More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0914 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0914  prephenate dehydratase  100 
 
 
282 aa  580  1e-164  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2535  prephenate dehydratase  78.65 
 
 
282 aa  464  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4168  prephenate dehydratase  60.14 
 
 
283 aa  344  1e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4514  prephenate dehydratase  60.14 
 
 
283 aa  344  1e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.682816 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4179  prephenate dehydratase  60.14 
 
 
283 aa  343  2e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.409752  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4280  prephenate dehydratase  60.14 
 
 
283 aa  342  4e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000319515  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4331  prephenate dehydratase  59.79 
 
 
283 aa  342  5e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.662649  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4666  prephenate dehydratase  59.79 
 
 
283 aa  342  5e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4525  prephenate dehydratase  59.79 
 
 
283 aa  341  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.802903  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0682  prephenate dehydratase  60.14 
 
 
283 aa  340  2e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000690128  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4552  prephenate dehydratase  60.14 
 
 
283 aa  340  2e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.115026  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4567  prephenate dehydratase  59.43 
 
 
283 aa  339  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3149  prephenate dehydratase  59.79 
 
 
283 aa  337  9.999999999999999e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.286294  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1905  prephenate dehydratase  41.28 
 
 
279 aa  210  2e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0937  prephenate dehydratase  42.09 
 
 
272 aa  208  7e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1153  Prephenate dehydratase  40.21 
 
 
276 aa  204  1e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1779  prephenate dehydratase  38.93 
 
 
277 aa  195  9e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.490374  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3053  prephenate dehydratase  41.07 
 
 
315 aa  192  6e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0697  prephenate dehydratase  40.57 
 
 
274 aa  191  1e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2153  Prephenate dehydratase  38.57 
 
 
277 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2061  Prephenate dehydratase  38.57 
 
 
277 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1904  prephenate dehydratase  39.43 
 
 
372 aa  189  4e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0916421  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0806  prephenate dehydratase  37.28 
 
 
284 aa  189  5e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3051  Prephenate dehydratase  39.72 
 
 
286 aa  189  5e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01900  Prephenate dehydratase  37.81 
 
 
303 aa  181  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0282  Prephenate dehydratase  41.58 
 
 
326 aa  180  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.209842 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  36.92 
 
 
373 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0121  Prephenate dehydratase  40.5 
 
 
305 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0141  Prephenate dehydratase  38.16 
 
 
306 aa  178  7e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341146  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1930  prephenate dehydratase  37.25 
 
 
311 aa  177  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.898282 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0078  prephenate dehydratase  37.5 
 
 
280 aa  176  5e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0545378  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1594  prephenate dehydratase  33.21 
 
 
311 aa  175  6e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1274  Prephenate dehydratase  36.62 
 
 
283 aa  175  9e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.143438  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1424  prephenate dehydratase  34.97 
 
 
274 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000368391  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2260  prephenate dehydratase  35.21 
 
 
278 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0071  prephenate dehydratase  39.64 
 
 
324 aa  172  5e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5270  Prephenate dehydratase  39.86 
 
 
315 aa  172  5.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271199  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0097  Prephenate dehydratase  39.15 
 
 
314 aa  171  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0315701 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6401  Prephenate dehydratase  38.71 
 
 
305 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0138  prephenate dehydratase  38.57 
 
 
327 aa  169  4e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0878  Prephenate dehydratase  36.17 
 
 
277 aa  167  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.583651  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2105  prephenate dehydratase  36.84 
 
 
318 aa  167  2e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.547731 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1964  prephenate dehydratase  36.97 
 
 
279 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.221167 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1244  Prephenate dehydratase  37.68 
 
 
283 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2039  prephenate dehydratase  39.29 
 
 
275 aa  165  9e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402041 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1552  prephenate dehydratase  35.34 
 
 
279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0248162  normal  0.310445 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0046  Prephenate dehydratase  36.21 
 
 
287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  37.86 
 
 
386 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3039  chorismate mutase  36.2 
 
 
355 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  35.84 
 
 
364 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  36.56 
 
 
359 aa  163  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01130  prephenate dehydratase  38.08 
 
 
316 aa  162  4.0000000000000004e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0121  prephenate dehydratase  35.84 
 
 
356 aa  162  6e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1334  prephenate dehydratase  38.16 
 
 
280 aa  162  7e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000128945  normal  0.202615 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  35.48 
 
 
367 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1747  chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.77 
 
 
364 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0966339  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3645  chorismate mutasea  34.77 
 
 
364 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734175  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  38.16 
 
 
371 aa  161  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  35.48 
 
 
364 aa  161  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  35.48 
 
 
364 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0302882 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  36.56 
 
 
359 aa  160  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  35.13 
 
 
364 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  35.13 
 
 
364 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23280  chorismate mutase  34.77 
 
 
365 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  35.13 
 
 
365 aa  159  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0097  Prephenate dehydratase  36.69 
 
 
306 aa  157  2e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1963  chorismate mutase  34.77 
 
 
365 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08570  prephenate dehydratase  33.33 
 
 
286 aa  156  3e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0174  chorismate mutase  36.46 
 
 
361 aa  156  3e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0841  prephenate dehydratase  34.89 
 
 
268 aa  157  3e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0480  prephenate dehydratase  34.47 
 
 
296 aa  156  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0463972  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0008  Prephenate dehydratase  36.75 
 
 
279 aa  156  4e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1284  prephenate dehydratase  34.04 
 
 
295 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000630901  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4445  prephenate dehydratase  37.23 
 
 
274 aa  155  6e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1336  chorismate mutase  34.92 
 
 
413 aa  155  7e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  38.35 
 
 
358 aa  155  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0862  prephenate dehydratase / chorismate mutase  38.71 
 
 
368 aa  155  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1207  chorismate mutase  34.41 
 
 
371 aa  154  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0297935 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0801  chorismate mutase  33.33 
 
 
359 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1569  chorismate mutase  33.81 
 
 
360 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203479  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0810  prephenate dehydratase  35.36 
 
 
278 aa  153  2.9999999999999998e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000733608  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1418  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.71 
 
 
362 aa  151  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2485  prephenate dehydratase  35.87 
 
 
349 aa  151  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0268  Prephenate dehydratase  37.28 
 
 
311 aa  150  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2091  Chorismate mutase  35.94 
 
 
280 aa  149  4e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.746584  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0904  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.45 
 
 
371 aa  148  8e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1594  prephenate dehydratase  36.2 
 
 
317 aa  148  9e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0572712  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1250  chorismate mutase  34.89 
 
 
382 aa  148  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149804  normal  0.0219371 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0176  chorismate mutase / prephenate dehydratase  36.88 
 
 
368 aa  147  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000165847  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1067  Prephenate dehydratase  35.29 
 
 
288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0665  prephenate dehydratase  34.86 
 
 
293 aa  147  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.27815  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0774  chorismate mutase  32.74 
 
 
371 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.561025  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1792  chorismate mutase / prephenate dehydratase  33.33 
 
 
360 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00027177 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1096  Prephenate dehydratase  35.29 
 
 
288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2793  chorismate mutase  34.05 
 
 
360 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163655 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00716  P-protein  33.21 
 
 
402 aa  146  3e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00262272  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1538  chorismate mutase  36.2 
 
 
362 aa  146  3e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1023  chorismate mutase  37.28 
 
 
365 aa  146  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0845  chorismate mutase  32.74 
 
 
371 aa  145  5e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0602148 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1142  prephenate dehydratase  35 
 
 
269 aa  145  5e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>