More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1594 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1594  prephenate dehydratase  100 
 
 		 317 aa  637    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0572712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2485  prephenate dehydratase  81.01 
 
 		 349 aa  503  1e-141  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0121  Prephenate dehydratase  57.28 
 
 		 305 aa  317  2e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2105  prephenate dehydratase  55.37 
 
 		 318 aa  296  3e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.547731 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3053  prephenate dehydratase  51.29 
 
 		 315 aa  288  1e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5270  Prephenate dehydratase  50.16 
 
 		 315 aa  279  4e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0097  Prephenate dehydratase  53.69 
 
 		 314 aa  275  7e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0315701 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0138  prephenate dehydratase  49.36 
 
 		 327 aa  272  7e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0141  Prephenate dehydratase  50.49 
 
 		 306 aa  271  8.000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341146  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0071  prephenate dehydratase  50.49 
 
 		 324 aa  269  5e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0282  Prephenate dehydratase  49.84 
 
 		 326 aa  266  5e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.209842 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4522  prephenate dehydratase  48.73 
 
 		 318 aa  263  3e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0268  Prephenate dehydratase  51.96 
 
 		 311 aa  257  2e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3187  Prephenate dehydratase  49.38 
 
 		 322 aa  251  1e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.32144  normal  0.019372 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0377  Prephenate dehydratase  46.69 
 
 		 335 aa  243  3.9999999999999997e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.461559 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01130  prephenate dehydratase  50.36 
 
 		 316 aa  242  5e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6401  Prephenate dehydratase  48.31 
 
 		 305 aa  241  9e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5662  prephenate dehydratase  50.52 
 
 		 312 aa  241  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.963646  normal  0.0943658 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5032  prephenate dehydratase  48.46 
 
 		 318 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13872  prephenate dehydratase  46.45 
 
 		 321 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0245  Prephenate dehydratase  49.52 
 
 		 314 aa  233  4.0000000000000004e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00775166  hitchhiker  0.00464716 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1145  prephenate dehydratase  46.79 
 
 		 309 aa  223  4e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0149983  normal  0.0340431 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0100  Prephenate dehydratase  47.39 
 
 		 300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.863601  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5415  prephenate dehydratase  46.98 
 
 		 315 aa  210  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5034  prephenate dehydratase  46.98 
 
 		 315 aa  209  4e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431184  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5122  prephenate dehydratase  46.98 
 
 		 315 aa  209  4e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.348107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01190  prephenate dehydratase  45.39 
 
 		 301 aa  206  3e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.70392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06790  prephenate dehydratase  42.01 
 
 		 325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.299471  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0218  Prephenate dehydratase  48.36 
 
 		 314 aa  189  5e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2153  Prephenate dehydratase  42.96 
 
 		 277 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2061  Prephenate dehydratase  42.96 
 
 		 277 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0937  prephenate dehydratase  41.73 
 
 		 272 aa  186  4e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1779  prephenate dehydratase  42.96 
 
 		 277 aa  186  5e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.490374  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0145  Prephenate dehydratase  42.12 
 
 		 311 aa  178  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0078  prephenate dehydratase  37 
 
 		 280 aa  173  3.9999999999999995e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0545378  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2039  prephenate dehydratase  42.24 
 
 		 275 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402041 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2608  chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.78 
 
 		 358 aa  161  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  36.26 
 
 		 359 aa  161  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  38.41 
 
 		 373 aa  161  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  35.9 
 
 		 359 aa  160  4e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2260  prephenate dehydratase  34.18 
 
 		 278 aa  160  4e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23691  chorismate mutase-prephenate dehydratase  39.57 
 
 		 304 aa  159  6e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0614249 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1250  chorismate mutase  36.13 
 
 		 382 aa  158  1e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149804  normal  0.0219371 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  40.79 
 
 		 371 aa  158  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1594  prephenate dehydratase  31.5 
 
 		 311 aa  158  1e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0176  chorismate mutase / prephenate dehydratase  41.39 
 
 		 368 aa  158  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000165847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1153  Prephenate dehydratase  39.13 
 
 		 276 aa  157  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  37.23 
 
 		 358 aa  157  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1538  chorismate mutase  40 
 
 		 362 aa  156  4e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1207  chorismate mutase  38.97 
 
 		 371 aa  155  1e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0297935 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  37.72 
 
 		 365 aa  155  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01900  Prephenate dehydratase  34.27 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2535  prephenate dehydratase  36.07 
 
 		 282 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1067  Prephenate dehydratase  38.55 
 
 		 288 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0008  Prephenate dehydratase  38.49 
 
 		 279 aa  152  5e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1635  chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.34 
 
 		 360 aa  152  5e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1345  chorismate mutase  37.23 
 
 		 359 aa  152  5e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0432  chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.71 
 
 		 360 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0950  chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.71 
 
 		 360 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2997  chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.71 
 
 		 360 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.379619  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0198  chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.71 
 
 		 360 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2885  chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.71 
 
 		 360 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.629426  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2575  chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.71 
 
 		 360 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1462  prephenate dehydratase  36.13 
 
 		 358 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2948  chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.71 
 
 		 360 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00716  P-protein  36.96 
 
 		 402 aa  152  7e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00262272  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1096  Prephenate dehydratase  38.18 
 
 		 288 aa  152  8e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1418  chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.56 
 
 		 362 aa  151  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0951  chorismate mutase / prephenate dehydratase  38.55 
 
 		 365 aa  151  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.356586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  37.77 
 
 		 364 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  37.77 
 
 		 367 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  37.86 
 
 		 364 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302882 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0121  prephenate dehydratase  33.94 
 
 		 356 aa  150  2e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1887  chorismate mutase-P and prephenate dehydratase  38.1 
 
 		 360 aa  150  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000192693  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  37.05 
 
 		 364 aa  150  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  37.77 
 
 		 364 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1497  P-protein (prephenate dehydratase / chorismate mutase)  37.09 
 
 		 374 aa  150  2e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554673  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0862  prephenate dehydratase / chorismate mutase  38.32 
 
 		 368 aa  150  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3645  chorismate mutasea  37.37 
 
 		 364 aa  149  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1204  chorismate mutase  36.5 
 
 		 393 aa  149  5e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.973222  normal  0.768195 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1442  chorismate mutase  36.73 
 
 		 374 aa  149  5e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.105369  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1747  chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.37 
 
 		 364 aa  149  6e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0966339  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  37.77 
 
 		 364 aa  149  6e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1334  prephenate dehydratase  37.91 
 
 		 280 aa  149  6e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000128945  normal  0.202615 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1950  prephenate dehydratase  37.96 
 
 		 366 aa  149  8e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1904  prephenate dehydratase  39.71 
 
 		 372 aa  148  9e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0916421  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3051  Prephenate dehydratase  34.04 
 
 		 286 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1186  prephenate dehydratase  35.77 
 
 		 393 aa  148  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.343107 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0741  chorismate mutase  40.43 
 
 		 360 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2147  prephenate dehydratase  37.55 
 
 		 373 aa  148  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.707843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  38.16 
 
 		 386 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23280  chorismate mutase  36.33 
 
 		 365 aa  146  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0316  prephenate dehydratase  39.21 
 
 		 291 aa  145  6e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0174  chorismate mutase  39.05 
 
 		 361 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0480  prephenate dehydratase  35.07 
 
 		 296 aa  145  7.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0463972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1963  chorismate mutase  35.97 
 
 		 365 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0845  chorismate mutase  36.73 
 
 		 371 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0602148 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1792  chorismate mutase / prephenate dehydratase  36.59 
 
 		 360 aa  144  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027177 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2723  chorismate mutase  34.24 
 
 		 381 aa  144  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  34.93 
 
 		 356 aa  144  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>