More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_2026 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_2026  prephenate dehydratase  100 
 
 		 282 aa  571  1.0000000000000001e-162  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.713159  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0316  prephenate dehydratase  80.22 
 
 		 291 aa  432  1e-120  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23691  chorismate mutase-prephenate dehydratase  68.59 
 
 		 304 aa  384  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0614249 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16271  chorismate mutase-prephenate dehydratase  60.79 
 
 		 281 aa  364  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.763625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1070  chorismate mutase-prephenate dehydratase  59.21 
 
 		 276 aa  348  6e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.330771  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16841  chorismate mutase-prephenate dehydratase  56.47 
 
 		 281 aa  328  6e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19451  chorismate mutase-prephenate dehydratase  58.84 
 
 		 276 aa  322  5e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16951  chorismate mutase-prephenate dehydratase  55.04 
 
 		 281 aa  320  1.9999999999999998e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17071  chorismate mutase-prephenate dehydratase  54.95 
 
 		 281 aa  319  3e-86  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.530579  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1596  chorismate mutase-prephenate dehydratase  55.76 
 
 		 281 aa  309  2.9999999999999997e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0881  prephenate dehydratase  46.91 
 
 		 291 aa  212  5.999999999999999e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114823 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0665  prephenate dehydratase  42.45 
 
 		 293 aa  205  5e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.27815  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1096  Prephenate dehydratase  44.57 
 
 		 288 aa  203  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0480  prephenate dehydratase  40.55 
 
 		 296 aa  203  2e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0463972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1067  Prephenate dehydratase  44.57 
 
 		 288 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1284  prephenate dehydratase  40.99 
 
 		 295 aa  200  3e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000630901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0046  Prephenate dehydratase  39.86 
 
 		 287 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0937  prephenate dehydratase  38.6 
 
 		 272 aa  169  4e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5270  Prephenate dehydratase  38.52 
 
 		 315 aa  168  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4418  prephenate dehydratase  43.25 
 
 		 284 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.299443 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2061  Prephenate dehydratase  41.58 
 
 		 277 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2153  Prephenate dehydratase  41.58 
 
 		 277 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1153  Prephenate dehydratase  41.01 
 
 		 276 aa  166  5e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0806  prephenate dehydratase  33.45 
 
 		 284 aa  165  9e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1779  prephenate dehydratase  40.93 
 
 		 277 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.490374  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1334  prephenate dehydratase  39.71 
 
 		 280 aa  163  3e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000128945  normal  0.202615 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0878  Prephenate dehydratase  38.02 
 
 		 277 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.583651  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3053  prephenate dehydratase  38.95 
 
 		 315 aa  162  6e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1594  prephenate dehydratase  33.21 
 
 		 311 aa  162  8.000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1424  prephenate dehydratase  33.45 
 
 		 274 aa  161  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000368391  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0961  chorismate mutase  39.93 
 
 		 374 aa  160  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2039  prephenate dehydratase  44.26 
 
 		 275 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402041 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6401  Prephenate dehydratase  37.91 
 
 		 305 aa  159  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  39 
 
 		 386 aa  158  8e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0282  Prephenate dehydratase  38.73 
 
 		 326 aa  158  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.209842 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0138  prephenate dehydratase  35.92 
 
 		 327 aa  157  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1950  prephenate dehydratase  37.5 
 
 		 366 aa  155  8e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1336  chorismate mutase  36.52 
 
 		 413 aa  155  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1749  prephenate dehydratase  37.81 
 
 		 418 aa  154  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  38.04 
 
 		 358 aa  154  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0268  Prephenate dehydratase  38.21 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  35.97 
 
 		 373 aa  153  4e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1792  chorismate mutase / prephenate dehydratase  37.23 
 
 		 360 aa  152  5.9999999999999996e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027177 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3282  chorismate mutase  39.15 
 
 		 366 aa  151  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0668525  normal  0.62913 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  38.66 
 
 		 356 aa  150  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0951  chorismate mutase / prephenate dehydratase  36.23 
 
 		 365 aa  150  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.356586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2485  prephenate dehydratase  37.23 
 
 		 349 aa  150  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0078  prephenate dehydratase  36.84 
 
 		 280 aa  150  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0545378  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  35.84 
 
 		 364 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01900  Prephenate dehydratase  33.46 
 
 		 303 aa  150  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0097  Prephenate dehydratase  37.23 
 
 		 314 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0315701 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  35.84 
 
 		 367 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  35.84 
 
 		 364 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  34.77 
 
 		 364 aa  149  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  35.84 
 
 		 364 aa  149  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1887  chorismate mutase-P and prephenate dehydratase  37 
 
 		 360 aa  149  4e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000192693  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  35.4 
 
 		 359 aa  149  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3487  prephenate dehydratase  37.1 
 
 		 379 aa  149  5e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0121  Prephenate dehydratase  38.77 
 
 		 305 aa  149  6e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  38.46 
 
 		 371 aa  149  7e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  35.84 
 
 		 364 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302882 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1497  P-protein (prephenate dehydratase / chorismate mutase)  34.31 
 
 		 374 aa  148  8e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554673  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  35.04 
 
 		 359 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2241  prephenate dehydratase / chorismate mutase  38.71 
 
 		 370 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3022  chorismate mutase  37.37 
 
 		 360 aa  147  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.123559  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5032  prephenate dehydratase  37.05 
 
 		 318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2809  prephenate dehydratase  40 
 
 		 372 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.433236  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1442  chorismate mutase  33.94 
 
 		 374 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.105369  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1594  prephenate dehydratase  37.05 
 
 		 317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0572712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0716  prephenate dehydratase / chorismate mutase  35.87 
 
 		 387 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4445  prephenate dehydratase  36.69 
 
 		 274 aa  146  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0071  prephenate dehydratase  39.01 
 
 		 324 aa  146  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3645  chorismate mutasea  35.13 
 
 		 364 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4522  prephenate dehydratase  36.69 
 
 		 318 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0264  prephenate dehydratase  42.8 
 
 		 268 aa  146  4.0000000000000006e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0450669  normal  0.96935 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23280  chorismate mutase  34.05 
 
 		 365 aa  145  5e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2260  prephenate dehydratase  34.16 
 
 		 278 aa  145  6e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2793  chorismate mutase  36.79 
 
 		 360 aa  145  6e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163655 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2475  chorismate mutase  39.71 
 
 		 391 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3121  chorismate mutase  36.4 
 
 		 365 aa  145  7.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0293375 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1207  chorismate mutase  37.23 
 
 		 371 aa  145  8.000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0297935 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1747  chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.86 
 
 		 364 aa  145  9e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0966339  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  35.87 
 
 		 382 aa  145  9e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1418  chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.32 
 
 		 362 aa  144  1e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0495  chorismate mutase  36.76 
 
 		 359 aa  144  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0778684  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1930  prephenate dehydratase  34.02 
 
 		 311 aa  144  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.898282 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0116  chorismate mutase  36.49 
 
 		 377 aa  144  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0983  Prephenate dehydratase  36.49 
 
 		 272 aa  144  2e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.432859 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0697  prephenate dehydratase  36.4 
 
 		 274 aa  144  2e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0174  chorismate mutase  37.09 
 
 		 361 aa  143  3e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0774  chorismate mutase  37.09 
 
 		 371 aa  143  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.561025  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3673  Prephenate dehydratase  38.49 
 
 		 272 aa  143  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0845  chorismate mutase  37.09 
 
 		 371 aa  143  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0602148 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  38.27 
 
 		 365 aa  143  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1904  prephenate dehydratase  37.82 
 
 		 372 aa  143  4e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0916421  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0141  Prephenate dehydratase  37.54 
 
 		 306 aa  142  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1963  chorismate mutase  33.33 
 
 		 365 aa  142  6e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0904  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  36.4 
 
 		 371 aa  142  7e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2723  chorismate mutase  34.53 
 
 		 381 aa  142  8e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2608  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.64 
 
 		 358 aa  141  9e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>