More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1223 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1223  Prephenate dehydratase  100 
 
 		 269 aa  543  1e-154  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.795275  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0012  prephenate dehydratase  50.74 
 
 		 206 aa  206  3e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000330103  normal  0.121609 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1666  P-protein  40.91 
 
 		 359 aa  179  4e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  38.29 
 
 		 356 aa  179  4.999999999999999e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0338  chorismate mutase/prephenate dehydratase  42.37 
 
 		 357 aa  179  4.999999999999999e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1647  chorismate mutase/prephenate dehydratase  42.37 
 
 		 357 aa  178  9e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000136907  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0361  chorismate mutase/prephenate dehydratase  41.98 
 
 		 357 aa  177  2e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1589  transcription termination factor NusA  40.74 
 
 		 359 aa  177  2e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1344  prephenate dehydratase  37.88 
 
 		 286 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00546252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0878  Prephenate dehydratase  41.03 
 
 		 277 aa  171  9e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.583651  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0269  chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.04 
 
 		 358 aa  171  1e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0121  prephenate dehydratase  37.59 
 
 		 356 aa  168  8e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0216  chorismate mutase  41.27 
 
 		 355 aa  166  4e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1360  chorismate mutase/prephenate dehydratase  38.93 
 
 		 357 aa  166  4e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0102  prephenate dehydratase  39.84 
 
 		 310 aa  166  4e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00124161 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  36.47 
 
 		 359 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  37.83 
 
 		 359 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1150  prephenate dehydratase  38.37 
 
 		 262 aa  160  1e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  5.713990000000001e-18 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2767  chorismate mutase  38.75 
 
 		 357 aa  160  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.642402 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0111  prephenate dehydratase  35.85 
 
 		 279 aa  155  4e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0470  chorismate mutase, gamma, beta and epsilon  38.95 
 
 		 363 aa  155  7e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2566  chorismate mutase  38.24 
 
 		 357 aa  155  7e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0801  chorismate mutase  40.23 
 
 		 359 aa  155  8e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0078  prephenate dehydratase  38.21 
 
 		 280 aa  154  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0545378  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  37.97 
 
 		 371 aa  152  4e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2723  chorismate mutase  35.06 
 
 		 381 aa  152  4e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2608  chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.22 
 
 		 358 aa  151  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1299  chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.12 
 
 		 359 aa  150  2e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0174  chorismate mutase  34.09 
 
 		 361 aa  150  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  38.72 
 
 		 358 aa  149  4e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3724  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  34.33 
 
 		 632 aa  147  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1749  prephenate dehydratase  31.82 
 
 		 418 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1334  prephenate dehydratase  35.93 
 
 		 280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000128945  normal  0.202615 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1207  chorismate mutase  31.95 
 
 		 371 aa  146  3e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0297935 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0862  prephenate dehydratase / chorismate mutase  36.84 
 
 		 368 aa  144  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3039  chorismate mutase  32.2 
 
 		 355 aa  144  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0937  prephenate dehydratase  36.26 
 
 		 272 aa  145  1e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1644  Prephenate dehydratase  33.09 
 
 		 355 aa  143  3e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.241055  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1497  P-protein (prephenate dehydratase / chorismate mutase)  34.34 
 
 		 374 aa  142  5e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554673  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1567  prephenate dehydratase  32.45 
 
 		 271 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3487  prephenate dehydratase  32.58 
 
 		 379 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1594  prephenate dehydratase  36.9 
 
 		 311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1442  chorismate mutase  33.96 
 
 		 374 aa  140  3e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.105369  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1153  Prephenate dehydratase  36.63 
 
 		 276 aa  140  3e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0075  prephenate dehydratase  38.31 
 
 		 256 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.629526 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  34.08 
 
 		 364 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  31.85 
 
 		 373 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0046  Prephenate dehydratase  34.81 
 
 		 287 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1747  chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.08 
 
 		 364 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0966339  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0877  Prephenate dehydratase  32.14 
 
 		 288 aa  139  6e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  33.71 
 
 		 367 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  33.33 
 
 		 364 aa  137  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  33.71 
 
 		 364 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  33.71 
 
 		 364 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  33.33 
 
 		 364 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302882 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3645  chorismate mutasea  33.71 
 
 		 364 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1887  chorismate mutase-P and prephenate dehydratase  33.58 
 
 		 360 aa  136  4e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000192693  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1963  chorismate mutase  33.71 
 
 		 365 aa  136  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2809  prephenate dehydratase  32.83 
 
 		 372 aa  136  5e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.433236  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23280  chorismate mutase  33.71 
 
 		 365 aa  135  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0499  prephenate dehydratase  37.86 
 
 		 278 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  32.96 
 
 		 365 aa  135  7.000000000000001e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1345  chorismate mutase  35.71 
 
 		 359 aa  135  7.000000000000001e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1284  prephenate dehydratase  33.22 
 
 		 295 aa  135  9e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000630901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2375  chorismate mutase  33.58 
 
 		 378 aa  135  9e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2583  prephenate dehydratase  32.58 
 
 		 372 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00716  P-protein  31.7 
 
 		 402 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00262272  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0116  chorismate mutase  32.58 
 
 		 377 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1462  prephenate dehydratase  36.09 
 
 		 358 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0810  prephenate dehydratase  34.57 
 
 		 278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000733608  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2475  chorismate mutase  33.33 
 
 		 391 aa  133  3e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1950  prephenate dehydratase  36.36 
 
 		 366 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  33.7 
 
 		 358 aa  132  6.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.46 
 
 		 358 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1193  chorismate mutase  34.21 
 
 		 366 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0926  chorismate mutase / prephenate dehydratase  32.71 
 
 		 367 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2539  chorismate mutase  32.08 
 
 		 399 aa  129  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.409768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1336  chorismate mutase  30.47 
 
 		 413 aa  129  4.0000000000000003e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  33.46 
 
 		 358 aa  129  7.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0897  chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.45 
 
 		 358 aa  128  8.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.255743  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1019  chorismate mutase  30.45 
 
 		 358 aa  128  8.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.789998  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0806  prephenate dehydratase  35.23 
 
 		 284 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2192  chorismate mutase  31 
 
 		 355 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1437  prephenate dehydratase  35.09 
 
 		 276 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0365  chorismate mutase / prephenate dehydratase  33.33 
 
 		 385 aa  126  4.0000000000000003e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0036667  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0665  prephenate dehydratase  31.9 
 
 		 293 aa  125  7e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.27815  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1930  prephenate dehydratase  35.03 
 
 		 311 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.898282 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0480  prephenate dehydratase  34.27 
 
 		 296 aa  125  8.000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0463972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1904  prephenate dehydratase  33.1 
 
 		 372 aa  125  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0916421  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  33.08 
 
 		 382 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1067  Prephenate dehydratase  35.4 
 
 		 288 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1096  Prephenate dehydratase  35.4 
 
 		 288 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0845  chorismate mutase  30.97 
 
 		 371 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0602148 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0794  prephenate dehydratase  36.26 
 
 		 552 aa  124  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0774  chorismate mutase  31.09 
 
 		 371 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.561025  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0771  prephenate dehydratase  36.26 
 
 		 552 aa  124  2e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6846  chorismate mutase  33.99 
 
 		 397 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235672 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0904  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.74 
 
 		 371 aa  123  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  36.63 
 
 		 386 aa  123  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0176  chorismate mutase / prephenate dehydratase  34.66 
 
 		 368 aa  123  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000165847  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>