More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1437 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1437  prephenate dehydratase  100 
 
 		 276 aa  569  1e-161  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1303  prephenate dehydratase  96.74 
 
 		 276 aa  552  1e-156  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1547  prephenate dehydratase  94.57 
 
 		 276 aa  545  1e-154  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1937  Chorismate mutase  41.54 
 
 		 274 aa  206  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1513  Prephenate dehydratase  38.52 
 
 		 277 aa  200  3e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.807541 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2043  prephenate dehydratase  35.42 
 
 		 283 aa  191  8e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.64689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  39.41 
 
 		 358 aa  191  1e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07375  putative prefrenate dehydratase  39.03 
 
 		 275 aa  185  5e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  39.03 
 
 		 358 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0764  prephenate dehydratase  37.36 
 
 		 280 aa  182  7e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.441795  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  38.66 
 
 		 358 aa  181  2e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0517  prephenate dehydratase  36.86 
 
 		 275 aa  178  7e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.72305  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1567  prephenate dehydratase  36.63 
 
 		 271 aa  178  7e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3724  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  38.26 
 
 		 632 aa  176  3e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1881  prephenate dehydratase  39.19 
 
 		 298 aa  176  3e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.858484 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0877  Prephenate dehydratase  35.66 
 
 		 288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0633  Prephenate dehydratase  38.04 
 
 		 285 aa  170  2e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1056  Prephenate dehydratase  36.9 
 
 		 284 aa  170  3e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0121  prephenate dehydratase  38.66 
 
 		 356 aa  169  6e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2375  chorismate mutase  35.58 
 
 		 378 aa  167  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004398  chorismate mutase I/prephenate dehydratase  34.78 
 
 		 392 aa  166  4e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01001  chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  34.42 
 
 		 392 aa  165  8e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0783  prephenate dehydratase  34.83 
 
 		 380 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0235  chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.43 
 
 		 391 aa  163  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1293  Prephenate dehydratase  35.64 
 
 		 293 aa  161  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.821795  normal  0.378721 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1345  prephenate dehydratase  35.71 
 
 		 379 aa  160  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  32.72 
 
 		 371 aa  158  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  33.82 
 
 		 359 aa  157  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_3267  predicted protein  33.12 
 
 		 304 aa  156  4e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  34.19 
 
 		 358 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10160  monofunctional chorismate mutase, clade 2  34.07 
 
 		 403 aa  155  5.0000000000000005e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000617885  hitchhiker  0.000000765088 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0661  P-protein (includes: chorismate mutase and prephenate dehydratase)  33.58 
 
 		 391 aa  155  8e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.026643  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2091  Chorismate mutase  34.56 
 
 		 280 aa  153  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.746584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4217  prephenate dehydratase  34.81 
 
 		 280 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.239434  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1644  prephenate dehydratase  34.66 
 
 		 280 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1887  chorismate mutase-P and prephenate dehydratase  34.56 
 
 		 360 aa  152  4e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000192693  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  33.46 
 
 		 359 aa  153  4e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0656  Prephenate dehydratase  36.53 
 
 		 276 aa  152  4e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.416459  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2608  chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.72 
 
 		 358 aa  152  5e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0180  prephenate dehydratase  34.91 
 
 		 283 aa  152  5e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1263  chorismate mutase  34.21 
 
 		 662 aa  150  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0015659 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1462  prephenate dehydratase  35.66 
 
 		 358 aa  150  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3538  prephenate dehydratase  33.7 
 
 		 284 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0898  prephenate dehydratase / chorismate mutase / phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  34.19 
 
 		 659 aa  149  5e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.983271 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2913  chorismate mutase  33.83 
 
 		 648 aa  148  7e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0862  prephenate dehydratase / chorismate mutase  33.82 
 
 		 368 aa  148  8e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4083  prephenate dehydratase  31.62 
 
 		 284 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0689378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0009  chorismate mutase  31.39 
 
 		 385 aa  148  1.0000000000000001e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1767  prephenate dehydratase  33.33 
 
 		 284 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0567003 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4087  prephenate dehydratase  33.09 
 
 		 290 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2828  prephenate dehydratase / chorismate mutase  33.21 
 
 		 667 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2910  prephenate dehydratase / chorismate mutase  33.21 
 
 		 667 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0018  prephenate dehydratase  33.09 
 
 		 287 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1367  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.21 
 
 		 671 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  31.37 
 
 		 365 aa  147  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3007  chorismate mutase / prephenate dehydratase  33.21 
 
 		 667 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1168  chorismate mutase  33.46 
 
 		 662 aa  146  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  34.3 
 
 		 356 aa  146  3e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3039  chorismate mutase  32.47 
 
 		 355 aa  146  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1341  prephenate dehydratase  33.21 
 
 		 384 aa  147  3e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.409344  normal  0.126516 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1620  prephenate dehydratase  31.72 
 
 		 284 aa  146  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159121  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0474  Prephenate dehydratase  34.3 
 
 		 279 aa  145  5e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0116  chorismate mutase  33.58 
 
 		 377 aa  145  6e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0537  prephenate dehydratase  35.27 
 
 		 279 aa  145  6e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1072  chorismate mutase  32.96 
 
 		 654 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0037  prephenate dehydratase  32.37 
 
 		 287 aa  145  9e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.51728  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0037  prephenate dehydratase  32.37 
 
 		 287 aa  145  9e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.771092  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3428  prephenate dehydratase  31.75 
 
 		 284 aa  144  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0653  prephenate dehydratase  32.22 
 
 		 280 aa  144  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4403  prephenate dehydratase  30.55 
 
 		 284 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1418  chorismate mutase/prephenate dehydratase  30 
 
 		 362 aa  144  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1221  chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.97 
 
 		 391 aa  143  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  30.51 
 
 		 373 aa  143  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3146  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.09 
 
 		 386 aa  143  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.831222  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1133  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.36 
 
 		 386 aa  143  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.898271  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23280  chorismate mutase  31.25 
 
 		 365 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1207  chorismate mutase  32.97 
 
 		 371 aa  143  4e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0297935 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3077  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.55 
 
 		 396 aa  142  6e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0866115  normal  0.0319555 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  30.26 
 
 		 364 aa  142  6e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  30.88 
 
 		 364 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1963  chorismate mutase  30.88 
 
 		 365 aa  142  6e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0495  Prephenate dehydratase  34.31 
 
 		 279 aa  142  6e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2192  chorismate mutase  31.37 
 
 		 355 aa  142  8e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  30.88 
 
 		 364 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2858  chorismate mutase  31.25 
 
 		 373 aa  142  8e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.42066  hitchhiker  0.0000000270068 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  30.88 
 
 		 367 aa  141  9e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1177  chorismate mutase  32.84 
 
 		 659 aa  141  9e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2061  Prephenate dehydratase  32.6 
 
 		 277 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2153  Prephenate dehydratase  32.6 
 
 		 277 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1297  chorismate mutase  32.84 
 
 		 664 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2853  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.8 
 
 		 393 aa  141  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7058  prephenate dehydratase  32.47 
 
 		 286 aa  141  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1809  prephenate dehydratase  32.35 
 
 		 295 aa  141  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.115737 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1264  chorismate mutase  32.84 
 
 		 664 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.728983  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1250  chorismate mutase  30.88 
 
 		 382 aa  141  9.999999999999999e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149804  normal  0.0219371 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1075  chorismate mutase  31.79 
 
 		 386 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  30.51 
 
 		 364 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1220  chorismate mutase  32.84 
 
 		 664 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.950276  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1084  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.79 
 
 		 386 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.165593  hitchhiker  0.00000412255 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02452  hypothetical protein  31.79 
 
 		 386 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.699641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>