More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0764 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0764  prephenate dehydratase  100 
 
 		 280 aa  579  1e-164  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.441795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1513  Prephenate dehydratase  45.99 
 
 		 277 aa  244  9.999999999999999e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.807541 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1937  Chorismate mutase  46.69 
 
 		 274 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0517  prephenate dehydratase  46.84 
 
 		 275 aa  221  9.999999999999999e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.72305  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1056  Prephenate dehydratase  42.86 
 
 		 284 aa  209  4e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07375  putative prefrenate dehydratase  41.2 
 
 		 275 aa  201  9.999999999999999e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1303  prephenate dehydratase  37.36 
 
 		 276 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1437  prephenate dehydratase  37.36 
 
 		 276 aa  182  7e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1547  prephenate dehydratase  36.76 
 
 		 276 aa  179  5.999999999999999e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2043  prephenate dehydratase  32.72 
 
 		 283 aa  149  7e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.64689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3724  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  32.59 
 
 		 632 aa  144  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10160  monofunctional chorismate mutase, clade 2  33.33 
 
 		 403 aa  143  4e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000617885  hitchhiker  0.000000765088 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1644  prephenate dehydratase  34.66 
 
 		 280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2091  Chorismate mutase  30.88 
 
 		 280 aa  130  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.746584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1567  prephenate dehydratase  32.97 
 
 		 271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1293  Prephenate dehydratase  32.74 
 
 		 293 aa  125  6e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.821795  normal  0.378721 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0537  prephenate dehydratase  33.88 
 
 		 279 aa  125  6e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0877  Prephenate dehydratase  33.85 
 
 		 288 aa  125  7e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.33 
 
 		 358 aa  124  1e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1345  prephenate dehydratase  34.19 
 
 		 379 aa  124  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0495  Prephenate dehydratase  32 
 
 		 279 aa  124  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  33.57 
 
 		 356 aa  124  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0541  Prephenate dehydratase  31.64 
 
 		 279 aa  124  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  32.97 
 
 		 358 aa  124  2e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7058  prephenate dehydratase  31.36 
 
 		 286 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0474  Prephenate dehydratase  33.88 
 
 		 279 aa  124  2e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4083  prephenate dehydratase  28.99 
 
 		 284 aa  123  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0689378  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4403  prephenate dehydratase  28.99 
 
 		 284 aa  123  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3538  prephenate dehydratase  33.06 
 
 		 284 aa  122  8e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0656  Prephenate dehydratase  34.43 
 
 		 276 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.416459  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0633  Prephenate dehydratase  32.4 
 
 		 285 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01001  chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.57 
 
 		 392 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  31.6 
 
 		 358 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3428  prephenate dehydratase  28.62 
 
 		 284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_3267  predicted protein  32.5 
 
 		 304 aa  120  3e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4217  prephenate dehydratase  33.47 
 
 		 280 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.239434  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1767  prephenate dehydratase  32.26 
 
 		 284 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0567003 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0783  prephenate dehydratase  31.28 
 
 		 380 aa  118  7.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0018  prephenate dehydratase  29.3 
 
 		 287 aa  118  9e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0235  chorismate mutase/prephenate dehydratase  26.84 
 
 		 391 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0661  P-protein (includes: chorismate mutase and prephenate dehydratase)  28.31 
 
 		 391 aa  118  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.026643  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004398  chorismate mutase I/prephenate dehydratase  28.21 
 
 		 392 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0037  prephenate dehydratase  28.83 
 
 		 287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.51728  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0180  prephenate dehydratase  32.79 
 
 		 283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0037  prephenate dehydratase  28.83 
 
 		 287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.771092  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2951  prephenate dehydratase  31.39 
 
 		 286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.217306 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4087  prephenate dehydratase  29.02 
 
 		 290 aa  116  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3162  prephenate dehydratase  30.11 
 
 		 288 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.309807  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0105  prephenate dehydratase  32.41 
 
 		 265 aa  116  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0102  prephenate dehydratase  28.98 
 
 		 287 aa  115  6e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.29138  normal  0.214423 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0881  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  26.62 
 
 		 385 aa  115  8.999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.304992  normal  0.0807055 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1133  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  27.6 
 
 		 386 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.898271  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2375  chorismate mutase  30 
 
 		 378 aa  112  5e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0252  prephenate dehydratase  31.39 
 
 		 293 aa  112  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396443  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2853  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  26.74 
 
 		 393 aa  112  9e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02488  fused chorismate mutase P/prephenate dehydratase  27.86 
 
 		 386 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.610433  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1075  chorismate mutase  27.86 
 
 		 386 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2756  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  27.86 
 
 		 386 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  8.8068e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3838  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  27.86 
 
 		 386 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000574807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2751  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  27.86 
 
 		 386 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000608431  normal  0.0711319 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01713  chorismate mutase/prephenate dehydratase  25.9 
 
 		 393 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.342812  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1779  prephenate dehydratase  29.74 
 
 		 277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.490374  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02452  hypothetical protein  27.86 
 
 		 386 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.699641  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1084  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  27.86 
 
 		 386 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.165593  hitchhiker  0.00000412255 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2883  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  27.86 
 
 		 386 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0920297  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2986  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  27.86 
 
 		 386 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000154451  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0999  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  27.24 
 
 		 393 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3146  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  27.6 
 
 		 386 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.831222  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2061  Prephenate dehydratase  29.74 
 
 		 277 aa  109  5e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2153  Prephenate dehydratase  29.74 
 
 		 277 aa  109  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2629  prephenate dehydratase  29.93 
 
 		 286 aa  109  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.216997 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  28.78 
 
 		 364 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0793  chorismate mutase  30.22 
 
 		 374 aa  108  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.66734e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  28.57 
 
 		 365 aa  108  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3077  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  26.16 
 
 		 396 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0866115  normal  0.0319555 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1221  chorismate mutase/prephenate dehydratase  27.64 
 
 		 391 aa  107  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  27.9 
 
 		 382 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  28.52 
 
 		 364 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3039  chorismate mutase  29.63 
 
 		 355 aa  107  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0898  prephenate dehydratase / chorismate mutase / phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  26.28 
 
 		 659 aa  107  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.983271 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  28.42 
 
 		 367 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0801  chorismate mutase  32.73 
 
 		 359 aa  106  3e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3356  prephenate dehydratase  29.24 
 
 		 288 aa  107  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.539085  normal  0.173573 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  28.42 
 
 		 364 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0653  prephenate dehydratase  29.24 
 
 		 280 aa  106  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1594  prephenate dehydratase  28.47 
 
 		 311 aa  106  4e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0511  prephenate dehydratase  28.34 
 
 		 284 aa  106  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1988  prephenate dehydratase  28.83 
 
 		 287 aa  106  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.630591  normal  0.549246 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  28.83 
 
 		 359 aa  105  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  28.06 
 
 		 364 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302882 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3355  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  25.9 
 
 		 385 aa  105  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  28.83 
 
 		 359 aa  105  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3482  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  25.9 
 
 		 385 aa  105  7e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.335091 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3218  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  25.9 
 
 		 385 aa  105  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.631051  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0285  prephenate dehydratase  29.03 
 
 		 286 aa  105  8e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.224737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  29.88 
 
 		 371 aa  105  8e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3732  prephenate dehydratase  28.28 
 
 		 286 aa  105  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.755175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0642  prephenate dehydratase  26.81 
 
 		 287 aa  105  9e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0930161  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  28.78 
 
 		 364 aa  105  9e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2861  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  25.18 
 
 		 386 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0154655 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>