More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1299 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1299  prephenate dehydratase  100 
 
 		 263 aa  532  1e-150  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1561  prephenate dehydratase  57.41 
 
 		 264 aa  300  2e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0598  prephenate dehydratase  51.71 
 
 		 265 aa  279  3e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00579273  normal  0.0174836 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2607  Prephenate dehydratase  53.53 
 
 		 268 aa  272  3e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.693661 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1032  prephenate dehydratase  48.83 
 
 		 264 aa  260  1e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.506723  normal  0.948926 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0937  prephenate dehydratase  39.63 
 
 		 272 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1418  chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.97 
 
 		 362 aa  152  5e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1594  prephenate dehydratase  31.46 
 
 		 311 aa  150  1e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0806  prephenate dehydratase  34.05 
 
 		 284 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0174  chorismate mutase  38.24 
 
 		 361 aa  144  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1904  prephenate dehydratase  41.34 
 
 		 372 aa  144  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0916421  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  36.82 
 
 		 373 aa  143  4e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  41.15 
 
 		 371 aa  142  5e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1207  chorismate mutase  36.47 
 
 		 371 aa  142  6e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0297935 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0046  Prephenate dehydratase  34.7 
 
 		 287 aa  142  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0216  chorismate mutase  33.21 
 
 		 355 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  36.25 
 
 		 364 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1589  transcription termination factor NusA  35.29 
 
 		 359 aa  139  3.9999999999999997e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  37.08 
 
 		 365 aa  139  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  36.4 
 
 		 364 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302882 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2723  chorismate mutase  35.16 
 
 		 381 aa  137  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  35.98 
 
 		 367 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01900  Prephenate dehydratase  31.79 
 
 		 303 aa  137  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  35.98 
 
 		 364 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  35.98 
 
 		 364 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  36.4 
 
 		 364 aa  135  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23280  chorismate mutase  35.98 
 
 		 365 aa  135  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1747  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.56 
 
 		 364 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0966339  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3645  chorismate mutasea  35.56 
 
 		 364 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2192  chorismate mutase  36.07 
 
 		 355 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0983  Prephenate dehydratase  34.96 
 
 		 272 aa  135  9.999999999999999e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.432859 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1963  chorismate mutase  35.56 
 
 		 365 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0771  prephenate dehydratase  38.08 
 
 		 552 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1250  chorismate mutase  34.83 
 
 		 382 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149804  normal  0.0219371 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  33.96 
 
 		 359 aa  133  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0121  prephenate dehydratase  32.09 
 
 		 356 aa  132  3.9999999999999996e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1334  prephenate dehydratase  37.41 
 
 		 280 aa  132  5e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000128945  normal  0.202615 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0794  prephenate dehydratase  37.66 
 
 		 552 aa  132  6e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1067  Prephenate dehydratase  33.82 
 
 		 288 aa  132  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0269  chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.03 
 
 		 358 aa  132  6.999999999999999e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  33.58 
 
 		 359 aa  131  9e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3487  prephenate dehydratase  32.95 
 
 		 379 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1666  P-protein  32.35 
 
 		 359 aa  131  1.0000000000000001e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1096  Prephenate dehydratase  33.82 
 
 		 288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0499  prephenate dehydratase  31.73 
 
 		 278 aa  130  3e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3673  Prephenate dehydratase  35.93 
 
 		 272 aa  130  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1930  prephenate dehydratase  32.64 
 
 		 311 aa  129  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.898282 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0338  chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.94 
 
 		 357 aa  129  3e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0776  prephenate dehydratase  30.57 
 
 		 269 aa  130  3e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.351833  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1360  chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.7 
 
 		 357 aa  129  4.0000000000000003e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1299  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.89 
 
 		 359 aa  129  5.0000000000000004e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0862  prephenate dehydratase / chorismate mutase  35.82 
 
 		 368 aa  129  6e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1647  chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.56 
 
 		 357 aa  128  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000136907  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0361  chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.56 
 
 		 357 aa  128  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1023  chorismate mutase  37.24 
 
 		 365 aa  127  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2767  chorismate mutase  33.92 
 
 		 357 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.642402 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1019  chorismate mutase  36.44 
 
 		 358 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.789998  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1569  chorismate mutase  35.66 
 
 		 360 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203479  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2147  prephenate dehydratase  35.71 
 
 		 373 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.707843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0897  chorismate mutase/prephenate dehydratase  36.44 
 
 		 358 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.255743  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  35.07 
 
 		 358 aa  126  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1442  chorismate mutase  34.87 
 
 		 374 aa  126  3e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.105369  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  38.1 
 
 		 386 aa  126  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0047  prephenate dehydratase  30.19 
 
 		 269 aa  126  3e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1462  prephenate dehydratase  35.82 
 
 		 358 aa  126  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1964  prephenate dehydratase  35.71 
 
 		 279 aa  126  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221167 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00716  P-protein  34.46 
 
 		 402 aa  126  4.0000000000000003e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00262272  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1497  P-protein (prephenate dehydratase / chorismate mutase)  34.08 
 
 		 374 aa  126  4.0000000000000003e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554673  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0078  prephenate dehydratase  35.56 
 
 		 280 aa  125  7e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0545378  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1749  prephenate dehydratase  34.08 
 
 		 418 aa  125  7e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0495  chorismate mutase  31.95 
 
 		 359 aa  124  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0778684  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0878  Prephenate dehydratase  33.05 
 
 		 277 aa  124  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.583651  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1153  Prephenate dehydratase  36.3 
 
 		 276 aa  124  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6846  chorismate mutase  33.21 
 
 		 397 aa  124  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235672 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2539  chorismate mutase  36.13 
 
 		 399 aa  124  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.409768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0926  chorismate mutase / prephenate dehydratase  35.82 
 
 		 367 aa  124  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2793  chorismate mutase  35.15 
 
 		 360 aa  124  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163655 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0480  prephenate dehydratase  32.31 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0463972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0810  prephenate dehydratase  34.55 
 
 		 278 aa  124  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000733608  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1552  prephenate dehydratase  34.42 
 
 		 279 aa  123  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0248162  normal  0.310445 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0661  P-protein (includes: chorismate mutase and prephenate dehydratase)  32.23 
 
 		 391 aa  123  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.026643  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1264  Prephenate dehydratase  34.83 
 
 		 268 aa  122  4e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1244  Prephenate dehydratase  35.38 
 
 		 283 aa  123  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004398  chorismate mutase I/prephenate dehydratase  30.88 
 
 		 392 aa  122  5e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0470  chorismate mutase, gamma, beta and epsilon  33.61 
 
 		 363 aa  122  5e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1792  chorismate mutase / prephenate dehydratase  35.15 
 
 		 360 aa  122  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027177 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1313  chorismate mutase  32.33 
 
 		 359 aa  122  6e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.21838e-16 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1142  prephenate dehydratase  29.81 
 
 		 269 aa  122  6e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1538  chorismate mutase  36.8 
 
 		 362 aa  122  8e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01001  chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.88 
 
 		 392 aa  121  9e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  31.22 
 
 		 356 aa  121  9e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2566  chorismate mutase  32.34 
 
 		 357 aa  121  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1223  Prephenate dehydratase  31.3 
 
 		 269 aa  121  9.999999999999999e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.795275  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0568  chorismate mutase  36.8 
 
 		 362 aa  121  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0176  chorismate mutase / prephenate dehydratase  37.55 
 
 		 368 aa  121  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000165847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1345  chorismate mutase  35.29 
 
 		 359 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0009  chorismate mutase  32.35 
 
 		 385 aa  120  1.9999999999999998e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0841  prephenate dehydratase  31.8 
 
 		 268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0741  chorismate mutase  36.55 
 
 		 360 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2608  chorismate mutase/prephenate dehydratase  36.29 
 
 		 358 aa  120  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>