More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3673 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3673  Prephenate dehydratase  100 
 
 
272 aa  548  1e-155  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1702  Prephenate dehydratase  88.97 
 
 
272 aa  461  1e-129  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0983  Prephenate dehydratase  72.69 
 
 
272 aa  406  1.0000000000000001e-112  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.432859 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1264  Prephenate dehydratase  71.69 
 
 
268 aa  380  1e-104  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0264  prephenate dehydratase  74.26 
 
 
268 aa  379  1e-104  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0450669  normal  0.96935 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0937  prephenate dehydratase  42.26 
 
 
272 aa  193  3e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1594  prephenate dehydratase  38.38 
 
 
311 aa  181  8.000000000000001e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1930  prephenate dehydratase  38.83 
 
 
311 aa  179  4e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.898282 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0806  prephenate dehydratase  34.88 
 
 
284 aa  171  1e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3022  chorismate mutase  40.59 
 
 
360 aa  170  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.123559  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1424  prephenate dehydratase  36.3 
 
 
274 aa  167  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000368391  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01900  Prephenate dehydratase  36.36 
 
 
303 aa  162  5.0000000000000005e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  38.04 
 
 
386 aa  159  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1904  prephenate dehydratase  41.24 
 
 
372 aa  160  3e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0916421  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4445  prephenate dehydratase  38.35 
 
 
274 aa  157  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1336  chorismate mutase  36.2 
 
 
413 aa  157  2e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0046  Prephenate dehydratase  36.03 
 
 
287 aa  156  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2260  prephenate dehydratase  37.41 
 
 
278 aa  155  5.0000000000000005e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1153  Prephenate dehydratase  38.11 
 
 
276 aa  155  7e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1207  chorismate mutase  36.36 
 
 
371 aa  154  1e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0297935 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0121  prephenate dehydratase  35.09 
 
 
356 aa  152  4e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0665  prephenate dehydratase  35.64 
 
 
293 aa  152  5.9999999999999996e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.27815  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  34.09 
 
 
359 aa  150  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1334  prephenate dehydratase  38.95 
 
 
280 aa  150  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000128945  normal  0.202615 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  37.89 
 
 
371 aa  150  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1142  prephenate dehydratase  36.16 
 
 
269 aa  149  3e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0841  prephenate dehydratase  36.93 
 
 
268 aa  149  4e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  33.71 
 
 
358 aa  149  4e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  33.71 
 
 
359 aa  149  5e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1887  chorismate mutase-P and prephenate dehydratase  36.06 
 
 
360 aa  149  5e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000192693  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1561  prephenate dehydratase  35.27 
 
 
264 aa  149  5e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1284  prephenate dehydratase  34.77 
 
 
295 aa  149  6e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000630901  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0138  prephenate dehydratase  37.13 
 
 
327 aa  148  8e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0776  prephenate dehydratase  35.06 
 
 
269 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.351833  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1070  chorismate mutase-prephenate dehydratase  35.71 
 
 
276 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.330771  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5270  Prephenate dehydratase  37.09 
 
 
315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271199  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1096  Prephenate dehydratase  36.63 
 
 
288 aa  146  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1067  Prephenate dehydratase  36.63 
 
 
288 aa  146  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0282  Prephenate dehydratase  36.4 
 
 
326 aa  146  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.209842 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2485  prephenate dehydratase  37.87 
 
 
349 aa  146  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0047  prephenate dehydratase  35.16 
 
 
269 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1905  prephenate dehydratase  35.53 
 
 
279 aa  146  4.0000000000000006e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0121  Prephenate dehydratase  38.89 
 
 
305 aa  145  5e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2723  chorismate mutase  36.6 
 
 
381 aa  145  9e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0878  Prephenate dehydratase  34.07 
 
 
277 aa  145  9e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.583651  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16271  chorismate mutase-prephenate dehydratase  34.56 
 
 
281 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.763625  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2608  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.46 
 
 
358 aa  144  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0009  chorismate mutase  33.58 
 
 
385 aa  144  2e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0071  prephenate dehydratase  37.55 
 
 
324 aa  143  4e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0480  prephenate dehydratase  34.27 
 
 
296 aa  142  5e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0463972  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0316  prephenate dehydratase  40.34 
 
 
291 aa  142  6e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51764  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0881  prephenate dehydratase  34.31 
 
 
291 aa  142  6e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00114823 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0697  prephenate dehydratase  35.97 
 
 
274 aa  142  6e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0141  Prephenate dehydratase  37.82 
 
 
306 aa  142  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341146  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  35.71 
 
 
364 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0499  prephenate dehydratase  33.09 
 
 
278 aa  141  9e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2535  prephenate dehydratase  35.27 
 
 
282 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  33.71 
 
 
382 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0716  prephenate dehydratase / chorismate mutase  34.08 
 
 
387 aa  141  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2153  Prephenate dehydratase  37.17 
 
 
277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2061  Prephenate dehydratase  37.17 
 
 
277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1462  prephenate dehydratase  33.09 
 
 
358 aa  140  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2026  prephenate dehydratase  38.49 
 
 
282 aa  139  3e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.713159  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0008  Prephenate dehydratase  38.91 
 
 
279 aa  140  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16841  chorismate mutase-prephenate dehydratase  33.21 
 
 
281 aa  140  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  35.34 
 
 
364 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0302882 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1193  chorismate mutase  33.58 
 
 
366 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1244  Prephenate dehydratase  35.69 
 
 
283 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  35.34 
 
 
367 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  35.34 
 
 
364 aa  139  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  34.72 
 
 
364 aa  139  6e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1779  prephenate dehydratase  36.8 
 
 
277 aa  139  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.490374  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  35.34 
 
 
364 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0097  Prephenate dehydratase  37.23 
 
 
314 aa  139  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0315701 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2809  prephenate dehydratase  37.31 
 
 
372 aa  139  6e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.433236  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  34.72 
 
 
365 aa  137  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1964  prephenate dehydratase  36.19 
 
 
279 aa  138  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.221167 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0495  chorismate mutase  34.96 
 
 
359 aa  137  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0778684  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0078  prephenate dehydratase  35.07 
 
 
280 aa  137  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0545378  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1299  prephenate dehydratase  35.93 
 
 
263 aa  137  2e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23691  chorismate mutase-prephenate dehydratase  36.53 
 
 
304 aa  136  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0614249 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1747  chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.34 
 
 
364 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0966339  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3053  prephenate dehydratase  37.13 
 
 
315 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1963  chorismate mutase  34.96 
 
 
365 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23280  chorismate mutase  34.96 
 
 
365 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1950  prephenate dehydratase  33.83 
 
 
366 aa  136  4e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1552  prephenate dehydratase  36.43 
 
 
279 aa  136  5e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0248162  normal  0.310445 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3645  chorismate mutasea  34.34 
 
 
364 aa  135  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734175  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0951  chorismate mutase / prephenate dehydratase  33.58 
 
 
365 aa  135  5e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.356586  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17071  chorismate mutase-prephenate dehydratase  33.57 
 
 
281 aa  135  7.000000000000001e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.530579  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1594  prephenate dehydratase  36.63 
 
 
317 aa  135  8e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0572712  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0862  prephenate dehydratase / chorismate mutase  32.34 
 
 
368 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3487  prephenate dehydratase  32.83 
 
 
379 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2147  prephenate dehydratase  35.85 
 
 
373 aa  133  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.707843  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16951  chorismate mutase-prephenate dehydratase  33.45 
 
 
281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6401  Prephenate dehydratase  36.5 
 
 
305 aa  133  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1596  chorismate mutase-prephenate dehydratase  35.44 
 
 
281 aa  133  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  33.21 
 
 
373 aa  133  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19451  chorismate mutase-prephenate dehydratase  34.45 
 
 
276 aa  132  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2039  prephenate dehydratase  37.13 
 
 
275 aa  132  5e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402041 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>