More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1904 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1904  prephenate dehydratase  100 
 
 		 372 aa  735    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0916421  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  46.09 
 
 		 386 aa  295  8e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1153  Prephenate dehydratase  52.54 
 
 		 276 aa  249  4e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0937  prephenate dehydratase  46.89 
 
 		 272 aa  229  7e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1779  prephenate dehydratase  46.35 
 
 		 277 aa  227  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.490374  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2153  Prephenate dehydratase  45.62 
 
 		 277 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1244  Prephenate dehydratase  45.99 
 
 		 283 aa  225  1e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2061  Prephenate dehydratase  45.62 
 
 		 277 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1594  prephenate dehydratase  39.56 
 
 		 311 aa  223  3e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0078  prephenate dehydratase  41.24 
 
 		 280 aa  219  5e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0545378  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1964  prephenate dehydratase  44.49 
 
 		 279 aa  216  5e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221167 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  42.59 
 
 		 373 aa  216  5e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01900  Prephenate dehydratase  41.61 
 
 		 303 aa  216  7e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1334  prephenate dehydratase  47.14 
 
 		 280 aa  213  2.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000128945  normal  0.202615 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2260  prephenate dehydratase  41.24 
 
 		 278 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1424  prephenate dehydratase  38.6 
 
 		 274 aa  212  9e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000368391  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  43.17 
 
 		 367 aa  209  9e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  43.17 
 
 		 364 aa  209  9e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  42.8 
 
 		 364 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302882 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  43.17 
 
 		 364 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  42.44 
 
 		 364 aa  207  3e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0174  chorismate mutase  44.81 
 
 		 361 aa  206  4e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1552  prephenate dehydratase  42.65 
 
 		 279 aa  206  7e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0248162  normal  0.310445 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1538  chorismate mutase  45.05 
 
 		 362 aa  205  1e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3645  chorismate mutasea  43.17 
 
 		 364 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23280  chorismate mutase  42.07 
 
 		 365 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3039  chorismate mutase  42.44 
 
 		 355 aa  204  2e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  42.8 
 
 		 365 aa  203  3e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  42.07 
 
 		 364 aa  202  6e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1336  chorismate mutase  43.46 
 
 		 413 aa  202  6e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1442  chorismate mutase  42.44 
 
 		 374 aa  202  6e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.105369  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0897  chorismate mutase/prephenate dehydratase  44.07 
 
 		 358 aa  202  7e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.255743  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1019  chorismate mutase  44.07 
 
 		 358 aa  202  7e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.789998  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1747  chorismate mutase/prephenate dehydratase  42.44 
 
 		 364 aa  202  8e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0966339  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1963  chorismate mutase  41.7 
 
 		 365 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1497  P-protein (prephenate dehydratase / chorismate mutase)  42.07 
 
 		 374 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554673  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2192  chorismate mutase  43.64 
 
 		 355 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3051  Prephenate dehydratase  37.5 
 
 		 286 aa  201  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2858  chorismate mutase  41.76 
 
 		 373 aa  200  3e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.42066  hitchhiker  0.0000000270068 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00716  P-protein  42.44 
 
 		 402 aa  200  3e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00262272  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  41.7 
 
 		 359 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4445  prephenate dehydratase  43.17 
 
 		 274 aa  199  6e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1930  prephenate dehydratase  40.27 
 
 		 311 aa  199  6e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.898282 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1345  chorismate mutase  42.96 
 
 		 359 aa  199  9e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2147  prephenate dehydratase  41.18 
 
 		 373 aa  195  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.707843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  40.96 
 
 		 359 aa  194  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0878  Prephenate dehydratase  39.85 
 
 		 277 aa  194  2e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.583651  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0495  chorismate mutase  41.18 
 
 		 359 aa  194  3e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0778684  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1207  chorismate mutase  41.7 
 
 		 371 aa  193  4e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0297935 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2039  prephenate dehydratase  47.45 
 
 		 275 aa  192  8e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402041 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1313  chorismate mutase  41.18 
 
 		 359 aa  191  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.21838e-16 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0806  prephenate dehydratase  37.5 
 
 		 284 aa  191  2e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  40.74 
 
 		 358 aa  191  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1887  chorismate mutase-P and prephenate dehydratase  42.59 
 
 		 360 aa  188  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000192693  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5270  Prephenate dehydratase  41.9 
 
 		 315 aa  188  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1686  chorismate mutase / prephenate dehydratase  42.12 
 
 		 355 aa  187  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1418  chorismate mutase/prephenate dehydratase  43.96 
 
 		 362 aa  187  3e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1067  Prephenate dehydratase  41.01 
 
 		 288 aa  186  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0009  chorismate mutase  40.66 
 
 		 385 aa  186  5e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1462  prephenate dehydratase  39.63 
 
 		 358 aa  186  5e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1096  Prephenate dehydratase  41.01 
 
 		 288 aa  186  6e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23140  chorismate mutase, clade 2  41.94 
 
 		 706 aa  185  9e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.839893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0499  prephenate dehydratase  37.37 
 
 		 278 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  44.49 
 
 		 371 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  38.52 
 
 		 356 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3022  chorismate mutase  40.43 
 
 		 360 aa  184  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.123559  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2539  chorismate mutase  40.96 
 
 		 399 aa  183  4.0000000000000006e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.409768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0774  chorismate mutase  40.15 
 
 		 371 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.561025  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0904  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  40.15 
 
 		 371 aa  182  6e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0046  Prephenate dehydratase  39.13 
 
 		 287 aa  182  6e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0845  chorismate mutase  40.15 
 
 		 371 aa  182  6e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0602148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1394  chorismate mutase  39.42 
 
 		 371 aa  182  8.000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0138573  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2466  chorismate mutase / prephenate dehydratase  39.42 
 
 		 371 aa  182  8.000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.148339 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0716  prephenate dehydratase / chorismate mutase  38.38 
 
 		 387 aa  182  9.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  38.46 
 
 		 382 aa  182  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0926  chorismate mutase / prephenate dehydratase  45.19 
 
 		 367 aa  181  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1023  chorismate mutase  40.96 
 
 		 365 aa  181  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08570  prephenate dehydratase  40.64 
 
 		 286 aa  181  2e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0008  Prephenate dehydratase  40.94 
 
 		 279 aa  179  4.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2535  prephenate dehydratase  36.75 
 
 		 282 aa  179  7e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0268  Prephenate dehydratase  45.1 
 
 		 311 aa  179  7e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6401  Prephenate dehydratase  42.91 
 
 		 305 aa  179  8e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0097  Prephenate dehydratase  44.72 
 
 		 306 aa  178  1e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3053  prephenate dehydratase  38.28 
 
 		 315 aa  178  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0121  prephenate dehydratase  37.04 
 
 		 356 aa  178  1e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1617  chorismate mutase  40.51 
 
 		 373 aa  178  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2608  chorismate mutase/prephenate dehydratase  41.11 
 
 		 358 aa  177  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0862  prephenate dehydratase / chorismate mutase  40.37 
 
 		 368 aa  177  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0951  chorismate mutase / prephenate dehydratase  40.36 
 
 		 365 aa  177  3e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.356586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2723  chorismate mutase  38.28 
 
 		 381 aa  177  3e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1950  prephenate dehydratase  40.37 
 
 		 366 aa  176  4e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1569  chorismate mutase  38.91 
 
 		 360 aa  176  5e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203479  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2105  prephenate dehydratase  43.11 
 
 		 318 aa  176  5e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.547731 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0741  chorismate mutase  40.96 
 
 		 360 aa  176  8e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2793  chorismate mutase  39.19 
 
 		 360 aa  175  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163655 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0801  chorismate mutase  36.53 
 
 		 359 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1792  chorismate mutase / prephenate dehydratase  38.46 
 
 		 360 aa  173  3.9999999999999995e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027177 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1274  Prephenate dehydratase  38.99 
 
 		 283 aa  172  5.999999999999999e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.143438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0977  prephenate dehydratase / chorismate mutase  40.89 
 
 		 360 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.23904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1635  chorismate mutase/prephenate dehydratase  41.48 
 
 		 360 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>