More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0810 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0810  prephenate dehydratase  100 
 
 		 278 aa  571  1.0000000000000001e-162  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000733608  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2260  prephenate dehydratase  35.53 
 
 		 278 aa  179  5.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1153  Prephenate dehydratase  36.26 
 
 		 276 aa  177  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1424  prephenate dehydratase  35.06 
 
 		 274 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000368391  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0121  prephenate dehydratase  36.36 
 
 		 356 aa  168  9e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0937  prephenate dehydratase  35.07 
 
 		 272 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1244  Prephenate dehydratase  35.82 
 
 		 283 aa  166  4e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0078  prephenate dehydratase  33.7 
 
 		 280 aa  166  4e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0545378  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1594  prephenate dehydratase  36.8 
 
 		 311 aa  166  5.9999999999999996e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0806  prephenate dehydratase  34.75 
 
 		 284 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3051  Prephenate dehydratase  35.51 
 
 		 286 aa  161  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2723  chorismate mutase  34.09 
 
 		 381 aa  159  3e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1779  prephenate dehydratase  37.23 
 
 		 277 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.490374  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01900  Prephenate dehydratase  35.13 
 
 		 303 aa  156  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2153  Prephenate dehydratase  37.04 
 
 		 277 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2061  Prephenate dehydratase  37.04 
 
 		 277 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0878  Prephenate dehydratase  34.18 
 
 		 277 aa  156  3e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.583651  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  35.23 
 
 		 359 aa  156  4e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  34.85 
 
 		 359 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1930  prephenate dehydratase  35.14 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.898282 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2475  chorismate mutase  34.09 
 
 		 391 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1749  prephenate dehydratase  31.95 
 
 		 418 aa  152  8e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1569  chorismate mutase  34.7 
 
 		 360 aa  150  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203479  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  31.46 
 
 		 364 aa  150  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23280  chorismate mutase  31.09 
 
 		 365 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1963  chorismate mutase  31.09 
 
 		 365 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1418  chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.09 
 
 		 362 aa  149  4e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1887  chorismate mutase-P and prephenate dehydratase  34.44 
 
 		 360 aa  149  4e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000192693  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  30.74 
 
 		 364 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302882 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  31.09 
 
 		 364 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2535  prephenate dehydratase  34.17 
 
 		 282 aa  147  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  31.09 
 
 		 367 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  31.09 
 
 		 364 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0794  prephenate dehydratase  32.84 
 
 		 552 aa  146  5e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0771  prephenate dehydratase  32.84 
 
 		 552 aa  146  5e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  30.34 
 
 		 365 aa  145  5e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3645  chorismate mutasea  29.96 
 
 		 364 aa  145  6e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1964  prephenate dehydratase  32.58 
 
 		 279 aa  145  6e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221167 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1747  chorismate mutase/prephenate dehydratase  29.96 
 
 		 364 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0966339  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1207  chorismate mutase  28.84 
 
 		 371 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0297935 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2793  chorismate mutase  31.72 
 
 		 360 aa  145  7.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163655 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2608  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.96 
 
 		 358 aa  144  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  29.96 
 
 		 364 aa  144  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1552  prephenate dehydratase  32.21 
 
 		 279 aa  144  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0248162  normal  0.310445 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6846  chorismate mutase  32.71 
 
 		 397 aa  145  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235672 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3487  prephenate dehydratase  31.16 
 
 		 379 aa  143  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  28.79 
 
 		 373 aa  144  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2039  prephenate dehydratase  38.52 
 
 		 275 aa  143  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402041 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0716  prephenate dehydratase / chorismate mutase  30.83 
 
 		 387 aa  143  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0009  chorismate mutase  30.37 
 
 		 385 aa  143  4e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0862  prephenate dehydratase / chorismate mutase  33.33 
 
 		 368 aa  142  5e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2858  chorismate mutase  30.37 
 
 		 373 aa  142  6e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.42066  hitchhiker  0.0000000270068 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3149  prephenate dehydratase  34.55 
 
 		 283 aa  142  6e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.286294  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0495  Prephenate dehydratase  35.04 
 
 		 279 aa  142  7e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2809  prephenate dehydratase  33.94 
 
 		 372 aa  142  8e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.433236  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3039  chorismate mutase  29.55 
 
 		 355 aa  142  8e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  30.45 
 
 		 382 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  34.08 
 
 		 358 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1462  prephenate dehydratase  33.71 
 
 		 358 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1792  chorismate mutase / prephenate dehydratase  31.23 
 
 		 360 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027177 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  31.09 
 
 		 371 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1617  chorismate mutase  29.48 
 
 		 373 aa  140  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1904  prephenate dehydratase  33.21 
 
 		 372 aa  140  3e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0916421  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0841  prephenate dehydratase  35.69 
 
 		 268 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4445  prephenate dehydratase  34.2 
 
 		 274 aa  139  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1345  chorismate mutase  34.83 
 
 		 359 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2583  prephenate dehydratase  32.58 
 
 		 372 aa  139  6e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1336  chorismate mutase  31.21 
 
 		 413 aa  139  7e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0951  chorismate mutase / prephenate dehydratase  30.97 
 
 		 365 aa  138  8.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.356586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0480  prephenate dehydratase  32.08 
 
 		 296 aa  138  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0463972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0495  chorismate mutase  30.3 
 
 		 359 aa  137  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0778684  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0665  prephenate dehydratase  36.23 
 
 		 293 aa  137  3.0000000000000003e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.27815  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4721  chorismate mutase  29.74 
 
 		 366 aa  136  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997566 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1313  chorismate mutase  29.92 
 
 		 359 aa  135  6.0000000000000005e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.21838e-16 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2147  prephenate dehydratase  29.55 
 
 		 373 aa  135  6.0000000000000005e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.707843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3022  chorismate mutase  33.82 
 
 		 360 aa  135  7.000000000000001e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.123559  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1394  chorismate mutase  29.37 
 
 		 371 aa  135  8e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0138573  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1067  Prephenate dehydratase  35.38 
 
 		 288 aa  135  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1635  chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.32 
 
 		 360 aa  135  8e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2466  chorismate mutase / prephenate dehydratase  29.37 
 
 		 371 aa  135  8e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.148339 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00716  P-protein  30.8 
 
 		 402 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00262272  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0914  prephenate dehydratase  35.36 
 
 		 282 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1096  Prephenate dehydratase  35.38 
 
 		 288 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1293  Prephenate dehydratase  32.85 
 
 		 293 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.821795  normal  0.378721 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  30.83 
 
 		 356 aa  134  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0950  chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.57 
 
 		 360 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1223  Prephenate dehydratase  34.57 
 
 		 269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.795275  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0432  chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.57 
 
 		 360 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2885  chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.57 
 
 		 360 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.629426  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2997  chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.57 
 
 		 360 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.379619  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4280  prephenate dehydratase  34.55 
 
 		 283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000319515  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0198  chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.57 
 
 		 360 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2948  chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.57 
 
 		 360 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2575  chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.57 
 
 		 360 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0116  chorismate mutase  29.41 
 
 		 377 aa  133  3e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0537  prephenate dehydratase  32.48 
 
 		 279 aa  133  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0338  chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.71 
 
 		 357 aa  133  3e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0877  Prephenate dehydratase  32.48 
 
 		 288 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1905  prephenate dehydratase  34.52 
 
 		 279 aa  133  3.9999999999999996e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0499  prephenate dehydratase  35.48 
 
 		 278 aa  132  5e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>