More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0697 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_0697  prephenate dehydratase  100 
 
 
274 aa  563  1.0000000000000001e-159  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1905  prephenate dehydratase  51.09 
 
 
279 aa  279  3e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2535  prephenate dehydratase  41.49 
 
 
282 aa  207  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4567  prephenate dehydratase  43.06 
 
 
283 aa  199  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4168  prephenate dehydratase  43.42 
 
 
283 aa  199  5e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4514  prephenate dehydratase  43.42 
 
 
283 aa  199  5e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.682816 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4331  prephenate dehydratase  43.42 
 
 
283 aa  199  6e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.662649  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4666  prephenate dehydratase  43.42 
 
 
283 aa  199  6e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4280  prephenate dehydratase  42.5 
 
 
283 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000319515  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4525  prephenate dehydratase  42.7 
 
 
283 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.802903  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4179  prephenate dehydratase  43.42 
 
 
283 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.409752  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4552  prephenate dehydratase  42.35 
 
 
283 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.115026  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0682  prephenate dehydratase  42.35 
 
 
283 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000690128  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1153  Prephenate dehydratase  40.66 
 
 
276 aa  190  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3149  prephenate dehydratase  41.28 
 
 
283 aa  189  5e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.286294  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1594  prephenate dehydratase  40.29 
 
 
311 aa  187  2e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0937  prephenate dehydratase  38.52 
 
 
272 aa  187  2e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0914  prephenate dehydratase  40.57 
 
 
282 aa  183  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0097  Prephenate dehydratase  39.48 
 
 
306 aa  178  7e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01900  Prephenate dehydratase  39.78 
 
 
303 aa  178  8e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1424  prephenate dehydratase  38.57 
 
 
274 aa  177  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000368391  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0806  prephenate dehydratase  38.41 
 
 
284 aa  175  9e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1779  prephenate dehydratase  37.82 
 
 
277 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.490374  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2260  prephenate dehydratase  37.77 
 
 
278 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2061  Prephenate dehydratase  39.18 
 
 
277 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2153  Prephenate dehydratase  39.18 
 
 
277 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1904  prephenate dehydratase  37 
 
 
372 aa  170  3e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0916421  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0878  Prephenate dehydratase  39.27 
 
 
277 aa  170  3e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.583651  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3051  Prephenate dehydratase  36.3 
 
 
286 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0078  prephenate dehydratase  35.51 
 
 
280 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0545378  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  39.27 
 
 
386 aa  166  5e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1887  chorismate mutase-P and prephenate dehydratase  39.71 
 
 
360 aa  163  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000192693  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1336  chorismate mutase  36.71 
 
 
413 aa  160  2e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  36.9 
 
 
356 aa  159  3e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  37 
 
 
373 aa  159  4e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0121  prephenate dehydratase  38.15 
 
 
356 aa  159  5e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2043  prephenate dehydratase  37.23 
 
 
283 aa  159  7e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.64689  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0665  prephenate dehydratase  36.55 
 
 
293 aa  158  8e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.27815  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1067  Prephenate dehydratase  36.65 
 
 
288 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23140  chorismate mutase, clade 2  35.36 
 
 
706 aa  157  2e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.839893  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1096  Prephenate dehydratase  36.65 
 
 
288 aa  156  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1207  chorismate mutase  34.93 
 
 
371 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0297935 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0046  Prephenate dehydratase  36.17 
 
 
287 aa  155  8e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2608  chorismate mutase/prephenate dehydratase  36.76 
 
 
358 aa  154  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  37.19 
 
 
371 aa  154  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1930  prephenate dehydratase  34.12 
 
 
311 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.898282 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3039  chorismate mutase  34.75 
 
 
355 aa  152  4e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2192  chorismate mutase  37.37 
 
 
355 aa  152  4e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0633  Prephenate dehydratase  38.18 
 
 
285 aa  152  4e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  36.5 
 
 
365 aa  152  5.9999999999999996e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2039  prephenate dehydratase  37.45 
 
 
275 aa  152  7e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402041 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0008  Prephenate dehydratase  37.74 
 
 
279 aa  152  7e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1792  chorismate mutase / prephenate dehydratase  36.46 
 
 
360 aa  152  8e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00027177 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3022  chorismate mutase  35.27 
 
 
360 aa  151  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.123559  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4445  prephenate dehydratase  35.25 
 
 
274 aa  151  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1070  chorismate mutase-prephenate dehydratase  37.4 
 
 
276 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.330771  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1334  prephenate dehydratase  37.3 
 
 
280 aa  150  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000128945  normal  0.202615 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  34.56 
 
 
359 aa  149  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2793  chorismate mutase  35.59 
 
 
360 aa  150  3e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163655 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3645  chorismate mutasea  35.9 
 
 
364 aa  149  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734175  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1284  prephenate dehydratase  33.92 
 
 
295 aa  149  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000630901  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  34.43 
 
 
359 aa  149  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3282  chorismate mutase  35.77 
 
 
366 aa  149  4e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0668525  normal  0.62913 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2048  Prephenate dehydratase  35.69 
 
 
383 aa  149  6e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0771  prephenate dehydratase  36.76 
 
 
552 aa  149  6e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0316  prephenate dehydratase  36.78 
 
 
291 aa  148  7e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51764  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0801  chorismate mutase  38.89 
 
 
359 aa  148  8e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  35.4 
 
 
364 aa  148  9e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0302882 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1497  P-protein (prephenate dehydratase / chorismate mutase)  34.55 
 
 
374 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554673  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1747  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.4 
 
 
364 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0966339  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1569  chorismate mutase  34.91 
 
 
360 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203479  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1552  prephenate dehydratase  33.94 
 
 
279 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0248162  normal  0.310445 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1617  chorismate mutase  35.77 
 
 
373 aa  148  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0794  prephenate dehydratase  36.4 
 
 
552 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  35.53 
 
 
364 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16271  chorismate mutase-prephenate dehydratase  37.2 
 
 
281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.763625  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0499  prephenate dehydratase  38.93 
 
 
278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1442  chorismate mutase  34.18 
 
 
374 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.105369  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23691  chorismate mutase-prephenate dehydratase  36.84 
 
 
304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0614249 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  34.67 
 
 
367 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  35.04 
 
 
364 aa  146  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  34.67 
 
 
364 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1964  prephenate dehydratase  33.33 
 
 
279 aa  145  5e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.221167 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  34.67 
 
 
364 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0845  chorismate mutase  33.09 
 
 
371 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0602148 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3673  Prephenate dehydratase  36.86 
 
 
272 aa  144  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0862  prephenate dehydratase / chorismate mutase  36.36 
 
 
368 aa  144  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19451  chorismate mutase-prephenate dehydratase  38.37 
 
 
276 aa  144  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1244  Prephenate dehydratase  33.09 
 
 
283 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00716  P-protein  33.45 
 
 
402 aa  144  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00262272  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1462  prephenate dehydratase  36.4 
 
 
358 aa  144  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1394  chorismate mutase  35.04 
 
 
371 aa  143  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0138573  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  36.03 
 
 
358 aa  143  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0009  chorismate mutase  33.21 
 
 
385 aa  143  3e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2466  chorismate mutase / prephenate dehydratase  35.04 
 
 
371 aa  143  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.148339 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0774  chorismate mutase  32.72 
 
 
371 aa  142  4e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.561025  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1264  Prephenate dehydratase  37.82 
 
 
268 aa  142  4e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0877  Prephenate dehydratase  35.74 
 
 
288 aa  143  4e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3121  chorismate mutase  34.43 
 
 
365 aa  142  5e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0293375 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0480  prephenate dehydratase  34.01 
 
 
296 aa  142  6e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0463972  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>