More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0268 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0268  Prephenate dehydratase  100 
 
 		 311 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4522  prephenate dehydratase  56.47 
 
 		 318 aa  297  2e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3053  prephenate dehydratase  53.67 
 
 		 315 aa  295  7e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5270  Prephenate dehydratase  54.6 
 
 		 315 aa  295  7e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6401  Prephenate dehydratase  55.41 
 
 		 305 aa  290  2e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0071  prephenate dehydratase  53.55 
 
 		 324 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5032  prephenate dehydratase  57.14 
 
 		 318 aa  279  4e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0121  Prephenate dehydratase  53.44 
 
 		 305 aa  278  9e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0141  Prephenate dehydratase  52.77 
 
 		 306 aa  275  5e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0097  Prephenate dehydratase  54.61 
 
 		 314 aa  275  5e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0315701 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0282  Prephenate dehydratase  50.65 
 
 		 326 aa  274  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.209842 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2485  prephenate dehydratase  54.17 
 
 		 349 aa  273  3e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2105  prephenate dehydratase  55.52 
 
 		 318 aa  270  2e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.547731 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0138  prephenate dehydratase  49.04 
 
 		 327 aa  267  1e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01130  prephenate dehydratase  51.99 
 
 		 316 aa  265  1e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1594  prephenate dehydratase  51.96 
 
 		 317 aa  257  2e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0572712  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3187  Prephenate dehydratase  52.65 
 
 		 322 aa  256  4e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.32144  normal  0.019372 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0245  Prephenate dehydratase  53.67 
 
 		 314 aa  255  7e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00775166  hitchhiker  0.00464716 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0100  Prephenate dehydratase  54.4 
 
 		 300 aa  253  3e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.863601  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13872  prephenate dehydratase  50.48 
 
 		 321 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0377  Prephenate dehydratase  50.48 
 
 		 335 aa  250  2e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.461559 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1145  prephenate dehydratase  48.12 
 
 		 309 aa  241  1e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0149983  normal  0.0340431 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01190  prephenate dehydratase  52.75 
 
 		 301 aa  236  4e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.70392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5662  prephenate dehydratase  49.54 
 
 		 312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.963646  normal  0.0943658 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5415  prephenate dehydratase  47.44 
 
 		 315 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0218  Prephenate dehydratase  53.62 
 
 		 314 aa  218  1e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5034  prephenate dehydratase  47.44 
 
 		 315 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431184  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5122  prephenate dehydratase  47.44 
 
 		 315 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.348107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06790  prephenate dehydratase  42.54 
 
 		 325 aa  213  3.9999999999999995e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.299471  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0145  Prephenate dehydratase  45.11 
 
 		 311 aa  202  7e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1779  prephenate dehydratase  47.45 
 
 		 277 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.490374  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2061  Prephenate dehydratase  46.35 
 
 		 277 aa  193  3e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2153  Prephenate dehydratase  46.35 
 
 		 277 aa  193  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1904  prephenate dehydratase  45.1 
 
 		 372 aa  179  5.999999999999999e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0916421  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1153  Prephenate dehydratase  43.37 
 
 		 276 aa  177  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1334  prephenate dehydratase  44.36 
 
 		 280 aa  174  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000128945  normal  0.202615 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0937  prephenate dehydratase  41.97 
 
 		 272 aa  172  5e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0078  prephenate dehydratase  37.09 
 
 		 280 aa  172  6.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0545378  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0121  prephenate dehydratase  36.53 
 
 		 356 aa  171  1e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  43.96 
 
 		 371 aa  167  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01900  Prephenate dehydratase  34.6 
 
 		 303 aa  166  5e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0008  Prephenate dehydratase  41.73 
 
 		 279 aa  166  5.9999999999999996e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  42.39 
 
 		 386 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1418  chorismate mutase/prephenate dehydratase  40.88 
 
 		 362 aa  163  3e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1887  chorismate mutase-P and prephenate dehydratase  39.42 
 
 		 360 aa  164  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000192693  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1244  Prephenate dehydratase  38.18 
 
 		 283 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2039  prephenate dehydratase  43.8 
 
 		 275 aa  162  6e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402041 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1594  prephenate dehydratase  31.65 
 
 		 311 aa  159  4e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0174  chorismate mutase  39.21 
 
 		 361 aa  159  8e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2260  prephenate dehydratase  34.78 
 
 		 278 aa  158  9e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.74 
 
 		 358 aa  157  2e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  36.26 
 
 		 373 aa  157  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  36.53 
 
 		 356 aa  157  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  35.42 
 
 		 358 aa  157  3e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1964  prephenate dehydratase  38.85 
 
 		 279 aa  157  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221167 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  36.5 
 
 		 364 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302882 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  36.5 
 
 		 367 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1336  chorismate mutase  38.81 
 
 		 413 aa  156  5.0000000000000005e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  36.5 
 
 		 364 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  36.5 
 
 		 364 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0097  Prephenate dehydratase  41.81 
 
 		 306 aa  155  8e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  36.13 
 
 		 359 aa  155  8e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0961  chorismate mutase  38.69 
 
 		 374 aa  154  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4445  prephenate dehydratase  37.68 
 
 		 274 aa  155  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  35.77 
 
 		 359 aa  154  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1096  Prephenate dehydratase  37.23 
 
 		 288 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  37.68 
 
 		 358 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1250  chorismate mutase  34.42 
 
 		 382 aa  153  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149804  normal  0.0219371 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1067  Prephenate dehydratase  37.23 
 
 		 288 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2723  chorismate mutase  35.07 
 
 		 381 aa  154  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3051  Prephenate dehydratase  36.69 
 
 		 286 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  35.4 
 
 		 364 aa  153  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  36.86 
 
 		 365 aa  153  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0046  Prephenate dehydratase  36.26 
 
 		 287 aa  153  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  36.13 
 
 		 364 aa  152  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2608  chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.96 
 
 		 358 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  34.94 
 
 		 358 aa  152  7e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1552  prephenate dehydratase  36.33 
 
 		 279 aa  152  7e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0248162  normal  0.310445 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0175  Prephenate dehydratase  43.64 
 
 		 328 aa  152  8e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.439201  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1462  prephenate dehydratase  35.04 
 
 		 358 aa  150  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00716  P-protein  34.55 
 
 		 402 aa  150  3e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00262272  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1747  chorismate mutase/prephenate dehydratase  36.13 
 
 		 364 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0966339  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3645  chorismate mutasea  36.13 
 
 		 364 aa  150  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1538  chorismate mutase  39.05 
 
 		 362 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1345  chorismate mutase  36.5 
 
 		 359 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1930  prephenate dehydratase  34.24 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.898282 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0951  chorismate mutase / prephenate dehydratase  38.46 
 
 		 365 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.356586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0862  prephenate dehydratase / chorismate mutase  36.5 
 
 		 368 aa  147  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1749  prephenate dehydratase  37 
 
 		 418 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2466  chorismate mutase / prephenate dehydratase  36.86 
 
 		 371 aa  146  5e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.148339 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1394  chorismate mutase  36.86 
 
 		 371 aa  146  5e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0138573  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2192  chorismate mutase  38.63 
 
 		 355 aa  146  5e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1792  chorismate mutase / prephenate dehydratase  36.1 
 
 		 360 aa  146  5e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027177 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2793  chorismate mutase  36.46 
 
 		 360 aa  145  9e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163655 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23280  chorismate mutase  34.67 
 
 		 365 aa  145  9e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1424  prephenate dehydratase  32.6 
 
 		 274 aa  145  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000368391  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1666  P-protein  33.09 
 
 		 359 aa  145  1e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1442  chorismate mutase  33.45 
 
 		 374 aa  144  2e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.105369  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2026  prephenate dehydratase  38.21 
 
 		 282 aa  144  2e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.713159  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0176  chorismate mutase / prephenate dehydratase  38.89 
 
 		 368 aa  143  4e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000165847  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>