More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_01900 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_01900  Prephenate dehydratase  100 
 
 
303 aa  619  1e-176  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1594  prephenate dehydratase  47.65 
 
 
311 aa  262  4.999999999999999e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1424  prephenate dehydratase  45.42 
 
 
274 aa  235  8e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000368391  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1153  Prephenate dehydratase  42.25 
 
 
276 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0937  prephenate dehydratase  44.52 
 
 
272 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  44.21 
 
 
386 aa  216  4e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1904  prephenate dehydratase  41.61 
 
 
372 aa  216  5e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0916421  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0806  prephenate dehydratase  43.62 
 
 
284 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2260  prephenate dehydratase  40.78 
 
 
278 aa  211  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1552  prephenate dehydratase  40.43 
 
 
279 aa  207  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0248162  normal  0.310445 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1930  prephenate dehydratase  42.21 
 
 
311 aa  206  3e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.898282 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2061  Prephenate dehydratase  38.87 
 
 
277 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1244  Prephenate dehydratase  39.78 
 
 
283 aa  206  3e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2153  Prephenate dehydratase  38.87 
 
 
277 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1779  prephenate dehydratase  39.22 
 
 
277 aa  206  4e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.490374  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1964  prephenate dehydratase  39.78 
 
 
279 aa  204  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.221167 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1887  chorismate mutase-P and prephenate dehydratase  39.86 
 
 
360 aa  202  6e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000192693  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0097  Prephenate dehydratase  40 
 
 
306 aa  202  7e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1569  chorismate mutase  40.14 
 
 
360 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203479  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0121  prephenate dehydratase  40.57 
 
 
356 aa  195  7e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0078  prephenate dehydratase  39.37 
 
 
280 aa  195  8.000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0545378  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00716  P-protein  37.94 
 
 
402 aa  194  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00262272  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  38.16 
 
 
373 aa  194  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2608  chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.59 
 
 
358 aa  193  3e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0862  prephenate dehydratase / chorismate mutase  37.94 
 
 
368 aa  192  7e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1334  prephenate dehydratase  39.36 
 
 
280 aa  192  8e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000128945  normal  0.202615 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  39.37 
 
 
371 aa  191  9e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1617  chorismate mutase  37.94 
 
 
373 aa  190  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  37.01 
 
 
359 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4445  prephenate dehydratase  35.82 
 
 
274 aa  190  2.9999999999999997e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0961  chorismate mutase  37.89 
 
 
374 aa  190  2.9999999999999997e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  38.6 
 
 
364 aa  189  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3039  chorismate mutase  35.59 
 
 
355 aa  189  4e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0845  chorismate mutase  36.2 
 
 
371 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0602148 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4721  chorismate mutase  38.08 
 
 
366 aa  189  5.999999999999999e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.997566 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1394  chorismate mutase  37.72 
 
 
371 aa  189  7e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0138573  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2466  chorismate mutase / prephenate dehydratase  37.72 
 
 
371 aa  189  7e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.148339 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0774  chorismate mutase  36.2 
 
 
371 aa  188  9e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.561025  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1747  chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.81 
 
 
364 aa  188  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0966339  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  37.46 
 
 
364 aa  187  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3121  chorismate mutase  37.01 
 
 
365 aa  188  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0293375 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  37.89 
 
 
367 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3645  chorismate mutasea  37.81 
 
 
364 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734175  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1792  chorismate mutase / prephenate dehydratase  37.72 
 
 
360 aa  187  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00027177 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  37.54 
 
 
364 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0302882 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  37.89 
 
 
364 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  37.89 
 
 
364 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1345  chorismate mutase  38.43 
 
 
359 aa  187  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0904  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  36.2 
 
 
371 aa  186  5e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  38.16 
 
 
365 aa  186  5e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  37.68 
 
 
358 aa  186  5e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1462  prephenate dehydratase  37.94 
 
 
358 aa  186  5e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  36.65 
 
 
359 aa  186  5e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23280  chorismate mutase  37.81 
 
 
365 aa  185  9e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  36.65 
 
 
382 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1207  chorismate mutase  37.37 
 
 
371 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0297935 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0897  chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.15 
 
 
358 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.255743  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2192  chorismate mutase  37.32 
 
 
355 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1019  chorismate mutase  39.15 
 
 
358 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.789998  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3282  chorismate mutase  36.65 
 
 
366 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0668525  normal  0.62913 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1963  chorismate mutase  37.46 
 
 
365 aa  183  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2535  prephenate dehydratase  37.06 
 
 
282 aa  183  3e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1497  P-protein (prephenate dehydratase / chorismate mutase)  39.3 
 
 
374 aa  183  3e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554673  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0977  prephenate dehydratase / chorismate mutase  38.71 
 
 
360 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.23904  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0881  prephenate dehydratase  36.62 
 
 
291 aa  182  7e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00114823 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1418  chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.01 
 
 
362 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2793  chorismate mutase  37.94 
 
 
360 aa  182  8.000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163655 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3006  chorismate mutase  38.71 
 
 
360 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224868  normal  0.0525817 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23140  chorismate mutase, clade 2  35.05 
 
 
706 aa  181  1e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.839893  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1442  chorismate mutase  38.95 
 
 
374 aa  181  1e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.105369  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2039  prephenate dehydratase  38.93 
 
 
275 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402041 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2539  chorismate mutase  36.52 
 
 
399 aa  181  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.409768  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0716  prephenate dehydratase / chorismate mutase  36.4 
 
 
387 aa  180  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0495  chorismate mutase  37.77 
 
 
359 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0778684  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0138  prephenate dehydratase  34.93 
 
 
327 aa  179  4.999999999999999e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3053  prephenate dehydratase  37.28 
 
 
315 aa  177  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0741  chorismate mutase  38.63 
 
 
360 aa  178  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1284  prephenate dehydratase  35.21 
 
 
295 aa  177  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000630901  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  37.5 
 
 
356 aa  177  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1313  chorismate mutase  37.55 
 
 
359 aa  177  3e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  2.21838e-16 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0282  Prephenate dehydratase  35.31 
 
 
326 aa  176  4e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.209842 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2885  chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.55 
 
 
360 aa  176  6e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.629426  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0432  chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.55 
 
 
360 aa  176  6e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2997  chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.55 
 
 
360 aa  176  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.379619  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2948  chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.55 
 
 
360 aa  176  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0950  chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.55 
 
 
360 aa  176  6e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0198  chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.55 
 
 
360 aa  176  6e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2575  chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.55 
 
 
360 aa  176  6e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5270  Prephenate dehydratase  35.39 
 
 
315 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271199  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1635  chorismate mutase/prephenate dehydratase  36.82 
 
 
360 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2147  prephenate dehydratase  37.89 
 
 
373 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.707843  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0176  chorismate mutase / prephenate dehydratase  41.01 
 
 
368 aa  174  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000165847  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1193  chorismate mutase  34.52 
 
 
366 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0071  prephenate dehydratase  36.33 
 
 
324 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0878  Prephenate dehydratase  37.37 
 
 
277 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.583651  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1905  prephenate dehydratase  37.23 
 
 
279 aa  173  3.9999999999999995e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2241  prephenate dehydratase / chorismate mutase  37.19 
 
 
370 aa  172  5e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0008  Prephenate dehydratase  38.25 
 
 
279 aa  172  5e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0097  Prephenate dehydratase  35.1 
 
 
314 aa  172  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0315701 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0174  chorismate mutase  35.59 
 
 
361 aa  172  6.999999999999999e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>