More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6401 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_6401  Prephenate dehydratase  100 
 
 		 305 aa  602  1.0000000000000001e-171  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4522  prephenate dehydratase  61.61 
 
 		 318 aa  336  2.9999999999999997e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5032  prephenate dehydratase  60.97 
 
 		 318 aa  329  4e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0268  Prephenate dehydratase  55.41 
 
 		 311 aa  290  2e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5270  Prephenate dehydratase  51.77 
 
 		 315 aa  282  5.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0121  Prephenate dehydratase  52.33 
 
 		 305 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0097  Prephenate dehydratase  52.13 
 
 		 314 aa  270  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0315701 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2105  prephenate dehydratase  53.31 
 
 		 318 aa  265  1e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.547731 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3053  prephenate dehydratase  48.55 
 
 		 315 aa  261  6.999999999999999e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2485  prephenate dehydratase  50.33 
 
 		 349 aa  261  8e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0141  Prephenate dehydratase  50.98 
 
 		 306 aa  260  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341146  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0071  prephenate dehydratase  51.16 
 
 		 324 aa  259  3e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0138  prephenate dehydratase  46.71 
 
 		 327 aa  253  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0282  Prephenate dehydratase  47.25 
 
 		 326 aa  250  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.209842 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01130  prephenate dehydratase  48.51 
 
 		 316 aa  244  9.999999999999999e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1594  prephenate dehydratase  48.31 
 
 		 317 aa  241  9e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0572712  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3187  Prephenate dehydratase  47.1 
 
 		 322 aa  234  9e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.32144  normal  0.019372 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0377  Prephenate dehydratase  46.06 
 
 		 335 aa  231  1e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.461559 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5415  prephenate dehydratase  51.46 
 
 		 315 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5034  prephenate dehydratase  51.13 
 
 		 315 aa  230  3e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431184  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5122  prephenate dehydratase  51.13 
 
 		 315 aa  230  3e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.348107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13872  prephenate dehydratase  48.87 
 
 		 321 aa  226  4e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0245  Prephenate dehydratase  49.68 
 
 		 314 aa  217  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00775166  hitchhiker  0.00464716 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5662  prephenate dehydratase  49.37 
 
 		 312 aa  216  5e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.963646  normal  0.0943658 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1145  prephenate dehydratase  47.62 
 
 		 309 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0149983  normal  0.0340431 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0100  Prephenate dehydratase  46.98 
 
 		 300 aa  212  4.9999999999999996e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.863601  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06790  prephenate dehydratase  44.84 
 
 		 325 aa  209  4e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.299471  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0937  prephenate dehydratase  43.38 
 
 		 272 aa  199  6e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2061  Prephenate dehydratase  44.49 
 
 		 277 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01190  prephenate dehydratase  46.53 
 
 		 301 aa  191  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.70392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2153  Prephenate dehydratase  44.49 
 
 		 277 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1779  prephenate dehydratase  44.49 
 
 		 277 aa  189  4e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.490374  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0218  Prephenate dehydratase  46.93 
 
 		 314 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1904  prephenate dehydratase  42.91 
 
 		 372 aa  179  5.999999999999999e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0916421  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1153  Prephenate dehydratase  40.07 
 
 		 276 aa  177  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0145  Prephenate dehydratase  43.27 
 
 		 311 aa  177  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1887  chorismate mutase-P and prephenate dehydratase  40.36 
 
 		 360 aa  176  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000192693  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2608  chorismate mutase/prephenate dehydratase  41.97 
 
 		 358 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1552  prephenate dehydratase  39.08 
 
 		 279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0248162  normal  0.310445 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0862  prephenate dehydratase / chorismate mutase  41.03 
 
 		 368 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0078  prephenate dehydratase  37.14 
 
 		 280 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0545378  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  38.46 
 
 		 358 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1244  Prephenate dehydratase  38.49 
 
 		 283 aa  172  7.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1345  chorismate mutase  39.93 
 
 		 359 aa  171  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01900  Prephenate dehydratase  35.31 
 
 		 303 aa  170  3e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1462  prephenate dehydratase  37.73 
 
 		 358 aa  169  4e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0878  Prephenate dehydratase  35.69 
 
 		 277 aa  169  7e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.583651  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  42.28 
 
 		 386 aa  168  8e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1250  chorismate mutase  37.96 
 
 		 382 aa  167  1e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149804  normal  0.0219371 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  37.36 
 
 		 359 aa  168  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2260  prephenate dehydratase  37.36 
 
 		 278 aa  168  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0121  prephenate dehydratase  35.93 
 
 		 356 aa  168  1e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0174  chorismate mutase  40.43 
 
 		 361 aa  167  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  37 
 
 		 359 aa  167  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1594  prephenate dehydratase  30.88 
 
 		 311 aa  167  2e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1964  prephenate dehydratase  39.29 
 
 		 279 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221167 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  36.43 
 
 		 356 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4445  prephenate dehydratase  39.64 
 
 		 274 aa  166  5e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3022  chorismate mutase  39.27 
 
 		 360 aa  165  9e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.123559  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1334  prephenate dehydratase  41.09 
 
 		 280 aa  163  3e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000128945  normal  0.202615 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  37.96 
 
 		 373 aa  163  3e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2535  prephenate dehydratase  37.41 
 
 		 282 aa  164  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0008  Prephenate dehydratase  39.27 
 
 		 279 aa  162  5.0000000000000005e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1204  chorismate mutase  38.55 
 
 		 393 aa  162  7e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.973222  normal  0.768195 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1336  chorismate mutase  38.13 
 
 		 413 aa  162  9e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1186  prephenate dehydratase  38.55 
 
 		 393 aa  161  1e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.343107 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  40.89 
 
 		 371 aa  161  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3149  prephenate dehydratase  36.46 
 
 		 283 aa  160  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.286294  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4280  prephenate dehydratase  36.1 
 
 		 283 aa  160  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000319515  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4168  prephenate dehydratase  36.46 
 
 		 283 aa  160  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4514  prephenate dehydratase  36.46 
 
 		 283 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.682816 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1418  chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.64 
 
 		 362 aa  160  4e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  36.86 
 
 		 364 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4179  prephenate dehydratase  36.46 
 
 		 283 aa  159  7e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.409752  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0926  chorismate mutase / prephenate dehydratase  41.24 
 
 		 367 aa  159  7e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  36.86 
 
 		 367 aa  158  8e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  36.86 
 
 		 364 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  36.5 
 
 		 364 aa  158  9e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302882 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1424  prephenate dehydratase  35.53 
 
 		 274 aa  158  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000368391  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0097  Prephenate dehydratase  39.72 
 
 		 306 aa  158  1e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4331  prephenate dehydratase  36.1 
 
 		 283 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.662649  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4666  prephenate dehydratase  36.1 
 
 		 283 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1274  Prephenate dehydratase  38.18 
 
 		 283 aa  157  3e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.143438  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4525  prephenate dehydratase  36.1 
 
 		 283 aa  156  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.802903  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2039  prephenate dehydratase  44.12 
 
 		 275 aa  156  3e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402041 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  36.13 
 
 		 364 aa  155  6e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4552  prephenate dehydratase  36.1 
 
 		 283 aa  155  6e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.115026  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0682  prephenate dehydratase  36.1 
 
 		 283 aa  155  6e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000690128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1207  chorismate mutase  37.36 
 
 		 371 aa  154  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0297935 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0665  prephenate dehydratase  35.38 
 
 		 293 aa  153  2.9999999999999998e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.27815  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0914  prephenate dehydratase  38.71 
 
 		 282 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1747  chorismate mutase/prephenate dehydratase  36.5 
 
 		 364 aa  153  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0966339  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1686  chorismate mutase / prephenate dehydratase  39.41 
 
 		 355 aa  153  4e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0176  chorismate mutase / prephenate dehydratase  40.59 
 
 		 368 aa  153  4e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000165847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4567  prephenate dehydratase  35.74 
 
 		 283 aa  152  5e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3645  chorismate mutasea  36.5 
 
 		 364 aa  152  7e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  37.82 
 
 		 365 aa  152  8.999999999999999e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2026  prephenate dehydratase  37.91 
 
 		 282 aa  150  2e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.713159  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0470  chorismate mutase, gamma, beta and epsilon  34.66 
 
 		 363 aa  151  2e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23280  chorismate mutase  35.64 
 
 		 365 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.110273 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>