More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3187 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_3187  Prephenate dehydratase  100 
 
 		 322 aa  630  1e-179  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.32144  normal  0.019372 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0377  Prephenate dehydratase  66.67 
 
 		 335 aa  379  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.461559 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0138  prephenate dehydratase  53.97 
 
 		 327 aa  316  4e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0282  Prephenate dehydratase  54.9 
 
 		 326 aa  305  5.0000000000000004e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.209842 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0121  Prephenate dehydratase  52.58 
 
 		 305 aa  296  2e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01130  prephenate dehydratase  53.25 
 
 		 316 aa  296  2e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0071  prephenate dehydratase  52.58 
 
 		 324 aa  296  3e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3053  prephenate dehydratase  50.95 
 
 		 315 aa  290  2e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0141  Prephenate dehydratase  52.9 
 
 		 306 aa  290  3e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2105  prephenate dehydratase  53.97 
 
 		 318 aa  290  3e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.547731 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2485  prephenate dehydratase  51.72 
 
 		 349 aa  289  5.0000000000000004e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5270  Prephenate dehydratase  51.1 
 
 		 315 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0268  Prephenate dehydratase  52.65 
 
 		 311 aa  276  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0245  Prephenate dehydratase  55.13 
 
 		 314 aa  275  1.0000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00775166  hitchhiker  0.00464716 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4522  prephenate dehydratase  48.47 
 
 		 318 aa  272  5.000000000000001e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0097  Prephenate dehydratase  53.18 
 
 		 314 aa  271  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0315701 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1594  prephenate dehydratase  49.38 
 
 		 317 aa  264  2e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0572712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5032  prephenate dehydratase  49.69 
 
 		 318 aa  251  8.000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6401  Prephenate dehydratase  47.1 
 
 		 305 aa  243  3.9999999999999997e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06790  prephenate dehydratase  46.67 
 
 		 325 aa  239  5.999999999999999e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.299471  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13872  prephenate dehydratase  46.11 
 
 		 321 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01190  prephenate dehydratase  46.33 
 
 		 301 aa  220  3e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.70392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5662  prephenate dehydratase  45.94 
 
 		 312 aa  220  3e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.963646  normal  0.0943658 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1145  prephenate dehydratase  44.06 
 
 		 309 aa  217  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0149983  normal  0.0340431 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0100  Prephenate dehydratase  47.42 
 
 		 300 aa  216  5e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.863601  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5415  prephenate dehydratase  44.2 
 
 		 315 aa  205  9e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5034  prephenate dehydratase  44.2 
 
 		 315 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431184  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5122  prephenate dehydratase  44.2 
 
 		 315 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.348107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0218  Prephenate dehydratase  44.41 
 
 		 314 aa  177  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1779  prephenate dehydratase  42.05 
 
 		 277 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.490374  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0937  prephenate dehydratase  38.95 
 
 		 272 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0078  prephenate dehydratase  36.36 
 
 		 280 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0545378  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2061  Prephenate dehydratase  41.34 
 
 		 277 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2153  Prephenate dehydratase  41.34 
 
 		 277 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2039  prephenate dehydratase  45.07 
 
 		 275 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402041 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0145  Prephenate dehydratase  41.67 
 
 		 311 aa  171  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  37.68 
 
 		 359 aa  169  5e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1244  Prephenate dehydratase  36.49 
 
 		 283 aa  169  6e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  37.32 
 
 		 359 aa  167  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2260  prephenate dehydratase  35.46 
 
 		 278 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0174  chorismate mutase  38.41 
 
 		 361 aa  166  5e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1153  Prephenate dehydratase  37.72 
 
 		 276 aa  166  5e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1887  chorismate mutase-P and prephenate dehydratase  38.38 
 
 		 360 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000192693  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0951  chorismate mutase / prephenate dehydratase  38.81 
 
 		 365 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.356586  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2608  chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.08 
 
 		 358 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  36.27 
 
 		 358 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1594  prephenate dehydratase  31.9 
 
 		 311 aa  161  1e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0926  chorismate mutase / prephenate dehydratase  40.28 
 
 		 367 aa  162  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23140  chorismate mutase, clade 2  39.31 
 
 		 706 aa  160  3e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.839893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0121  prephenate dehydratase  32.74 
 
 		 356 aa  160  3e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3039  chorismate mutase  36.62 
 
 		 355 aa  160  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1418  chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.19 
 
 		 362 aa  159  4e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1096  Prephenate dehydratase  36.88 
 
 		 288 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1067  Prephenate dehydratase  36.88 
 
 		 288 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0862  prephenate dehydratase / chorismate mutase  37.15 
 
 		 368 aa  157  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2192  chorismate mutase  37.72 
 
 		 355 aa  157  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  38.46 
 
 		 386 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4445  prephenate dehydratase  38.21 
 
 		 274 aa  157  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1904  prephenate dehydratase  38.52 
 
 		 372 aa  157  3e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0916421  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1462  prephenate dehydratase  34.86 
 
 		 358 aa  157  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1552  prephenate dehydratase  36.2 
 
 		 279 aa  156  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0248162  normal  0.310445 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1792  chorismate mutase / prephenate dehydratase  38.41 
 
 		 360 aa  155  6e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027177 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1334  prephenate dehydratase  38.57 
 
 		 280 aa  155  9e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000128945  normal  0.202615 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  36.11 
 
 		 365 aa  155  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  40.78 
 
 		 371 aa  155  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0008  Prephenate dehydratase  40.28 
 
 		 279 aa  154  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1424  prephenate dehydratase  33.22 
 
 		 274 aa  154  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000368391  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  35.34 
 
 		 373 aa  154  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  33.81 
 
 		 356 aa  154  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1336  chorismate mutase  37.37 
 
 		 413 aa  152  5e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1747  chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.03 
 
 		 364 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0966339  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3645  chorismate mutasea  34.03 
 
 		 364 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01900  Prephenate dehydratase  30.74 
 
 		 303 aa  150  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  33.68 
 
 		 364 aa  149  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1250  chorismate mutase  33.68 
 
 		 382 aa  150  4e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149804  normal  0.0219371 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1345  chorismate mutase  35.21 
 
 		 359 aa  150  4e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0904  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  36.27 
 
 		 371 aa  149  5e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1207  chorismate mutase  37.32 
 
 		 371 aa  149  5e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0297935 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  33.33 
 
 		 364 aa  149  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0175  Prephenate dehydratase  39.94 
 
 		 328 aa  149  6e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.439201  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0983  Prephenate dehydratase  36.43 
 
 		 272 aa  149  6e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.432859 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0097  Prephenate dehydratase  41.32 
 
 		 306 aa  149  7e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1019  chorismate mutase  38.14 
 
 		 358 aa  149  7e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.789998  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0897  chorismate mutase/prephenate dehydratase  38.14 
 
 		 358 aa  149  7e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.255743  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0845  chorismate mutase  37.63 
 
 		 371 aa  149  8e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0602148 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00716  P-protein  34.75 
 
 		 402 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00262272  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0774  chorismate mutase  36.14 
 
 		 371 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.561025  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2793  chorismate mutase  36.59 
 
 		 360 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163655 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  32.99 
 
 		 367 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  32.99 
 
 		 364 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0801  chorismate mutase  32.62 
 
 		 359 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  32.99 
 
 		 364 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  32.99 
 
 		 364 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302882 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3051  Prephenate dehydratase  32.4 
 
 		 286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0633  Prephenate dehydratase  35.92 
 
 		 285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0741  chorismate mutase  39.64 
 
 		 360 aa  147  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2723  chorismate mutase  35.07 
 
 		 381 aa  146  4.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3022  chorismate mutase  35.19 
 
 		 360 aa  145  6e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.123559  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0046  Prephenate dehydratase  35.59 
 
 		 287 aa  145  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1497  P-protein (prephenate dehydratase / chorismate mutase)  34.86 
 
 		 374 aa  145  1e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554673  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>