More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0145 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0145  Prephenate dehydratase  100 
 
 		 311 aa  610  1e-173  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13872  prephenate dehydratase  54.49 
 
 		 321 aa  296  4e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1145  prephenate dehydratase  53.53 
 
 		 309 aa  286  4e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0149983  normal  0.0340431 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5415  prephenate dehydratase  54.49 
 
 		 315 aa  285  5.999999999999999e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5034  prephenate dehydratase  54.49 
 
 		 315 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431184  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5122  prephenate dehydratase  54.49 
 
 		 315 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.348107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5662  prephenate dehydratase  55.87 
 
 		 312 aa  282  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.963646  normal  0.0943658 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0175  Prephenate dehydratase  52.98 
 
 		 328 aa  238  6.999999999999999e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.439201  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0268  Prephenate dehydratase  45.11 
 
 		 311 aa  217  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2105  prephenate dehydratase  43.71 
 
 		 318 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.547731 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0071  prephenate dehydratase  41.43 
 
 		 324 aa  199  3e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01130  prephenate dehydratase  45.42 
 
 		 316 aa  198  1.0000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0100  Prephenate dehydratase  47.7 
 
 		 300 aa  197  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.863601  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5270  Prephenate dehydratase  41.28 
 
 		 315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4522  prephenate dehydratase  44.31 
 
 		 318 aa  196  6e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0141  Prephenate dehydratase  42.37 
 
 		 306 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0097  Prephenate dehydratase  44.94 
 
 		 314 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0315701 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2485  prephenate dehydratase  44.25 
 
 		 349 aa  192  6e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1594  prephenate dehydratase  42.12 
 
 		 317 aa  192  6e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0572712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6401  Prephenate dehydratase  43.27 
 
 		 305 aa  191  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0121  Prephenate dehydratase  44.03 
 
 		 305 aa  191  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0282  Prephenate dehydratase  43.4 
 
 		 326 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.209842 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0138  prephenate dehydratase  41.67 
 
 		 327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01190  prephenate dehydratase  44.62 
 
 		 301 aa  182  6e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.70392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3053  prephenate dehydratase  38.27 
 
 		 315 aa  181  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5032  prephenate dehydratase  44.62 
 
 		 318 aa  181  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0245  Prephenate dehydratase  43.9 
 
 		 314 aa  177  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00775166  hitchhiker  0.00464716 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06790  prephenate dehydratase  40.12 
 
 		 325 aa  173  2.9999999999999996e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.299471  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3187  Prephenate dehydratase  42.28 
 
 		 322 aa  172  5e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.32144  normal  0.019372 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0218  Prephenate dehydratase  43.48 
 
 		 314 aa  172  6.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1207  chorismate mutase  37.46 
 
 		 371 aa  160  3e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0297935 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1019  chorismate mutase  37.1 
 
 		 358 aa  159  8e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.789998  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0897  chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.1 
 
 		 358 aa  159  8e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.255743  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0377  Prephenate dehydratase  37.72 
 
 		 335 aa  155  6e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.461559 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1569  chorismate mutase  35.44 
 
 		 360 aa  151  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203479  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2608  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.92 
 
 		 358 aa  148  9e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1904  prephenate dehydratase  38.61 
 
 		 372 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0916421  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  33.22 
 
 		 359 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1336  chorismate mutase  34.62 
 
 		 413 aa  146  4.0000000000000006e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1887  chorismate mutase-P and prephenate dehydratase  34.15 
 
 		 360 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000192693  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1538  chorismate mutase  36.62 
 
 		 362 aa  145  8.000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  37.5 
 
 		 371 aa  145  8.000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0961  chorismate mutase  34.62 
 
 		 374 aa  144  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  32.98 
 
 		 367 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0078  prephenate dehydratase  34.36 
 
 		 280 aa  145  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0545378  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  32.98 
 
 		 364 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1462  prephenate dehydratase  33.1 
 
 		 358 aa  144  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  31.58 
 
 		 364 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  32.98 
 
 		 364 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3645  chorismate mutasea  33.33 
 
 		 364 aa  143  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1779  prephenate dehydratase  36.43 
 
 		 277 aa  143  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.490374  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  32.63 
 
 		 364 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302882 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0862  prephenate dehydratase / chorismate mutase  34.86 
 
 		 368 aa  143  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  32.63 
 
 		 365 aa  143  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1792  chorismate mutase / prephenate dehydratase  33.68 
 
 		 360 aa  142  7e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027177 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1747  chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.93 
 
 		 364 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0966339  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2153  Prephenate dehydratase  36.21 
 
 		 277 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2061  Prephenate dehydratase  36.21 
 
 		 277 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  33.45 
 
 		 358 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  32.51 
 
 		 359 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  32.28 
 
 		 364 aa  140  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1334  prephenate dehydratase  36.49 
 
 		 280 aa  140  3.9999999999999997e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000128945  normal  0.202615 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1497  P-protein (prephenate dehydratase / chorismate mutase)  32.39 
 
 		 374 aa  139  4.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554673  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23280  chorismate mutase  30.88 
 
 		 365 aa  139  7e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1394  chorismate mutase  33.1 
 
 		 371 aa  138  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0138573  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2466  chorismate mutase / prephenate dehydratase  33.1 
 
 		 371 aa  138  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.148339 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1442  chorismate mutase  32.04 
 
 		 374 aa  138  1e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.105369  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2793  chorismate mutase  33.68 
 
 		 360 aa  138  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163655 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0009  chorismate mutase  30.14 
 
 		 385 aa  137  2e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0716  prephenate dehydratase / chorismate mutase  34.04 
 
 		 387 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1963  chorismate mutase  30.53 
 
 		 365 aa  136  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0174  chorismate mutase  33.92 
 
 		 361 aa  136  6.0000000000000005e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  32.39 
 
 		 373 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2260  prephenate dehydratase  31.6 
 
 		 278 aa  135  7.000000000000001e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  33.69 
 
 		 382 aa  135  8e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3022  chorismate mutase  33.11 
 
 		 360 aa  135  9e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.123559  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2147  prephenate dehydratase  31.23 
 
 		 373 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.707843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6846  chorismate mutase  34.81 
 
 		 397 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235672 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2241  prephenate dehydratase / chorismate mutase  35.54 
 
 		 370 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1345  chorismate mutase  33.45 
 
 		 359 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3039  chorismate mutase  31.83 
 
 		 355 aa  133  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0008  Prephenate dehydratase  35.99 
 
 		 279 aa  133  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1749  prephenate dehydratase  34.15 
 
 		 418 aa  133  3e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0121  prephenate dehydratase  29.02 
 
 		 356 aa  133  3.9999999999999996e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1424  prephenate dehydratase  28.77 
 
 		 274 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000368391  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4721  chorismate mutase  32.63 
 
 		 366 aa  133  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997566 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1250  chorismate mutase  31.93 
 
 		 382 aa  132  5e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149804  normal  0.0219371 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1552  prephenate dehydratase  35.54 
 
 		 279 aa  132  5e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0248162  normal  0.310445 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1418  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.45 
 
 		 362 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  37.28 
 
 		 386 aa  132  9e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0937  prephenate dehydratase  32.87 
 
 		 272 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0904  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.22 
 
 		 371 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0845  chorismate mutase  33.22 
 
 		 371 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0602148 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0774  chorismate mutase  33.22 
 
 		 371 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.561025  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00716  P-protein  32.04 
 
 		 402 aa  129  5.0000000000000004e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00262272  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2723  chorismate mutase  30.53 
 
 		 381 aa  129  8.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2026  prephenate dehydratase  36.9 
 
 		 282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.713159  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1950  prephenate dehydratase  31.45 
 
 		 366 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  30.14 
 
 		 356 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01900  Prephenate dehydratase  28.66 
 
 		 303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>