More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0047 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0047  prephenate dehydratase  100 
 
 
269 aa  548  1e-155  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1142  prephenate dehydratase  94.8 
 
 
269 aa  527  1e-149  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0776  prephenate dehydratase  94.05 
 
 
269 aa  526  1e-148  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.351833  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0841  prephenate dehydratase  69.89 
 
 
268 aa  390  1e-107  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0499  prephenate dehydratase  54.81 
 
 
278 aa  280  2e-74  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0937  prephenate dehydratase  46.18 
 
 
272 aa  205  5e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1930  prephenate dehydratase  42.03 
 
 
311 aa  189  4e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.898282 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0806  prephenate dehydratase  42.19 
 
 
284 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1594  prephenate dehydratase  41.09 
 
 
311 aa  171  2e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1334  prephenate dehydratase  38.43 
 
 
280 aa  169  4e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000128945  normal  0.202615 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  35.27 
 
 
373 aa  167  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0541  Prephenate dehydratase  36.17 
 
 
279 aa  165  5.9999999999999996e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0537  prephenate dehydratase  34.88 
 
 
279 aa  160  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1904  prephenate dehydratase  36 
 
 
372 aa  159  4e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0916421  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01900  Prephenate dehydratase  39.78 
 
 
303 aa  159  5e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0877  Prephenate dehydratase  37.01 
 
 
288 aa  157  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0474  Prephenate dehydratase  34.88 
 
 
279 aa  156  3e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1424  prephenate dehydratase  37.1 
 
 
274 aa  156  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000368391  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1193  chorismate mutase  36 
 
 
366 aa  156  4e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1293  Prephenate dehydratase  36.13 
 
 
293 aa  154  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.821795  normal  0.378721 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0656  Prephenate dehydratase  34.52 
 
 
276 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.416459  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0495  Prephenate dehydratase  35.09 
 
 
279 aa  152  4e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3039  chorismate mutase  36.5 
 
 
355 aa  152  5e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2061  Prephenate dehydratase  33.33 
 
 
277 aa  152  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2153  Prephenate dehydratase  33.33 
 
 
277 aa  152  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1644  prephenate dehydratase  33.8 
 
 
280 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1779  prephenate dehydratase  32.96 
 
 
277 aa  152  8e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.490374  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2091  Chorismate mutase  33.94 
 
 
280 aa  151  8.999999999999999e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.746584  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0878  Prephenate dehydratase  39.06 
 
 
277 aa  150  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.583651  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0665  prephenate dehydratase  34.36 
 
 
293 aa  149  3e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.27815  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0174  chorismate mutase  35.16 
 
 
361 aa  150  3e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2192  chorismate mutase  34.62 
 
 
355 aa  150  3e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1881  prephenate dehydratase  36.33 
 
 
298 aa  149  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.858484 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  35.16 
 
 
371 aa  149  6e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1207  chorismate mutase  36.43 
 
 
371 aa  149  7e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0297935 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  37 
 
 
364 aa  148  8e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  37 
 
 
367 aa  148  9e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  37 
 
 
364 aa  148  9e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0121  prephenate dehydratase  39.84 
 
 
356 aa  148  9e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1284  prephenate dehydratase  32.8 
 
 
295 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000630901  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0716  prephenate dehydratase / chorismate mutase  35.29 
 
 
387 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  35.66 
 
 
382 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  36.26 
 
 
364 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0302882 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0180  prephenate dehydratase  33.33 
 
 
283 aa  144  1e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  37.96 
 
 
356 aa  144  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1153  Prephenate dehydratase  34.69 
 
 
276 aa  144  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1418  chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.44 
 
 
362 aa  143  3e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0774  chorismate mutase  36.26 
 
 
371 aa  143  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.561025  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  35.53 
 
 
364 aa  142  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0904  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.79 
 
 
371 aa  142  6e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  39.42 
 
 
386 aa  142  6e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3645  chorismate mutasea  36.26 
 
 
364 aa  142  7e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734175  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0845  chorismate mutase  35.9 
 
 
371 aa  142  8e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0602148 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0961  chorismate mutase  32.72 
 
 
374 aa  141  9e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1747  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.16 
 
 
364 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0966339  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3673  Prephenate dehydratase  35.16 
 
 
272 aa  141  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1019  chorismate mutase  35.86 
 
 
358 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.789998  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0897  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.86 
 
 
358 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.255743  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1313  chorismate mutase  35.56 
 
 
359 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  2.21838e-16 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1963  chorismate mutase  37.3 
 
 
365 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2858  chorismate mutase  37.18 
 
 
373 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.42066  hitchhiker  0.0000000270068 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1567  prephenate dehydratase  34.56 
 
 
271 aa  139  3e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  36.89 
 
 
365 aa  140  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  37.3 
 
 
364 aa  140  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23280  chorismate mutase  36.89 
 
 
365 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  36.84 
 
 
359 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17071  chorismate mutase-prephenate dehydratase  34.67 
 
 
281 aa  139  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.530579  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2535  prephenate dehydratase  36.55 
 
 
282 aa  139  6e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  36.84 
 
 
359 aa  138  7e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16951  chorismate mutase-prephenate dehydratase  35.4 
 
 
281 aa  139  7e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1561  prephenate dehydratase  35 
 
 
264 aa  139  7e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0495  chorismate mutase  35.27 
 
 
359 aa  138  7e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0778684  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1336  chorismate mutase  33.22 
 
 
413 aa  139  7e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2607  Prephenate dehydratase  33.95 
 
 
268 aa  138  7e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.693661 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3121  chorismate mutase  31.76 
 
 
365 aa  138  7.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0293375 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2260  prephenate dehydratase  37.86 
 
 
278 aa  138  7.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1617  chorismate mutase  33.33 
 
 
373 aa  138  8.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1596  chorismate mutase-prephenate dehydratase  34.67 
 
 
281 aa  138  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0216  chorismate mutase  36.8 
 
 
355 aa  138  1e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5270  Prephenate dehydratase  34.81 
 
 
315 aa  138  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271199  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1887  chorismate mutase-P and prephenate dehydratase  32.72 
 
 
360 aa  137  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000192693  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0316  prephenate dehydratase  34.65 
 
 
291 aa  137  2e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51764  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1032  prephenate dehydratase  35.86 
 
 
264 aa  137  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.506723  normal  0.948926 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0977  prephenate dehydratase / chorismate mutase  37.55 
 
 
360 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.23904  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0741  chorismate mutase  37.75 
 
 
360 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0269  chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.6 
 
 
358 aa  137  2e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0914  prephenate dehydratase  34.63 
 
 
282 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1067  Prephenate dehydratase  31.45 
 
 
288 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0046  Prephenate dehydratase  32.93 
 
 
287 aa  136  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0480  prephenate dehydratase  32.87 
 
 
296 aa  136  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0463972  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1394  chorismate mutase  33.09 
 
 
371 aa  136  5e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0138573  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2466  chorismate mutase / prephenate dehydratase  33.09 
 
 
371 aa  136  5e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.148339 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16271  chorismate mutase-prephenate dehydratase  35.29 
 
 
281 aa  135  6.0000000000000005e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.763625  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0432  chorismate mutase/prephenate dehydratase  36.76 
 
 
360 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2948  chorismate mutase/prephenate dehydratase  36.76 
 
 
360 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2997  chorismate mutase/prephenate dehydratase  36.76 
 
 
360 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.379619  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0950  chorismate mutase/prephenate dehydratase  36.76 
 
 
360 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0470  chorismate mutase, gamma, beta and epsilon  33.21 
 
 
363 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1792  chorismate mutase / prephenate dehydratase  33.82 
 
 
360 aa  135  6.0000000000000005e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00027177 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2885  chorismate mutase/prephenate dehydratase  36.76 
 
 
360 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.629426  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>