydratase  36.46 
 
 		 284 aa  166  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0904  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.09 
 
 		 371 aa  166  5e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1594  prephenate dehydratase  35.46 
 
 		 311 aa  166  5e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0653  prephenate dehydratase  37 
 
 		 280 aa  166  5e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0047  prephenate dehydratase  36.17 
 
 		 269 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1424  prephenate dehydratase  34.17 
 
 		 274 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000368391  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0937  prephenate dehydratase  37.91 
 
 		 272 aa  165  9e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0845  chorismate mutase  36.73 
 
 		 371 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0602148 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1964  prephenate dehydratase  37.23 
 
 		 279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221167 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1988  prephenate dehydratase  38.1 
 
 		 287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.630591  normal  0.549246 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  38.18 
 
 		 359 aa  163  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  38.18 
 
 		 359 aa  162  6e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1552  prephenate dehydratase  36.52 
 
 		 279 aa  162  7e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0248162  normal  0.310445 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1142  prephenate dehydratase  35.94 
 
 		 269 aa  161  1e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  35.64 
 
 		 364 aa  161  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0806  prephenate dehydratase  37.41 
 
 		 284 aa  160  2e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3518  prephenate dehydratase  35.9 
 
 		 310 aa  160  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0776  prephenate dehydratase  35.23 
 
 		 269 aa  160  3e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.351833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0018  prephenate dehydratase  35.74 
 
 		 287 aa  159  5e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2951  prephenate dehydratase  36.92 
 
 		 286 aa  159  6e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.217306 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1334  prephenate dehydratase  40.07 
 
 		 303 aa  159  6e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  34.55 
 
 		 364 aa  157  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  34.55 
 
 		 365 aa  157  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3538  prephenate dehydratase  35.48 
 
 		 284 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23280  chorismate mutase  34.91 
 
 		 365 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3606  Prephenate dehydratase  35.53 
 
 		 285 aa  157  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  34.18 
 
 		 367 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  34.18 
 
 		 364 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  34.55 
 
 		 364 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302882 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1207  chorismate mutase  36.36 
 
 		 371 aa  156  4e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0297935 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0105  prephenate dehydratase  38.25 
 
 		 265 aa  155  5.0000000000000005e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  34.18 
 
 		 364 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1620  prephenate dehydratase  34.78 
 
 		 284 aa  155  6e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159121  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4217  prephenate dehydratase  35.53 
 
 		 280 aa  155  7e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.239434  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1345  prephenate dehydratase  38.32 
 
 		 379 aa  155  7e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1244  Prephenate dehydratase  36.07 
 
 		 283 aa  155  8e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1963  chorismate mutase  34.18 
 
 		 365 aa  155  8e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3645  chorismate mutasea  34.18 
 
 		 364 aa  155  9e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  34.55 
 
 		 358 aa  154  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0037  prephenate dehydratase  35.38 
 
 		 287 aa  155  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.771092  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0037  prephenate dehydratase  35.38 
 
 		 287 aa  155  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.51728  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1904  prephenate dehydratase  35.48 
 
 		 372 aa  154  1e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0916421  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1767  prephenate dehydratase  35.13 
 
 		 284 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0567003 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  34.66 
 
 		 373 aa  154  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1747  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.82 
 
 		 364 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0966339  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1930  prephenate dehydratase  37.07 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.898282 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0384  Prephenate dehydratase  35.25 
 
 		 285 aa  154  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.020412  normal  0.492047 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3039  chorismate mutase  32.98 
 
 		 355 aa  154  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3912  Prephenate dehydratase  35.48 
 
 		 288 aa  154  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1418  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.51 
 
 		 362 aa  153  4e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3732  prephenate dehydratase  35.13 
 
 		 286 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.755175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0841  prephenate dehydratase  34.77 
 
 		 268 aa  152  5e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2723  chorismate mutase  33.45 
 
 		 381 aa  152  5e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0418  Prephenate dehydratase  35.61 
 
 		 287 aa  151  8.999999999999999e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1336  chorismate mutase  34.49 
 
 		 413 aa  151  1e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2629  prephenate dehydratase  35.64 
 
 		 286 aa  151  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.216997 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0339  prephenate dehydratase  34.89 
 
 		 285 aa  151  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1792  chorismate mutase / prephenate dehydratase  34.05 
 
 		 360 aa  150  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027177 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1168  chorismate mutase  31.77 
 
 		 662 aa  150  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3724  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  32.73 
 
 		 632 aa  150  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1345  chorismate mutase  35.27 
 
 		 359 aa  150  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2858  chorismate mutase  32.4 
 
 		 373 aa  150  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.42066  hitchhiker  0.0000000270068 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3650  prephenate dehydratase  37.05 
 
 		 285 aa  149  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.243627  normal  0.169343 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0102  prephenate dehydratase  34.18 
 
 		 287 aa  150  3e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.29138  normal  0.214423 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0252  prephenate dehydratase  36.1 
 
 		 293 aa  149  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2828  prephenate dehydratase / chorismate mutase  31.05 
 
 		 667 aa  149  4e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2910  prephenate dehydratase / chorismate mutase  31.05 
 
 		 667 aa  149  4e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2913  chorismate mutase  31.41 
 
 		 648 aa  149  4e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3007  chorismate mutase / prephenate dehydratase  31.05 
 
 		 667 aa  149  4e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1072  chorismate mutase  31.05 
 
 		 654 aa  149  5e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1617  chorismate mutase  34.77 
 
 		 373 aa  149  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0511  prephenate dehydratase  34.78 
 
 		 284 aa  149  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>