More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5034 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_5034  prephenate dehydratase  100 
 
 		 315 aa  619  1e-176  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431184  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5122  prephenate dehydratase  100 
 
 		 315 aa  619  1e-176  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.348107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5415  prephenate dehydratase  99.68 
 
 		 315 aa  617  1e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1145  prephenate dehydratase  71.52 
 
 		 309 aa  425  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0149983  normal  0.0340431 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13872  prephenate dehydratase  70.55 
 
 		 321 aa  421  1e-117  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5662  prephenate dehydratase  71.79 
 
 		 312 aa  410  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.963646  normal  0.0943658 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0145  Prephenate dehydratase  54.49 
 
 		 311 aa  275  9e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6401  Prephenate dehydratase  51.13 
 
 		 305 aa  247  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0175  Prephenate dehydratase  51.86 
 
 		 328 aa  239  5.999999999999999e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.439201  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0121  Prephenate dehydratase  48.72 
 
 		 305 aa  238  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0268  Prephenate dehydratase  47.44 
 
 		 311 aa  227  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2105  prephenate dehydratase  47.11 
 
 		 318 aa  226  3e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.547731 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2485  prephenate dehydratase  45.05 
 
 		 349 aa  226  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01190  prephenate dehydratase  47.13 
 
 		 301 aa  220  3e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.70392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4522  prephenate dehydratase  46.23 
 
 		 318 aa  219  3e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3053  prephenate dehydratase  44.65 
 
 		 315 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0100  Prephenate dehydratase  45.78 
 
 		 300 aa  219  6e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.863601  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1594  prephenate dehydratase  46.98 
 
 		 317 aa  219  7e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0572712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0097  Prephenate dehydratase  48.88 
 
 		 314 aa  217  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0315701 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0141  Prephenate dehydratase  45.62 
 
 		 306 aa  217  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341146  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5270  Prephenate dehydratase  43.93 
 
 		 315 aa  211  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5032  prephenate dehydratase  47.48 
 
 		 318 aa  208  8e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0071  prephenate dehydratase  43.35 
 
 		 324 aa  208  8e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0282  Prephenate dehydratase  46.34 
 
 		 326 aa  208  9e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.209842 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0138  prephenate dehydratase  42.01 
 
 		 327 aa  204  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3187  Prephenate dehydratase  44.83 
 
 		 322 aa  202  7e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.32144  normal  0.019372 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01130  prephenate dehydratase  45 
 
 		 316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0377  Prephenate dehydratase  43.62 
 
 		 335 aa  191  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.461559 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0218  Prephenate dehydratase  46.71 
 
 		 314 aa  186  4e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0245  Prephenate dehydratase  46.3 
 
 		 314 aa  186  4e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00775166  hitchhiker  0.00464716 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  36.75 
 
 		 373 aa  177  3e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1887  chorismate mutase-P and prephenate dehydratase  39.78 
 
 		 360 aa  175  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000192693  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06790  prephenate dehydratase  41.72 
 
 		 325 aa  173  2.9999999999999996e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.299471  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0121  prephenate dehydratase  35.13 
 
 		 356 aa  172  7.999999999999999e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  39.07 
 
 		 371 aa  172  7.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  36.4 
 
 		 365 aa  170  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0078  prephenate dehydratase  37.81 
 
 		 280 aa  171  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0545378  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  35.59 
 
 		 367 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  35.71 
 
 		 364 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0897  chorismate mutase/prephenate dehydratase  40.5 
 
 		 358 aa  169  6e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.255743  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0174  chorismate mutase  37.99 
 
 		 361 aa  169  6e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1019  chorismate mutase  40.5 
 
 		 358 aa  169  6e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.789998  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  35.59 
 
 		 364 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1207  chorismate mutase  38.85 
 
 		 371 aa  169  6e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0297935 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  35.59 
 
 		 364 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302882 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  35.23 
 
 		 364 aa  168  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  35.97 
 
 		 359 aa  168  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2061  Prephenate dehydratase  42.91 
 
 		 277 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2153  Prephenate dehydratase  42.91 
 
 		 277 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1779  prephenate dehydratase  43.26 
 
 		 277 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.490374  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2260  prephenate dehydratase  33.92 
 
 		 278 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  34.52 
 
 		 356 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0937  prephenate dehydratase  38.65 
 
 		 272 aa  166  4e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  35.61 
 
 		 359 aa  166  4e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2608  chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.28 
 
 		 358 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0961  chorismate mutase  36.65 
 
 		 374 aa  165  8e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  34.88 
 
 		 364 aa  165  9e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1153  Prephenate dehydratase  38.03 
 
 		 276 aa  165  9e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1747  chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.98 
 
 		 364 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0966339  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1336  chorismate mutase  35.5 
 
 		 413 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2858  chorismate mutase  35.44 
 
 		 373 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.42066  hitchhiker  0.0000000270068 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3645  chorismate mutasea  34.98 
 
 		 364 aa  164  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23280  chorismate mutase  34.29 
 
 		 365 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2147  prephenate dehydratase  35.69 
 
 		 373 aa  162  5.0000000000000005e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.707843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  35.82 
 
 		 358 aa  162  6e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2793  chorismate mutase  36.4 
 
 		 360 aa  162  6e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163655 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1792  chorismate mutase / prephenate dehydratase  36.52 
 
 		 360 aa  162  7e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027177 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1538  chorismate mutase  37.99 
 
 		 362 aa  162  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1023  chorismate mutase  35.34 
 
 		 365 aa  161  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0862  prephenate dehydratase / chorismate mutase  36.56 
 
 		 368 aa  160  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3487  prephenate dehydratase  35.11 
 
 		 379 aa  160  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1244  Prephenate dehydratase  38.25 
 
 		 283 aa  160  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1963  chorismate mutase  33.93 
 
 		 365 aa  159  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1462  prephenate dehydratase  35.48 
 
 		 358 aa  159  5e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3039  chorismate mutase  35.82 
 
 		 355 aa  158  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0926  chorismate mutase / prephenate dehydratase  37.63 
 
 		 367 aa  158  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0878  Prephenate dehydratase  32.01 
 
 		 277 aa  157  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.583651  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1497  P-protein (prephenate dehydratase / chorismate mutase)  33.93 
 
 		 374 aa  157  2e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554673  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1193  chorismate mutase  29.54 
 
 		 366 aa  157  3e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0881  prephenate dehydratase  39.21 
 
 		 291 aa  156  4e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114823 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1950  prephenate dehydratase  35.23 
 
 		 366 aa  156  4e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1424  prephenate dehydratase  33.1 
 
 		 274 aa  156  4e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000368391  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00716  P-protein  33.1 
 
 		 402 aa  156  5.0000000000000005e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00262272  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1442  chorismate mutase  33.57 
 
 		 374 aa  156  5.0000000000000005e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.105369  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1345  chorismate mutase  36.92 
 
 		 359 aa  155  6e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1250  chorismate mutase  34.64 
 
 		 382 aa  155  8e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149804  normal  0.0219371 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0495  chorismate mutase  37.41 
 
 		 359 aa  154  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0778684  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1394  chorismate mutase  35.82 
 
 		 371 aa  155  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0138573  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1749  prephenate dehydratase  34.88 
 
 		 418 aa  154  1e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2466  chorismate mutase / prephenate dehydratase  35.82 
 
 		 371 aa  155  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.148339 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0774  chorismate mutase  35.36 
 
 		 371 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.561025  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0845  chorismate mutase  35.36 
 
 		 371 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0602148 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1569  chorismate mutase  35.69 
 
 		 360 aa  154  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203479  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1067  Prephenate dehydratase  37.05 
 
 		 288 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1096  Prephenate dehydratase  37.05 
 
 		 288 aa  153  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1418  chorismate mutase/prephenate dehydratase  36.92 
 
 		 362 aa  153  4e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0904  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.36 
 
 		 371 aa  153  4e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  36.43 
 
 		 382 aa  152  5e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0716  prephenate dehydratase / chorismate mutase  35.71 
 
 		 387 aa  152  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1686  chorismate mutase / prephenate dehydratase  34.77 
 
 		 355 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>