More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1905 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1905  prephenate dehydratase  100 
 
 		 279 aa  574  1.0000000000000001e-163  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0697  prephenate dehydratase  51.09 
 
 		 274 aa  279  3e-74  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2535  prephenate dehydratase  40.21 
 
 		 282 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0914  prephenate dehydratase  41.28 
 
 		 282 aa  201  9e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4280  prephenate dehydratase  38.16 
 
 		 283 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000319515  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4567  prephenate dehydratase  37.81 
 
 		 283 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4525  prephenate dehydratase  37.81 
 
 		 283 aa  187  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.802903  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4331  prephenate dehydratase  37.46 
 
 		 283 aa  186  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.662649  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4168  prephenate dehydratase  37.46 
 
 		 283 aa  186  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4666  prephenate dehydratase  37.46 
 
 		 283 aa  186  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4514  prephenate dehydratase  37.46 
 
 		 283 aa  186  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.682816 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0682  prephenate dehydratase  38.16 
 
 		 283 aa  186  4e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000690128  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4179  prephenate dehydratase  37.46 
 
 		 283 aa  186  4e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.409752  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4552  prephenate dehydratase  38.16 
 
 		 283 aa  186  4e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.115026  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1424  prephenate dehydratase  38.21 
 
 		 274 aa  183  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000368391  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3149  prephenate dehydratase  38.52 
 
 		 283 aa  181  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.286294  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0937  prephenate dehydratase  38.75 
 
 		 272 aa  180  2e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01900  Prephenate dehydratase  37.23 
 
 		 303 aa  179  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1284  prephenate dehydratase  35.19 
 
 		 295 aa  177  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000630901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0097  Prephenate dehydratase  38.69 
 
 		 306 aa  177  2e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0665  prephenate dehydratase  36.21 
 
 		 293 aa  171  1e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.27815  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1153  Prephenate dehydratase  37.68 
 
 		 276 aa  169  4e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0480  prephenate dehydratase  36.24 
 
 		 296 aa  168  7e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0463972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0046  Prephenate dehydratase  33.8 
 
 		 287 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  36.23 
 
 		 373 aa  167  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2153  Prephenate dehydratase  37.28 
 
 		 277 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2061  Prephenate dehydratase  37.28 
 
 		 277 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1779  prephenate dehydratase  37.5 
 
 		 277 aa  166  5e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.490374  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  38.91 
 
 		 371 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  38.57 
 
 		 386 aa  161  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3022  chorismate mutase  36.1 
 
 		 360 aa  160  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.123559  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1904  prephenate dehydratase  36.2 
 
 		 372 aa  160  3e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0916421  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1067  Prephenate dehydratase  35.07 
 
 		 288 aa  159  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1096  Prephenate dehydratase  35.07 
 
 		 288 aa  159  6e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3051  Prephenate dehydratase  34.52 
 
 		 286 aa  157  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1334  prephenate dehydratase  36.46 
 
 		 280 aa  156  3e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000128945  normal  0.202615 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0078  prephenate dehydratase  37.05 
 
 		 280 aa  156  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0545378  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0121  prephenate dehydratase  35.53 
 
 		 356 aa  156  4e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  34.43 
 
 		 359 aa  154  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0806  prephenate dehydratase  34.62 
 
 		 284 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  34.07 
 
 		 359 aa  152  7e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1930  prephenate dehydratase  33.22 
 
 		 311 aa  152  7e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.898282 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  36.5 
 
 		 364 aa  151  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1747  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.77 
 
 		 364 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0966339  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23280  chorismate mutase  36.13 
 
 		 365 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1594  prephenate dehydratase  32 
 
 		 311 aa  150  2e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  36.13 
 
 		 364 aa  149  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0008  Prephenate dehydratase  35.02 
 
 		 279 aa  150  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3645  chorismate mutasea  35.4 
 
 		 364 aa  149  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1336  chorismate mutase  33.22 
 
 		 413 aa  149  4e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  35.77 
 
 		 367 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  36.13 
 
 		 364 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302882 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  35.77 
 
 		 364 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1963  chorismate mutase  35.77 
 
 		 365 aa  148  7e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2048  Prephenate dehydratase  39.11 
 
 		 383 aa  148  8e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  35.77 
 
 		 364 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2723  chorismate mutase  33.33 
 
 		 381 aa  147  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1070  chorismate mutase-prephenate dehydratase  35.27 
 
 		 276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.330771  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1887  chorismate mutase-P and prephenate dehydratase  35.53 
 
 		 360 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000192693  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0316  prephenate dehydratase  35.77 
 
 		 291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2039  prephenate dehydratase  36.84 
 
 		 275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402041 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1250  chorismate mutase  35.9 
 
 		 382 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149804  normal  0.0219371 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1950  prephenate dehydratase  36.5 
 
 		 366 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  35.77 
 
 		 365 aa  147  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0499  prephenate dehydratase  34.77 
 
 		 278 aa  147  3e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0878  Prephenate dehydratase  35.87 
 
 		 277 aa  146  3e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.583651  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2608  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.53 
 
 		 358 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0810  prephenate dehydratase  34.52 
 
 		 278 aa  145  5e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000733608  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3673  Prephenate dehydratase  36.57 
 
 		 272 aa  145  5e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1274  Prephenate dehydratase  33.33 
 
 		 283 aa  145  8.000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.143438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01130  prephenate dehydratase  32.86 
 
 		 316 aa  145  9e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3039  chorismate mutase  33.57 
 
 		 355 aa  145  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0862  prephenate dehydratase / chorismate mutase  35.16 
 
 		 368 aa  145  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  32.97 
 
 		 358 aa  144  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2260  prephenate dehydratase  33.92 
 
 		 278 aa  144  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0116  chorismate mutase  35.66 
 
 		 377 aa  144  1e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0495  chorismate mutase  35.29 
 
 		 359 aa  144  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0778684  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16271  chorismate mutase-prephenate dehydratase  37.25 
 
 		 281 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.763625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2147  prephenate dehydratase  36.13 
 
 		 373 aa  143  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.707843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  34.94 
 
 		 356 aa  143  3e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0009  chorismate mutase  31.14 
 
 		 385 aa  143  3e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6401  Prephenate dehydratase  34.55 
 
 		 305 aa  143  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1207  chorismate mutase  33.33 
 
 		 371 aa  143  3e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0297935 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0841  prephenate dehydratase  35.63 
 
 		 268 aa  143  4e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1617  chorismate mutase  34.55 
 
 		 373 aa  142  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1702  Prephenate dehydratase  36.36 
 
 		 272 aa  142  5e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2375  chorismate mutase  33.94 
 
 		 378 aa  142  6e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3487  prephenate dehydratase  35.9 
 
 		 379 aa  142  6e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1462  prephenate dehydratase  36.73 
 
 		 358 aa  142  7e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4721  chorismate mutase  34.55 
 
 		 366 aa  141  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997566 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1264  Prephenate dehydratase  34.91 
 
 		 268 aa  141  9.999999999999999e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3121  chorismate mutase  33.82 
 
 		 365 aa  141  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0293375 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1232  prephenate dehydratase  36 
 
 		 363 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.964016 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0897  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.09 
 
 		 358 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.255743  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1569  chorismate mutase  34.18 
 
 		 360 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203479  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1792  chorismate mutase / prephenate dehydratase  34.42 
 
 		 360 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027177 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0176  chorismate mutase / prephenate dehydratase  35.23 
 
 		 368 aa  140  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000165847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1019  chorismate mutase  33.09 
 
 		 358 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.789998  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4418  prephenate dehydratase  35.97 
 
 		 284 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.299443 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0776  prephenate dehydratase  32.84 
 
 		 269 aa  140  3e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.351833  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>