More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4445 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4445  prephenate dehydratase  100 
 
 
274 aa  556  1e-157  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1244  Prephenate dehydratase  58.76 
 
 
283 aa  315  4e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1964  prephenate dehydratase  57.3 
 
 
279 aa  313  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.221167 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1552  prephenate dehydratase  57.3 
 
 
279 aa  313  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0248162  normal  0.310445 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1779  prephenate dehydratase  44.12 
 
 
277 aa  218  7e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.490374  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2061  Prephenate dehydratase  44.12 
 
 
277 aa  218  7e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2153  Prephenate dehydratase  44.12 
 
 
277 aa  218  7e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1594  prephenate dehydratase  35.74 
 
 
311 aa  210  2e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1424  prephenate dehydratase  38.41 
 
 
274 aa  206  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000368391  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0937  prephenate dehydratase  42.7 
 
 
272 aa  207  2e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1904  prephenate dehydratase  43.33 
 
 
372 aa  206  3e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0916421  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3039  chorismate mutase  41.48 
 
 
355 aa  205  6e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0774  chorismate mutase  40.74 
 
 
371 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.561025  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  38.32 
 
 
359 aa  199  3e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1462  prephenate dehydratase  39.85 
 
 
358 aa  198  6e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0845  chorismate mutase  40.37 
 
 
371 aa  198  7e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0602148 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  38.75 
 
 
365 aa  198  9e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0121  prephenate dehydratase  40.96 
 
 
356 aa  197  1.0000000000000001e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2192  chorismate mutase  39.34 
 
 
355 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  38.01 
 
 
364 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0078  prephenate dehydratase  41.39 
 
 
280 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0545378  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  38.75 
 
 
367 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  38.38 
 
 
364 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0302882 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  38.75 
 
 
364 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  38.75 
 
 
364 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1963  chorismate mutase  38.01 
 
 
365 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  37.96 
 
 
359 aa  195  6e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01900  Prephenate dehydratase  35.82 
 
 
303 aa  195  6e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23280  chorismate mutase  38.01 
 
 
365 aa  195  7e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  38.01 
 
 
364 aa  194  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  39.93 
 
 
358 aa  194  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  37.04 
 
 
373 aa  193  3e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2260  prephenate dehydratase  38.55 
 
 
278 aa  193  3e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0904  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.63 
 
 
371 aa  192  4e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  39.05 
 
 
382 aa  192  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1747  chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.64 
 
 
364 aa  192  7e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0966339  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3645  chorismate mutasea  37.27 
 
 
364 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734175  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1153  Prephenate dehydratase  39.35 
 
 
276 aa  190  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2608  chorismate mutase/prephenate dehydratase  40.96 
 
 
358 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0716  prephenate dehydratase / chorismate mutase  39.42 
 
 
387 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1345  chorismate mutase  38.75 
 
 
359 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  41.33 
 
 
386 aa  189  5e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2039  prephenate dehydratase  43.17 
 
 
275 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402041 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1334  prephenate dehydratase  41.24 
 
 
280 aa  186  4e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000128945  normal  0.202615 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1538  chorismate mutase  38.38 
 
 
362 aa  186  4e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0480  prephenate dehydratase  38.62 
 
 
296 aa  185  9e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0463972  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0951  chorismate mutase / prephenate dehydratase  40.52 
 
 
365 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.356586  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1887  chorismate mutase-P and prephenate dehydratase  39.56 
 
 
360 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000192693  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  36.53 
 
 
356 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1232  prephenate dehydratase  40.74 
 
 
363 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.964016 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2858  chorismate mutase  36.26 
 
 
373 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.42066  hitchhiker  0.0000000270068 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1207  chorismate mutase  38.01 
 
 
371 aa  183  3e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0297935 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0862  prephenate dehydratase / chorismate mutase  39.48 
 
 
368 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0897  chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.85 
 
 
358 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.255743  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1019  chorismate mutase  39.85 
 
 
358 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.789998  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1250  chorismate mutase  35.93 
 
 
382 aa  181  2e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149804  normal  0.0219371 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0801  chorismate mutase  36.03 
 
 
359 aa  176  3e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0138  prephenate dehydratase  37 
 
 
327 aa  175  6e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1749  prephenate dehydratase  38.15 
 
 
418 aa  175  8e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0665  prephenate dehydratase  37.28 
 
 
293 aa  175  9e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.27815  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  35.84 
 
 
358 aa  174  9e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  39.56 
 
 
371 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0282  Prephenate dehydratase  38.1 
 
 
326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.209842 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  35.16 
 
 
358 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0009  chorismate mutase  37.87 
 
 
385 aa  172  3.9999999999999995e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2535  prephenate dehydratase  36.4 
 
 
282 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0097  Prephenate dehydratase  38.99 
 
 
306 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0926  chorismate mutase / prephenate dehydratase  36.9 
 
 
367 aa  171  7.999999999999999e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1442  chorismate mutase  35.79 
 
 
374 aa  171  1e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.105369  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0174  chorismate mutase  36.43 
 
 
361 aa  171  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6401  Prephenate dehydratase  39.64 
 
 
305 aa  171  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.67 
 
 
358 aa  170  2e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1313  chorismate mutase  40.3 
 
 
359 aa  170  2e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  2.21838e-16 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0046  Prephenate dehydratase  37.72 
 
 
287 aa  169  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3051  Prephenate dehydratase  36.92 
 
 
286 aa  169  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1204  chorismate mutase  35.93 
 
 
393 aa  170  3e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.973222  normal  0.768195 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0495  chorismate mutase  39.93 
 
 
359 aa  170  3e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0778684  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1418  chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.32 
 
 
362 aa  169  4e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00716  P-protein  33.33 
 
 
402 aa  169  5e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00262272  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1186  prephenate dehydratase  35.56 
 
 
393 aa  168  7e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.343107 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1686  chorismate mutase / prephenate dehydratase  38.15 
 
 
355 aa  168  9e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1497  P-protein (prephenate dehydratase / chorismate mutase)  35.06 
 
 
374 aa  167  1e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554673  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1336  chorismate mutase  35.69 
 
 
413 aa  168  1e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2147  prephenate dehydratase  33.95 
 
 
373 aa  167  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.707843  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3487  prephenate dehydratase  35.69 
 
 
379 aa  167  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2575  chorismate mutase/prephenate dehydratase  38.83 
 
 
360 aa  165  9e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2948  chorismate mutase/prephenate dehydratase  38.83 
 
 
360 aa  165  9e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0432  chorismate mutase/prephenate dehydratase  38.83 
 
 
360 aa  165  9e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2997  chorismate mutase/prephenate dehydratase  38.83 
 
 
360 aa  165  9e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.379619  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0198  chorismate mutase/prephenate dehydratase  38.83 
 
 
360 aa  165  9e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0950  chorismate mutase/prephenate dehydratase  38.83 
 
 
360 aa  165  9e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2885  chorismate mutase/prephenate dehydratase  38.83 
 
 
360 aa  165  9e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.629426  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1635  chorismate mutase/prephenate dehydratase  38.46 
 
 
360 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0176  chorismate mutase / prephenate dehydratase  37.87 
 
 
368 aa  164  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000165847  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1950  prephenate dehydratase  37.41 
 
 
366 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0806  prephenate dehydratase  34.15 
 
 
284 aa  163  3e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23140  chorismate mutase, clade 2  36.75 
 
 
706 aa  163  3e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.839893  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1930  prephenate dehydratase  35.91 
 
 
311 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.898282 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16271  chorismate mutase-prephenate dehydratase  38.1 
 
 
281 aa  162  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.763625  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0268  Prephenate dehydratase  37.68 
 
 
311 aa  162  6e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>