More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1264 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1264  Prephenate dehydratase  100 
 
 		 268 aa  535  1e-151  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0983  Prephenate dehydratase  70.85 
 
 		 272 aa  386  1e-106  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.432859 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3673  Prephenate dehydratase  71.69 
 
 		 272 aa  381  1e-105  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1702  Prephenate dehydratase  71.32 
 
 		 272 aa  370  1e-102  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0264  prephenate dehydratase  69.78 
 
 		 268 aa  365  1e-100  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0450669  normal  0.96935 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0937  prephenate dehydratase  39.47 
 
 		 272 aa  184  9e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0806  prephenate dehydratase  37.09 
 
 		 284 aa  178  8e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1594  prephenate dehydratase  38.75 
 
 		 311 aa  178  8e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1930  prephenate dehydratase  37.24 
 
 		 311 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.898282 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  38.06 
 
 		 358 aa  169  5e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3022  chorismate mutase  40.67 
 
 		 360 aa  168  8e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.123559  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  38.02 
 
 		 359 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01900  Prephenate dehydratase  36.14 
 
 		 303 aa  166  4e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1207  chorismate mutase  39.62 
 
 		 371 aa  166  5e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0297935 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  37.64 
 
 		 359 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1887  chorismate mutase-P and prephenate dehydratase  38.06 
 
 		 360 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000192693  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5270  Prephenate dehydratase  39.71 
 
 		 315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1424  prephenate dehydratase  32.85 
 
 		 274 aa  160  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000368391  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0046  Prephenate dehydratase  35.55 
 
 		 287 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0121  prephenate dehydratase  35.36 
 
 		 356 aa  157  2e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0480  prephenate dehydratase  34.62 
 
 		 296 aa  154  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0463972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1462  prephenate dehydratase  36.57 
 
 		 358 aa  154  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0862  prephenate dehydratase / chorismate mutase  36.94 
 
 		 368 aa  154  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  36.92 
 
 		 386 aa  153  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3053  prephenate dehydratase  37.91 
 
 		 315 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1153  Prephenate dehydratase  36.06 
 
 		 276 aa  152  4e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0878  Prephenate dehydratase  35.04 
 
 		 277 aa  151  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.583651  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2260  prephenate dehydratase  35.82 
 
 		 278 aa  150  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1345  chorismate mutase  33.58 
 
 		 359 aa  150  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0009  chorismate mutase  36.74 
 
 		 385 aa  150  2e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0665  prephenate dehydratase  35.04 
 
 		 293 aa  149  4e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.27815  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2485  prephenate dehydratase  36.76 
 
 		 349 aa  149  4e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0495  chorismate mutase  36.12 
 
 		 359 aa  149  5e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0778684  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2608  chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.2 
 
 		 358 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1284  prephenate dehydratase  35.02 
 
 		 295 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000630901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1336  chorismate mutase  36.2 
 
 		 413 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1904  prephenate dehydratase  38.69 
 
 		 372 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0916421  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1313  chorismate mutase  35.45 
 
 		 359 aa  146  3e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.21838e-16 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0121  Prephenate dehydratase  37.01 
 
 		 305 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1142  prephenate dehydratase  36.82 
 
 		 269 aa  145  1e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0499  prephenate dehydratase  34.88 
 
 		 278 aa  144  1e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0078  prephenate dehydratase  36.33 
 
 		 280 aa  144  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0545378  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  34.57 
 
 		 364 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0138  prephenate dehydratase  36.4 
 
 		 327 aa  144  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0841  prephenate dehydratase  36.55 
 
 		 268 aa  144  2e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0776  prephenate dehydratase  35.98 
 
 		 269 aa  143  3e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.351833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1963  chorismate mutase  34.81 
 
 		 365 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6401  Prephenate dehydratase  38.2 
 
 		 305 aa  143  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23691  chorismate mutase-prephenate dehydratase  38.68 
 
 		 304 aa  142  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0614249 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1334  prephenate dehydratase  36.86 
 
 		 280 aa  142  4e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000128945  normal  0.202615 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  36.08 
 
 		 371 aa  142  4e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23280  chorismate mutase  34.81 
 
 		 365 aa  143  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  35.71 
 
 		 382 aa  142  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0716  prephenate dehydratase / chorismate mutase  35.42 
 
 		 387 aa  142  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1569  chorismate mutase  36.63 
 
 		 360 aa  142  6e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203479  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2723  chorismate mutase  35.04 
 
 		 381 aa  142  7e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4445  prephenate dehydratase  34.69 
 
 		 274 aa  142  8e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1561  prephenate dehydratase  33.21 
 
 		 264 aa  141  9.999999999999999e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0216  chorismate mutase  32.83 
 
 		 355 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0282  Prephenate dehydratase  36.9 
 
 		 326 aa  141  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.209842 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1666  P-protein  34.21 
 
 		 359 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3645  chorismate mutasea  35.56 
 
 		 364 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01130  prephenate dehydratase  37 
 
 		 316 aa  140  1.9999999999999998e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1747  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.19 
 
 		 364 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0966339  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  34.2 
 
 		 364 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0047  prephenate dehydratase  34.84 
 
 		 269 aa  140  3e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  34.2 
 
 		 364 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1070  chorismate mutase-prephenate dehydratase  32.47 
 
 		 276 aa  139  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.330771  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0951  chorismate mutase / prephenate dehydratase  34.42 
 
 		 365 aa  139  4.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.356586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0881  prephenate dehydratase  34.8 
 
 		 291 aa  139  4.999999999999999e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114823 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1792  chorismate mutase / prephenate dehydratase  33.82 
 
 		 360 aa  139  4.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027177 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0774  chorismate mutase  34.07 
 
 		 371 aa  139  6e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.561025  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1067  Prephenate dehydratase  36.19 
 
 		 288 aa  139  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2793  chorismate mutase  34.67 
 
 		 360 aa  139  6e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163655 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0926  chorismate mutase / prephenate dehydratase  35.74 
 
 		 367 aa  138  7.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1096  Prephenate dehydratase  36.19 
 
 		 288 aa  138  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  33.83 
 
 		 367 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2809  prephenate dehydratase  38.43 
 
 		 372 aa  138  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.433236  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0071  prephenate dehydratase  36.19 
 
 		 324 aa  138  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  33.83 
 
 		 364 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0845  chorismate mutase  34.07 
 
 		 371 aa  137  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0602148 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1905  prephenate dehydratase  34.91 
 
 		 279 aa  137  2e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0697  prephenate dehydratase  36.13 
 
 		 274 aa  137  2e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3282  chorismate mutase  34.07 
 
 		 366 aa  137  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0668525  normal  0.62913 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  33.83 
 
 		 364 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302882 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0097  Prephenate dehydratase  38.15 
 
 		 314 aa  136  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0315701 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1617  chorismate mutase  35.64 
 
 		 373 aa  136  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  35.45 
 
 		 373 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1193  chorismate mutase  32.84 
 
 		 366 aa  136  4e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16271  chorismate mutase-prephenate dehydratase  35.02 
 
 		 281 aa  136  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.763625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3039  chorismate mutase  35.19 
 
 		 355 aa  136  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  33.09 
 
 		 365 aa  136  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0904  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.7 
 
 		 371 aa  135  5e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1594  prephenate dehydratase  35.04 
 
 		 317 aa  135  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0572712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0897  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.96 
 
 		 358 aa  135  5e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.255743  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1019  chorismate mutase  35.96 
 
 		 358 aa  135  5e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.789998  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16841  chorismate mutase-prephenate dehydratase  36.13 
 
 		 281 aa  135  6.0000000000000005e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1589  transcription termination factor NusA  32.35 
 
 		 359 aa  135  7.000000000000001e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4721  chorismate mutase  33.95 
 
 		 366 aa  135  8e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997566 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0174  chorismate mutase  37.22 
 
 		 361 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>