More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0245 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0245  Prephenate dehydratase  100 
 
 		 314 aa  613  9.999999999999999e-175  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00775166  hitchhiker  0.00464716 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3053  prephenate dehydratase  54.26 
 
 		 315 aa  311  6.999999999999999e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5270  Prephenate dehydratase  55.7 
 
 		 315 aa  308  6.999999999999999e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0138  prephenate dehydratase  53.53 
 
 		 327 aa  304  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0282  Prephenate dehydratase  54.19 
 
 		 326 aa  296  4e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.209842 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3187  Prephenate dehydratase  54.49 
 
 		 322 aa  290  2e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.32144  normal  0.019372 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01130  prephenate dehydratase  53.67 
 
 		 316 aa  288  8e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0268  Prephenate dehydratase  53.99 
 
 		 311 aa  282  6.000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0071  prephenate dehydratase  50 
 
 		 324 aa  276  3e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0377  Prephenate dehydratase  54.43 
 
 		 335 aa  276  4e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.461559 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2105  prephenate dehydratase  51.6 
 
 		 318 aa  276  4e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.547731 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0121  Prephenate dehydratase  50.64 
 
 		 305 aa  272  5.000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4522  prephenate dehydratase  50 
 
 		 318 aa  270  2e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2485  prephenate dehydratase  48.73 
 
 		 349 aa  264  1e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1594  prephenate dehydratase  50.16 
 
 		 317 aa  264  1e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0572712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0141  Prephenate dehydratase  49.2 
 
 		 306 aa  260  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6401  Prephenate dehydratase  51.29 
 
 		 305 aa  256  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5032  prephenate dehydratase  50.16 
 
 		 318 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0097  Prephenate dehydratase  50 
 
 		 314 aa  252  5.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0315701 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06790  prephenate dehydratase  46.37 
 
 		 325 aa  248  8e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.299471  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13872  prephenate dehydratase  47.35 
 
 		 321 aa  224  1e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0100  Prephenate dehydratase  48.88 
 
 		 300 aa  215  5.9999999999999996e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.863601  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01190  prephenate dehydratase  47.59 
 
 		 301 aa  212  7e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.70392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1145  prephenate dehydratase  44.86 
 
 		 309 aa  211  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0149983  normal  0.0340431 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5662  prephenate dehydratase  45.37 
 
 		 312 aa  206  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.963646  normal  0.0943658 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5415  prephenate dehydratase  45.99 
 
 		 315 aa  203  4e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5034  prephenate dehydratase  45.99 
 
 		 315 aa  202  7e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431184  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5122  prephenate dehydratase  45.99 
 
 		 315 aa  202  7e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.348107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1153  Prephenate dehydratase  41.75 
 
 		 276 aa  192  5e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0145  Prephenate dehydratase  43.9 
 
 		 311 aa  187  3e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0218  Prephenate dehydratase  41.53 
 
 		 314 aa  183  3e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0078  prephenate dehydratase  38.08 
 
 		 280 aa  182  6e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0545378  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0121  prephenate dehydratase  36.75 
 
 		 356 aa  181  1e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4445  prephenate dehydratase  42.11 
 
 		 274 aa  180  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0097  Prephenate dehydratase  42.81 
 
 		 306 aa  179  7e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0937  prephenate dehydratase  40.93 
 
 		 272 aa  176  5e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1779  prephenate dehydratase  41.4 
 
 		 277 aa  176  6e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.490374  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2061  Prephenate dehydratase  40.7 
 
 		 277 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2153  Prephenate dehydratase  40.7 
 
 		 277 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1244  Prephenate dehydratase  38.75 
 
 		 283 aa  172  5.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1552  prephenate dehydratase  40.64 
 
 		 279 aa  172  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0248162  normal  0.310445 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  38.3 
 
 		 364 aa  171  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1904  prephenate dehydratase  40.13 
 
 		 372 aa  170  3e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0916421  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1887  chorismate mutase-P and prephenate dehydratase  39.36 
 
 		 360 aa  169  6e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000192693  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1963  chorismate mutase  38.3 
 
 		 365 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  37.94 
 
 		 359 aa  167  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23280  chorismate mutase  37.94 
 
 		 365 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  37.86 
 
 		 373 aa  166  5e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1964  prephenate dehydratase  39.58 
 
 		 279 aa  166  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221167 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  37.59 
 
 		 359 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2608  chorismate mutase/prephenate dehydratase  40.07 
 
 		 358 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  37.59 
 
 		 367 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2260  prephenate dehydratase  35.92 
 
 		 278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  37.59 
 
 		 364 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302882 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  37.59 
 
 		 364 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  37.94 
 
 		 358 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1462  prephenate dehydratase  38.3 
 
 		 358 aa  164  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3039  chorismate mutase  38.57 
 
 		 355 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  37.59 
 
 		 364 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  38.3 
 
 		 365 aa  161  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  37.59 
 
 		 364 aa  162  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1747  chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.59 
 
 		 364 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0966339  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3645  chorismate mutasea  37.59 
 
 		 364 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2039  prephenate dehydratase  42.05 
 
 		 275 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402041 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2723  chorismate mutase  37.63 
 
 		 381 aa  160  3e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  41.72 
 
 		 371 aa  159  6e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1594  prephenate dehydratase  32.01 
 
 		 311 aa  159  7e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0951  chorismate mutase / prephenate dehydratase  38.79 
 
 		 365 aa  159  8e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.356586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2147  prephenate dehydratase  38.08 
 
 		 373 aa  159  8e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.707843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1538  chorismate mutase  40.07 
 
 		 362 aa  158  9e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  38.26 
 
 		 386 aa  158  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2535  prephenate dehydratase  34.86 
 
 		 282 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0862  prephenate dehydratase / chorismate mutase  37.94 
 
 		 368 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1418  chorismate mutase/prephenate dehydratase  38.65 
 
 		 362 aa  155  6e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01900  Prephenate dehydratase  34.02 
 
 		 303 aa  156  6e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0008  Prephenate dehydratase  37.89 
 
 		 279 aa  155  6e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1345  chorismate mutase  37.59 
 
 		 359 aa  155  8e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1250  chorismate mutase  35.59 
 
 		 382 aa  155  9e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149804  normal  0.0219371 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0926  chorismate mutase / prephenate dehydratase  40.07 
 
 		 367 aa  155  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1023  chorismate mutase  37.86 
 
 		 365 aa  155  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1569  chorismate mutase  38.93 
 
 		 360 aa  154  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203479  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1334  prephenate dehydratase  39.79 
 
 		 280 aa  154  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000128945  normal  0.202615 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2566  chorismate mutase  36.21 
 
 		 357 aa  153  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1792  chorismate mutase / prephenate dehydratase  38.93 
 
 		 360 aa  153  5e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027177 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0316  prephenate dehydratase  39.44 
 
 		 291 aa  152  7e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1019  chorismate mutase  39.22 
 
 		 358 aa  152  8e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.789998  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0897  chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.22 
 
 		 358 aa  152  8e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.255743  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0175  Prephenate dehydratase  37.98 
 
 		 328 aa  152  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.439201  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1497  P-protein (prephenate dehydratase / chorismate mutase)  35.34 
 
 		 374 aa  151  1e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554673  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0983  Prephenate dehydratase  37.28 
 
 		 272 aa  152  1e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.432859 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00716  P-protein  34.88 
 
 		 402 aa  151  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00262272  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3022  chorismate mutase  37.19 
 
 		 360 aa  150  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.123559  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0914  prephenate dehydratase  36.04 
 
 		 282 aa  149  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2091  Chorismate mutase  36.97 
 
 		 280 aa  149  4e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.746584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1442  chorismate mutase  34.98 
 
 		 374 aa  150  4e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.105369  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1293  Prephenate dehydratase  37.59 
 
 		 293 aa  149  5e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.821795  normal  0.378721 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0633  Prephenate dehydratase  38.71 
 
 		 285 aa  149  7e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0961  chorismate mutase  39.07 
 
 		 374 aa  149  7e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2793  chorismate mutase  38.65 
 
 		 360 aa  149  8e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163655 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0806  prephenate dehydratase  32.62 
 
 		 284 aa  148  9e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>